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染色质转座酶可及性测序(assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing,ATAC-seq)是利用Tn5转座酶研究染色质可及性的高通量测序技术。ATAC-seq可以在全基因组范围内绘制染色质可及性图谱,揭示转录因子结合位点以及核小体的位置。在医学领域,ATAC-seq技术是研究重大疾病发病机制、药物作用机制、新药研发和生物标志物功能等的新一代有力工具。本文对ATAC-seq技术的优势及其在复杂疾病研究中的应用和前景进行了综述,以期为人类复杂疾病基因表达调控机制等相关研究的开展提供借鉴与参考。 相似文献
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以甜瓜抗病资源PI511890和感病自交系‘白皮脆’及其F1、BC1P1、BC1P2、F2群体为材料,苗期接种蔓枯病菌(Did ymella bryoniae)进行遗传分析.结果表明:(1)对甜瓜苗期蔓枯病菌接种鉴定结果显示,抗源PI511890的抗病基因Gsb-3由显性单基因控制.(2)利用集团分离分析及ISSR分析技术,引物ISSR-100扩增出的多态性条带与Gsb-3表现连锁关系,该多态性片段大小为900 bp.(3)统计ISSR-100在182个F2单株上的多态性,并用JoinMap 4.0软件分析结果显示,ISSR-100与Gsb-3遗传连锁距离为8.3 cM,定名为ISSR-100900.研究认为,ISSR100900可作为甜瓜抗蔓枯病分子育种的备选分子标记. 相似文献
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焦磷酸测序(pyrosequencing)技术是一种新的DNA序列分析技术,其特点是操作简便、大通量、自动化,适合大量样本的快速检测,无须进行电泳、DNA序列无须荧光标记等,是一个理想的遗传分析技术平台.文章对焦磷酸测序技术原理及近年来在单核苷酸多态性研究、微生物鉴定分型和DNA甲基化等方面的应用作一简要综述. 相似文献
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氮肥施用量对设施番茄氮素利用及土壤NO3--N累积的影响 总被引:2,自引:0,他引:2
在宁夏引黄灌区滴灌条件下,以温棚番茄为研究对象,采用田间试验与室内分析的方法,研究不同施氮量对番茄产量、氮素利用率及土壤NO3--N残留的影响,并对土壤-番茄体系的氮平衡进行了表观评估。试验结果表明:2004年秋冬茬番茄,施用氮肥显著增加了当茬番茄果实、植株产量 (增产幅度19.9%~29.6%)及地上部总吸氮量(204~232.6 kg/hm2)。2005年冬春茬番茄,与空白处理产量相比(106 kg/hm2)只有N200处理的果实增产达显著水平(120 kg/hm2)。两季番茄的氮肥利用率都随氮肥施用量的增加而明显降低(3.3%~10.9%)。2004年秋冬茬番茄收获后,表层0~30 cm的NO3--N大量累积(200~650 kg/hm2),其累积量随施氮量增加呈增加的趋势,经过2005年冬春茬番茄种植后,上茬0~30 cm土层NO3--N向下有淋失的趋势,淋失层次主要在90 cm以上的土体(250~380 kg/hm2)。综合考虑番茄果实产量、氮肥利用率及土壤NO3--N残留等因素,秋冬茬番茄推荐氮肥用量在100~200 kg/hm2和适量的磷钾肥配施为当茬氮肥优化管理处理。而冬春茬番茄氮肥推荐在200~400kg/ hm2 范围可以满足当茬番茄对氮肥的需求。 相似文献
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哺乳类凋亡细胞表达乙酰胆碱酯酶(AChE)的研究介绍 总被引:3,自引:0,他引:3
线虫和哺乳类参与调节细胞调亡的基因家族分别是ced-3/caspase、ced-4/apafl和ced-9/bcf-2。目前发现Caspase家族有10个成员,其基因产物是半脱氨酸蛋白酶类问。Caspase家族是决定细胞凋亡的关键,被称为细胞凋亡的刽子手(executioner)[2]。核酸内切酶也参与了细胞凋亡过程[3]。然而,酯酶是否参与了细胞调亡报道很少。我们在国际上首先发现哺乳类调亡细胞表达带恳亲水型AChE,并且不同的动物间具有很好的保守性[4]。1凋亡小体中AChE活性现象的初次发现1995年9月至1996年9月为了对Han和Caen提出的内皮细胞和巨核细胞是否… 相似文献
