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991.
992.
单核苷酸多态性检测方法的研究进展 总被引:2,自引:0,他引:2
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)作为第三代遗传标记已经广泛应用于基因作图、疾病相关性分析、群体遗传学及药物研究等领域.因此建立高度自动化和高通量的SNP检测分析技术十分重要.简要介绍了国内外几种主要SNP检测技术的原理和检测分析手段,并对SNP高通量检测技术的发展进行了展望. 相似文献
993.
菜薹种质内不同大小群体间遗传多样性的RAPD鉴定和比较 总被引:2,自引:0,他引:2
为了了解莱薹种质内的遗传多样性,确定适宜的更新群体,从一份菜薹地方品种的200株群体中随机抽取10、15、20、25、30、35和40株组成不同的群体,利用RAPD技术分析各自的多态位点数、计算多态位点百分率、遗传多样性指数和缺失位点数.通过对各参数的比较结果表明,该种质内单株间的遗传差异较大,大于30株的群体能代表200株群体的遗传多样性.在满足其完全随机交配的前提下,可视为更新的有效群体.根据更新时繁种群体应为有效群体2倍的原则,认为不小于60株的群体为莱薹种质更新比较适宜的群体. 相似文献
994.
菜薹种质内不同大小群体问遗传多样性的RAPD鉴定和比较 总被引:2,自引:0,他引:2
为了了解菜薹种质内的遗传多样性,确定适宜的更新群体,从一份菜薹地方品种的200株群体中随机抽取10、15、20、25、30、35和.40株组成不同的群体,利用RAPD技术分析各自的多态位点数、计算多态位点百分率、遗传多样性指数和缺失位点数。通过对各参数的比较结果表明,该种质内单株间的遗传差异较大,大于30株的群体能代表200株群体的遗传多样性。在满足其完全随机交配的前提下,可视为更新的有效群体。根据更新时繁种群体应为有效群体2倍的原则,认为不小于60株的群体为菜薹种质更新比较适宜的群体。 相似文献
995.
利用重组自交系群体检测水稻条纹叶枯病抗性基因及QTL分析 总被引:32,自引:0,他引:32
利用81个株系组成的Kinmaze(japonica)/DV85(indica)重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体,采用苗期强迫饲毒的鉴定方法,以病情指数作为条纹叶枯病的表型值,鉴定亲本及81个RILs对水稻抗条纹叶枯病毒(rice stripe virus,RSV)的抗性。利用QTL Cartographer软件,对水稻条纹叶枯病抗性基因进行检测分析。检测到3个QTL位点:qStv1、qStv7、qStv11分别位于第1、7、11染色体上,各QTL的LOD值为2.44~3.83,贡献率为19.8%~30.9%。根据抗性基因加性效应的方向,在qStv7、qStv11位点上,亲本DV85存在抗条纹叶枯病增效基因,Kinmaze具有抗条纹叶枯病减效基因,而qStv1位点抗性基因效应来源正好相反。 相似文献
996.
等位基因多态性群体遗传结构的多元非线性分析方法 总被引:4,自引:0,他引:4
长期以来,对于多维基因多态性数据的多元统计分析,如计算遗传距离时昕用的聚类分析、分析群体遗传结构时所用的主成分分析、因子分析和典型相关分析等,一直应用为无约束条件数据而设计的经典多元线性分析方法,并没有注意基因多态性数据的“闭合效应”所带来的问题。从分析基因多态性数据的分布和结构特征入手,文中指出了基因多态性分布具有“闭合数据”的特点,分析了由于“闭合效应”的影响,经典多元线性方法用于群体遗传结构分析昕面临的困难。根据成分数据统计分析的理论和方法,提出了基因多态性群体遗传结构的多元非线性分析基本方法。并以主成分分析为例,通过实例比较和分析了经典线性主成分分析和“对数比”非线性主成分分析的结果,证明“对数比”非线性主成分分析方法是研究基因多态性群体遗传结构的良好方法,具有特异、灵敏等优点,其结果符合群体遗传学规律。 相似文献
997.
