非培养方法解析北京地区甘薯叶际细菌的群落结构

利用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术和磷脂脂肪酸(PLFA)分析方法,比较了北京通州、顺义、昌平、延庆地区甘薯叶际细菌的多样性和生物量,并调查了通州地区甘薯叶际细菌群落在不同生长季节的变化情况。PLFA分析结果发现所有检测样品中,革兰氏阳性细菌生物量均高于革兰氏阴性细菌生物量。PCR-DGGE方法与PLFA方法聚类分析结果较一致,甘薯叶际细菌群落结构受到时空因素、甘薯生理特性等的影响,不同地点、不同生长季节甘薯叶际细菌群落结构有较大差异,DGGE条带测序分析表明,Pseudomonas sp.在不同地点的甘薯叶际均为保守菌群,Bacillus sp.,Acinetobacter sp.,     

基于碳代谢指纹解析重庆彭水烟田土壤可培微生物群落演替研究

烟草青枯病为土传病害,病原菌可在土壤中存活较长时间。本文采用含有i-赤藓糖醇、α-环式糊精等15种碳源的培养板,培养青枯病长期高发病烟田土壤样品与不发病烟田土壤样品,寻找青枯病发生土壤碳源代谢特点,研究代谢结构差异。结果表明:重庆彭水白果坪常发病烟田与樱桃井未发病烟田土壤中微生物均具有较强L-苏氨酸,L-苯丙氨酸,D-纤维二糖利用能力。土壤微生物群落在指数培养期数据适合应用于做聚类分析,以指数生长期72 h数据做聚类分析时,2015年的样品聚类在一个大类中,不同时间的样品首先分离,相同时间不同地点的样品后分离,这些样品均为同一年的烟草根系土壤,聚为一大类,2014年试验聚类结果规律不明显,采用已有碳源数据均不能将两类土壤区分开来,实验数据表明重庆彭水白果坪常发病烟田与樱桃井未发病烟田土壤中微生物碳源代谢能力差别不显著,受时间影响因素更大。重庆彭水樱桃井烟田中某些微生物替代了白果坪常发病烟田土壤青枯菌的碳源代谢生态位,进而具有竞争抑制青枯菌繁殖的潜力,本结论的科学性需要进一步研究。