织金洞钟乳石沉积物表面可培养细菌多样性和网络分析

【背景】洞穴环境中蕴含丰富而独特的细菌资源,对洞穴环境中细菌的分离培养有助于了解洞穴细菌多样性及细菌资源的挖掘和利用。【目的】利用不同培养基分离细菌,探究钟乳石表面可培养细菌的多样性及其种间互作关系。【方法】通过11种培养基对织金洞内钟乳石沉积物表面的细菌进行分离纯化,并利用16S rRNA基因序列分析初步确定分离菌株的分类地位。在R软件下,通过Bipartite包分析可培养细菌属间的相互作用。【结果】从钟乳石沉积物表面共分离出206株细菌,它们隶属于4门25属45种,香农(Shannon)指数为4.78,辛普森(Simpson)指数为0.95。变形菌门(Proteobacteria)和芽孢杆菌属(Bacillus)分别为样品中可培养细菌的优势门(47.09%)和优势属(29.61%)。无机寡营养培养基有助于洞穴钟乳石沉积物细菌的分离。属水平-采样点网络分析表明,可培养细菌分布具有非随机、显著的嵌套性。芽孢杆菌属(Bacillus)、德沃斯氏菌属(Devosia)、产碱杆菌属(Alcaligenes)、节杆菌属(Arthrobacter)和短杆菌属(Brevibacterium)在细菌群落中存在较多的有效合作值(Effective Partners)和亲密度(Closeness),被其他细菌所依赖程度(Species Strength)较高,是该群落中的重要组成类群。【结论】织金洞内钟乳石沉积物表面存在丰富的细菌资源,分析细菌类群在群落中的作用应结合细菌相对丰度和网络分析。     

西双版纳传统利用的野生药食两用植物

2010年3月至2011年7月对西双版纳少数民族传统利用的药食两用植物进行民族植物学调查,通过访谈和野外调查工作,收集并记录了关于当地社区传统利用药食两用植物的传统知识以及其他相关信息,并选择了其中20种植物进行抗菌活性的筛选。共调查统计了43科95种西双版纳传统利用的药食两用植物,从分类学角度来看,以茄科（6种）和唇形科（6种）最多,其中草本植物占了最大比例,为49．5％。对其中20种植物的抗菌活性筛选结果显示,只有马蓝（Baphicacanthus cusia）和旋花茄（Sola-humspirale）对金黄色葡萄球菌有抑菌活性。从调查中可以看出：药食两用植物的利用在当地人的日常生活中仍占有相当重要的分量。但随着近年来经济快速发展导致的传统知识的急剧流失和森林的大面积砍伐,很多植物已经逐渐从人们的生活中淡出．如何保护这些传统知识并使其能够可持续发展下去是一个值得思考的问题。     

西双版纳传统利用的野生药食两用植物

2010年3月至2011年7月对西双版纳少数民族传统利用的药食两用植物进行民族植物学调查,通过访谈和野外调查工作, 收集并记录了关于当地社区传统利用药食两用植物的传统知识以及其他相关信息,并选择了其中20种植物进行抗菌活性的筛选。共调查统计了43科95种西双版纳传统利用的药食两用植物,从分类学角度来看,以茄科（6种）和唇形科（6种）最多,其中草本植物占了最大比例,为495%。对其中20种植物的抗菌活性筛选结果显示,只有马蓝（Baphicacanthus cusia）和旋花茄（Solanum spirale）对金黄色葡萄球菌有抑菌活性。从调查中可以看出：药食两用植物的利用在当地人的日常生活中仍占有相当重要的分量。但随着近年来经济快速发展导致的传统知识的急剧流失和森林的大面积砍伐,很多植物已经逐渐从人们的生活中淡出,如何保护这些传统知识并使其能够可持续发展下去是一个值得思考的问题。     

rUreB亚单位疫苗中试产品的纯度检测和肽图分析

分析重组幽门螺杆菌尿素酶B亚单位疫苗 (rUreB)中试产品的纯度 ,制备肽指纹图 ,证明rUreB三批中试产品在一级结构上的一致性和生产工艺稳定性。利用面积归一法检测产品的纯度 ,在非还原条件下用TPCK处理过的胰蛋白酶水解 3批中试产品 ,用反相HPLC制备分析肽图。结果显示 ,rUreB的 3批中试产品的纯度达到中试质量要求和肽图分析要求 ,3批中试产品的肽指纹图基本一致 ,重现性好。     

人幽门螺杆菌蒙古沙鼠适应性定植相关蛋白表达差异的研究

幽门螺杆菌 (Helicobacterpylori,Hp)是人类慢性活动性胃炎和消化溃疡的重要原因 ,与胃癌和胃淋巴样组织淋巴瘤的发生也极度相关。目前人类对其生物学特点、致病机制及其与宿主的关系等方面均尚未完全阐明。随着对Hp在分子水平上的研究不断深入 ,人们发现Hp较其它细菌表现出更高的生物多样性 ,提示该菌面对复杂的定居环境 ,具有高度的变异性和独特的适应性机制。Hp全基因组测序工作的完成 ,为深入研究Hp提供了良好的条件 ,也为后续的蛋白质组学研究打下了坚实的基础。近几年 ,国内外研究者采用蛋白质组学技术相继在Hp的遗传变异、生理、…     

