CBSG-PPI:基于图神经网络的蛋白质-蛋白质相互作用的预测算法

为提高蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)预测的准确性,并深入探索细胞信号传导和疾病发生的生物学机制,本文提出一种简称为CBSG-PPI的预测算法。该算法首先利用3层前馈网络来处理蛋白质的k-mer特征,采用CT方法和Bert方法提取蛋白质的氨基酸序列以及使用卷积神经网络提取蛋白质的序列特征,再结合图神经网络和多层感知机来准确预测PPI。与现有的预测技术相比,CBSG-PPI在准确率、 F1分数、召回率和精确率等多个关键性能指标上展现了明显的优势,在公开数据集上分别达到了0.855、 0.853、 0.840和0.866的高分。此外,本算法采用了一种改进的参数调整方法,显著提高了计算效率,其预测速度比传统算法快了约140倍。这一显著的性能提升,不仅证实了CBSG-PPI在预测PPI方面的研究价值,也为未来蛋白质间相互作用网络的构建和分析提供了有用的计算工具。     

从古到今话高粱

正中国的高粱栽培至少有两千年历史。古人种高粱主要是为了食用,后来,高粱的用途逐渐增多,并出现食用、酒用、糖用、饲用、帚用等不同品种类型。在长期的种植过程中,中国农民积累了丰富的高粱栽培和利用经验。高粱也因其抗逆性出色、生命力顽强等独特品格,而被人们赋予一定的文化意     

青藏高原人体脉搏测量及几种脉图对比分析

脉搏信息反映人体内部各器官的健康状况,利用PVDF压力传感器并垫一水囊间接接触法拾取脉搏信息,通过调理放大硬件电路对脉搏信号进行调理放大,借助虚拟仪器软件LabVIEW在PC机上架构虚拟脉搏测试系统,测试并采集了青藏高原地区大量不同人群的脉搏信息数据,给出了几种具有地域特征的脉图,并结合中医脉诊理论进行了对比分析。     

能谱CT动态增强后单能量CT值、能谱曲线形态及斜率在肾上腺腺瘤与非腺瘤诊断中的应用初探

目的:研究能谱CT动态增强后肾上腺肿瘤单能量CT值、能谱曲线形态及斜率差异的临床价值。方法:应用能谱分析软件处理腺瘤(45个)与非腺瘤(20个)CT动态增强资料,均经手术病理和/或临床资料证实。分别测量腺瘤与非腺瘤在28 s、60 s、180 s时间点的11个单能量点(40~140ke V)CT值、记录能谱曲线形态并计算其低能量段(40~100 ke V)的斜率。结果:在各个时间点,腺瘤与非腺瘤各单能量点CT值差异无统计学意义(P0.05),能谱曲线形态为速降形、缓降形、近似直线形、勺形及弓形五种(p0.05)。在60 s,二者能谱曲线斜率差异有统计学意义(P0.05),而在28 s与180 s,差异无统计学意义(P0.05)。结论:能谱CT动态增强后肾上腺腺瘤与非腺瘤能谱曲线形态及在60 s时低能量段能谱曲线斜率存在差异,可能有助于二者鉴别。     

基于汤液经法图的“酸焦苦甘法”刍议

简述汤液经法图的构图大意,并运用此图对"酸焦苦甘法"的配伍用药法则进行探讨研究,以此说明"补用酸药,助用焦苦药,调用甘味药"是治疗肝虚证的用药大法。     

甘蓝分子连锁图的构建与品质性状的QTL定位

以两个不同生态型甘蓝(Brassica oleracea var．capitata)品种杂交得到的F2代为作图群体,用RAPD标记构建甘蓝分子连锁图。通过对520个随机引物进行筛选,236个引物在两亲本间表现多态性,多态性比例为47．7％。选取111个引物对群体进行分析,构建了一张含有135个标记位点,9个连锁群,覆盖长度为1023．7cM的分子连锁图。利用该图谱对甘蓝叶球紧实度和中心柱长两性状进行了QTL定位分析。检测到3个与叶球紧实度相关的QTL,总贡献率为62．5％;检测到4个与中心柱长相关的QTL,总贡献率为59．1％。     

rUreB亚单位疫苗中试产品的纯度检测和肽图分析

分析重组幽门螺杆菌尿素酶B亚单位疫苗 (rUreB)中试产品的纯度 ,制备肽指纹图 ,证明rUreB三批中试产品在一级结构上的一致性和生产工艺稳定性。利用面积归一法检测产品的纯度 ,在非还原条件下用TPCK处理过的胰蛋白酶水解 3批中试产品 ,用反相HPLC制备分析肽图。结果显示 ,rUreB的 3批中试产品的纯度达到中试质量要求和肽图分析要求 ,3批中试产品的肽指纹图基本一致 ,重现性好。     

一类Julia分形图及其计算机构造

分形理论及其构造方法的研究目前已吸引了包括生物数学家在内的众多领域学者的关注。本文讨论了一类有理函数映射下的Julia分形集的性质,以及构造这类分形集的广义割线方法,并证明了该方法的收敛性,分析并讨论了所构造的新一类分形图谱的特点,并进一步支持了算法的有效性。