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1.
目的:研究混合效应模型(Mixed Effects Model)在肿瘤表达谱基因芯片数据分析中的检验效能,并探讨其分析效果。方法:采用混合效应模型分析肿瘤实例基因芯片数据,并以基因集富集分析方法(GSEA)作为参照比较分析结果的有效性和科学性,探讨其检验效果。结果:通过混合效应模型和基因集富集分析(GSEA)两种方法对肿瘤基因芯片数据的分析和比较,两种方法筛选出共同的差异表达通路外,混合效应模型额外地筛选出来GSEA未能检验到的8条差异表达通路,且得到文献支持;混和效应模型筛选出的前10个差异表达通路中有6个已有生物学证明而基因集富集分析方法(GSEA)筛选出的前10个差异表达通路中仅有4个已有生物学证明。结论:混合效应模型作为top-down方法中的典型代表,其优势在于通过构建潜变量达到降维目的,可有效地减少多个复杂的变异来源从而保证了结果的准确性和科学性,其检验效能优于基因集富集分析方法(GSEA),是一种行之有效的筛选肿瘤基因芯片数据的分析方法。  相似文献   
2.
目的:探讨维生素C(VC)联合替莫唑胺(TMZ)对胶质瘤细胞活力的毒性作用及其机制。方法:在体外条件下培养人胶质瘤细胞BMG-1和SHG44细胞,设对照组(不施加VC与TMZ)、TMZ组(0.2 mmol/L)、VC(0.5 mmol/L)+TMZ(0.2 mmol/L)组,TMZ(0.2 mmol/L TMZ)+U0126(10 μmol/L)组,每组实验重复3次。采用MTT实验检测细胞生存率;流式细胞术和Annexin V-FITC/PI染色检测细胞凋亡情况; ROS检测试剂盒检测活性氧簇(ROS)水平, Western blot检测与凋亡、自噬及ERK通路相关蛋白的表达。结果:与对照组比较,TMZ组胶质瘤细胞的存活率显著下降(P<0.05)。与TMZ组比较,VC+TMZ组胶质细胞瘤细胞的存活率显著下降(P<0.01),VC+TMZ组中细胞凋亡率显著升高,且Bax、Cleaved caspase-3及Cleaved PARP蛋白表达显著增加,Bcl-2表达显著降低,而ROS水平及细胞自噬率显著降低,LC3-II/LC3-1表达显著降低,p62表达显著增加(P均<0.05)。同时,联用可降低BMG-1和SHG44细胞中的p-ERK1/2相关蛋白的表达水平,且提高细胞凋亡率(P均<0.05)。结论:VC联合TMZ能够增强对胶质瘤细胞的毒性,而这一作用是通过ERK信号通路来促进细胞凋亡并抑制替莫唑胺所介导的自噬作用。  相似文献   
3.
摘要 目的:探讨烟酰胺经调控p38MAPK信号通路对高血压脑出血大鼠的脑保护作用机制。方法:选择48只SD大鼠,随机选择12只作为假手术组,其余36只进行高血压脑出血造模,对比4组大鼠的血肿体积、左扭转比率、神经功能变化、出血脑组织p-p38MAPK、p38MAPK蛋白表达、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸、凋亡诱导因子含量及脑组织含水量。结果:与模型组相比,尼莫地平组、烟酰胺组的血肿体积明显缩小;与烟酰胺组相比,尼莫地平组的血肿体积明显缩小(P<0.05);与干预前相比,干预后烟酰胺组、尼莫地平组的血肿体积明显缩小,模型组的血肿体积明显增多(P<0.05)。与模型组相比,假手术组、尼莫地平组、烟酰胺组的向左扭转比率、p-p38MAPK/p38MAPK、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸明显较高,脑组织含水量、凋亡诱导因子含量明显较低;与烟酰胺组相比,尼莫地平组、假手术组的左扭转比率、p-p38MAPK/p38MAPK、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸明显较高,脑组织含水量、凋亡诱导因子含量明显较低;与尼莫地平组相比,假手术组的左扭转比率、p-p38MAPK/p38MAPK、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸明显较高,脑组织含水量、凋亡诱导因子含量明显较低(P<0.05)。结论:在高血压脑出血大鼠中,p38MAPK介导的细胞凋亡途径会加剧高血压脑出血的脑损伤,烟酰胺会经过抑制p38MAPK信号通路减轻高血压脑出血后的脑损伤。  相似文献   
4.
目的:观察分析beta-catenin 基因在人骨肉瘤MG63 细胞系的表达变化。方法:培养MG63 细胞株,用不同浓度的Wnt3a 蛋白或 相同浓度、不同时间段的Wnt3a 蛋白刺激液MG63细胞生长,用FQ-PCR在mRNA 水平检测beta-catenin 在MG63 细胞系的表达 变化。培养MG63 细胞株,用相同浓度的Wnt3a 蛋白刺激,比较刺激组与空白对照组的细胞数目的差别。结果:在细胞生长的第 0,1 天两组的MG63 细胞数量对比没有统计学差异(P>0.05);而在第2,3,4 天对照组细胞增殖速度较刺激组缓缓,经比较(t=4. 109,3.892,5.215,均P<0.05)。beta-catenin 基因表达不会因为Wnt3a 的浓度增加而增加。100 ng/mL的Wnt3a 蛋白刺激beta-catenin 基 因表达最高,其他几个浓度的beta-catenin 基因表达对比没有统计学差异(P>0.05)。在100 ng/mL的Wnt3a蛋白刺激下,beta-catenin 基 因表达会随时间延长而增加,6 h时茁-catenin基因表达最高(P<0.05),随后茁-catenin基因表达则没有统计学差异(P>0.005)。结 论:Wnt蛋白对MG63 细胞有正向增加增殖作用。激活Wnt/beta-catenin 信号通路能促进MG63 的细胞增殖。  相似文献   
5.
目的探讨硝酸咪康唑联合妇炎消生物敷料栓对妊娠期阴道假丝酵母菌病患者的疗效及对阴道微生态的影响。方法选取2017年3月至2019年3月在西安医学院第二附属医院产科就诊的96例妊娠期阴道假丝酵母菌病患者为研究对象,采用随机数字表法分为观察组和对照组,每组各48例。对照组患者给予妇炎消生物敷料栓,阴道给药,1枚/d。观察组患者在对照组基础上加用硝酸咪康唑栓,阴道给药,1枚/d,两组均为7 d一个疗程。比较两组患者的临床疗效,阴道微生态情况和母婴结局。结果治疗后观察组患者总有效率(91.67%)明显高于对照组(70.83%),差异有统计学意义(χ~2=6.838,P=0.009)。治疗后,观察组患者阴道pH、菌群多样性Ⅱ~Ⅲ级比例高于对照组,差异有统计学意义(χ~2=4.042、4.002,P=0.044、0.045);而两组患者阴道菌群密集度Ⅱ~Ⅲ级比例、乳杆菌占优势比例差异无统计学意义(χ~2=0.889、0.211,P=0.346、0.646)。观察组患者产褥感染、胎膜早破、早产发生率均低于对照组。两组患者胎儿窘迫和新生儿黄疸发生率比较差异无统计学意义(χ~2=0.154、3.010,P=0.695、0.083)。结论硝酸咪康唑联合妇炎消生物敷料栓对妊娠期阴道假丝酵母菌病患者的临床疗效显著,可促进患者阴道微生态的恢复,改善母婴结局。  相似文献   
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