利用杉木的F1代群体构建遗传连锁图谱 总被引:6,自引:0,他引:6
对于杉木 1∶1分离的分子标记位点 ,提出了一种新的构建遗传连锁图谱的策略。通过二点连锁分析 ,任意两个位点的连锁相和重组率可以得到推断和估计。对于一个连锁群中的最优排序 ,采用隐马尔可夫链模型的方法进行多位点的连锁分析。该作图方法比通常林木上所用的“拟测交”作图方法更有效。采用该作图策略 ,利用句容0号无性系 (♀ )×柔叶杉 (♂ )的F1代群体的AFLP分子标记数据重建了句容 0号无性系和柔叶杉的遗传连锁图谱。在句容 0号无性系的连锁图谱中 ,有 10 1个标记分布在 11个连锁群上 ,图谱的总长度为 2 2 82 6cM ,平均图距为 2 2 6cM ,单个连锁群上最多含有 17个标记 ,最少含有 5个标记 ;在柔叶杉的连锁图谱中 ,有 94个标记分布在 11个连锁群上 ,图谱的总长度为 2 5 6 5 8cM ,平均图距为 2 7 3cM ,单个连锁群上最多含有 16个标记 ,最少含有 4个标记。构建的句容 0号无性系和柔叶杉的遗传连锁图谱比原有的图谱分别增加了 2 6个标记和 2 8个标记 ,双亲的图谱共增加了 5 4个AFLP标记 ,使图谱上的分子标记总数达到 195个 ,双亲遗传图谱的跨度均超过了 2 0 0 0cM ,基本上达到了杉木基因组的长度 ,图谱的覆盖率接近于 10 0 %。利用新的作图方法可以较大提高分子标记在图谱上的分辨率 ,得到可认为是 相似文献
998.
欧洲刺槐种源群体遗传结构和多样性 总被引:11,自引:1,他引:10
对来自欧洲和美国的 18个刺槐种源子代进行了等位酶分析。可进行遗传分析的 7个酶系统 (Amy,Fe,L ap,Idh,Mdh,6 Pgd,Skd)中有 14个基因位点 ,其中 12个位点具有多态性。每个多态位点平均等位基因数 (A/L )变化在 1.5 6~ 3.6 7之间 ,平均基因型数 (G/L)变化在 1.6 1~ 7.11之间 ,平均等位基因有效数目 (Ae)变化在 1.0 2~ 2 .5 0之间 ,预期杂合度 (H e)变化在0 .0 2~ 0 .5 6之间。不同种源群体之间也存在较大的遗传差异 ,在 8个德国种源中 ,各群体的 A、Ae、和 H e等相对较小 ,但不同群体间差异较大。各位点等位基因频率在不同种源群体间变化也较大 ,表明德国各种源群体内遗传变异相对较小 ,但群体间差异较大。来自匈牙利和斯洛伐克的 8个种源群则相反 ,各群体的 A、Ae、和 H e等相对较大 ,而不同种源群体间差异则较小 ,各位点等位基因频率在种源群体间变化相对一致 ,表明这两个国家的种源群体内变异较大 ,但不同种源群体间差异较小。欧洲的刺槐种源并未形成明显的地理变异模式 ,而且欧洲的种源和来自原产地的美国种源相比 ,没有发现明显的差异。经过 Hardy-Weinberg平衡检测证明 ,88.4 1%位点符合 H- W遗传平衡 ,表明各群体基因频率和基因型频率保持较高的稳定性 ,且种源内的变异大于种源间变异 ,94 . 相似文献
999.
Quomm sensing(QS)是近来受到广泛关注的一种细菌群体行为调控机制.由于不少人体或植物病原菌的发病机制受QS机制的调控,很多细菌代谢产物也受到该机制的控制,QS系统已成为医学、生物工程学等多领域的研究热点,在QS的调控过程中,细菌分泌一种或多种自诱导剂(autoinducer,也称信息素pheromone),然后通过感应 相似文献
1000.
利用了Tα1小麦(Ms2)创建改良小麦面包品质的优质群体,采用SDS—PAGE法对其2次互交轮回群C2的HMW—GS组成进行了分析。结果表明:在供试的193个样品中各HMW—GS及其组成模式的频率不尽相同,Glu—A1、Glu—Bl和Glu—Dl位点上产生频率最高的亚基分别是1、14 15和2 12,各为54.40%、35.75%和60.10%,优质亚基5 10的频率为17.6%;“null、14 15、2 12”模式产生频率最高,为13.47%,并有“14 15,5 10”的优质亚基聚合体出现,占5.2%;该群体也产生了亲本不具有的13、16、22亚基及19种新的HMW—GS组成模式。说明利用Tα1小麦轮回选择技术是创造新亚基类型的一个有效途径。 相似文献