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乙酰胆碱酯酶(AChE)与β淀粉样肽(Aβ)的相互关系 总被引:7,自引:0,他引:7
老年性痴呆症(Alzheimer‘s Disease,AD)是一种慢性的、进行性的神经系统退行性疾病。主要特征为各方面智力的损伤,包括学习记忆、语言、读写、行为,以及对周围环境的识别,最终可导致死亡。它有三大病理特征:(1)主要由β淀粉样肽(β—amyloid peptide,Aβ)沉积而成的淀粉样斑;(2)由高度磷酸化的Tau蛋白组成的神经纤维缠结;(3)神经元及神经突触的丢失。在AD疾病的发病机制及治疗的对策中,AD和乙酰胆碱酯酶(acetylcholinesterase,AChE)都有重要的作用。近年来对Aβ和AChE在AD疾病发生发展过程中相互作用的研究有了越来越多的报道。在此,作者对Aβ和AChE的关系作一综述。 相似文献
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本实验旨在构建雪莲类PEBP基因原核表达载体,在大肠杆菌中表达并纯化类PEBP基因所编码的蛋白,为进一步研究奠定基础.将雪莲类PEBP基因开放阅读框序列克隆到原核表达载体pET30( )上,转化感受态表达菌株BL21(DE3),低浓度IPTG低温诱导融合蛋白的表达,纯化产物,Western blotting鉴定目的蛋白.IFTG低诱导PEBP,经SDS-PAGE分析,其相对分子量约为28 kD,与预期相符,表达量约占菌体蛋白的26.8%,并且通过亲和层析纯化了重组融合蛋白,Western blotting鉴定为阳性.成功构建了原核表达载体pET-PEBP,获得了高效表达产物,并为进一步研究雪莲类PEBP基因的抗冻功能打下基础. 相似文献
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摘要: 文中建立了一种新型的寡核苷酸芯片, 用于线粒体脑肌病伴高乳酸血症和卒中样发作(Mitochondrial encephalomyopathy with lactic acidosis and stroke-like episodes, MELAS)和肌阵挛性癫痫伴发不规整红纤维(Myoclonic epilepsy with ragged red fibers, MERRF)线粒体DNA所有已知突变位点的集成检测。将31对allele位点特异性的寡核苷酸探针包被在醛基修饰的载玻片表面, 以多重不对称PCR方法制备Cy5荧光标记靶基因。利用此芯片对5例MELAS患者、5例MERRF患者及20例健康对照进行筛查, 结果发现, MELAS患者均为MT-T1基因A3243G突变; 在MERRF患者组, MT-TK基因A8344G突变4例, T8356C突变1例; 健康对照组均未发现31种相关mtDNA突变。芯片检测与DNA测序结果完全一致。结果表明, 这种寡核苷酸芯片可以对MELAS和MERRF综合征已知突变位点进行同步快速检测, 具有较高的灵敏度和特异性。这一模式的基因芯片经过适当改装后也可用于其他人类线粒体疾病的基因诊断。 相似文献
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为了解性传播疾病(SexuallyTransmittedDiseasesSTD)对家庭内传播的影响,用多聚酶链反应(PCR)等方法检测了94对夫妻和其中15户家庭中16名子女的STD病原体NG、CT、UU、HPV、梅毒螺旋体和白色念珠菌。结果表明:男性不洁性史为68.15%而女性为4.26%,两者间有显著差异(P<0.01),但其发病率无统计上显著差异(男76.60%、女73.40%)。STD感染以CT感染最高,达44.68%,NG感染为31.91%,HPV感染是15.96%,未检出梅毒和HSV感染。患者中两种及以上病原感染过35.11%。56.25%的子女STD感染系其患STD父母传染的。这提示如果夫妻任何一方检出有STD感染,另一方须做系统监测与咨询,以便及时采取治疗和预防措施并避免子女受到感染。 相似文献