单羽火筒树化学成分研究

采用色谱柱层析及半制备高效液相色谱的分离方法,以及质谱和核磁共振波谱的鉴定方法,从云南省德宏市民间利用的抗肿瘤药用植物单羽火筒树(九节狸)全株中分离、鉴定出了11个化合物,即山柰酚(1)、山萘酚-3-O-α-L-吡喃鼠李糖苷(2)、槲皮素(3)、异槲皮苷(4)、槲皮素-3-O-α-L-吡喃鼠李糖苷(5)、杨梅素(6)、杨梅素-3-O-α-L-吡喃鼠李糖苷(7)、Europetin(8)、Europetin 3-O-α-L-rhamnopyranoside(9)、(-)-儿茶素(10)和山楂酸(11)。采用MTS法测试了乙酸乙酯部位及11个化合物对5种肿瘤细胞株的体外细胞毒活性,结果表明单羽火筒树乙酸乙酯部位对人白血病HL-60细胞(IC_(50)=21.76μg/mL)、人肝癌SMMC-7721细胞(IC_(50)=17.04μg/mL)和人肺癌A-549细胞株(IC_(50)=18.00μg/mL)的生长有抑制活性,从乙酸乙酯部位分离出来的化合物1对肝癌细胞株(SMMC-7721)的生长有抑制活性(IC_(50)=27.61μg/mL)。     

云南主要木本生物柴油原料植物的综合评价

选用含油量、油脂成分、结实性状、分布范围和繁殖性状作为评价指标,运用灰色关联度分析法对云南分布的、可作为生物柴油原料的188种主要木本油料植物（含油量≥30%）进行了综合评价。结果表明：滇新樟(Neocinnamomum caudatum)、西南红山茶(Camellia pitardii)等29种木本油料植物与理想种的关联度均超过0.6500,具有良好的综合性状,可以在研究开发的基础上作为云南生物柴油产业的原料植物来推广应用。此外,脉叶虎皮楠(Daphniphyllum paxianum)、牛紏吴萸(Evodia trichotoma)、长梗大花漆(Toxicodendron grangiflorum var. longipes)是这次新发现的3种具有开发潜力的木本生物柴油原料植物。     

二苯乙烯苷对脑缺血再灌注沙鼠脑内p53、Bcl-2、Bax表达的影响

目的探讨二苯乙烯苷(tetrahydroxystilbene glucoside,TSG)对沙鼠脑缺血/再灌注(ischemia/reperfusion,I/R)神经元损伤保护作用的机制。方法将42只沙鼠随机分成6组,脑I/R模型对照组(I/R)、假手术(Sham)组、TSG小剂量(1.5mg/kg)组、TSG中剂量(3mg/kg)组、TSG大剂量(6mg/kg)组以及阳性药依达拉奉对照组(3 mg/kg);6d后HE染色观察脑组织形态学改变,免疫组织化学法检测脑组织p53的表达,Western blot法检测海马CA1区Bcl-2、Bax的表达。结果与假手术组相比,I/R组脑组织中p53阳性细胞数显著增多,海马CA1区Bax水平显著增加,Bcl-2水平显著降低。而依达拉奉阳性对照组和TSG高、中剂量组均可以显著上调Bcl-2水平,降低p53及Bax水平。TSG小剂量组对p53、Bcl-2、Bax水平均没有明显作用。结论 TSG对于I/R引发脑神经元损伤保护作用的机制可能与影响p53、Bcl-2、Bax凋亡相关因子表达有关。     

磷蛋白组的研究技术及其进展

真核细胞中蛋白质磷酸化是一个重要事件。真核细胞利用可逆的蛋白磷酸化来控制许多细胞过程包括信号转换、基因表达、细胞周期等。磷蛋白组的研究涉及磷蛋白的分离和鉴定 ,磷酸化残基定位和定量分析。由于蛋白质磷酸化是一个动态过程 ,在细胞中磷蛋白含量低 ,磷酸化位点可变 ,且磷酸肽的质谱信号常常会受到抑制 ,所以磷蛋白的分析存在更多的困难。本文介绍了国内外在磷酸蛋白的分离鉴定及定量分析方面的研究技术以及进展情况。目前 ,质谱仍然是核心的鉴定技术 ,寻找更好富集方法是最大的挑战。定量蛋白组学是对蛋白质的差异表达进行精确的定量分析。目前还不存在一种独立的方法可以完成磷蛋白的分离、鉴定 ,以及磷酸位点的定位和定量分析。随着样品分离技术和相关仪器的发展 ,磷酸蛋白快速、准确、全面分析鉴定将能够实现。     

大肠杆菌不耐热肠毒素的表达及其纯化保存策略

编码完整大肠杆菌不耐热肠毒素(LT)的基因被引入pET11c形成pET11-LT,该质粒在E.coli BL21(DE3)中得到较高效率的表达,约46mg/L。用D(+)Immobilized galactose柱可以在很宽的pH范围(pH7.3～10.4)内用多种方法对LT进行纯化且保持其结构完整。溶于TEAN(pH7.3)或碳酸盐缓冲液(pH10.4)的LT,冻干后保存于4℃,可长久保持其完整结构,此为保存LT的较好策略。与GM1结合实验、CHO细胞及Patentmouse毒性检测实验证明纯化的LT具有生物学活性。