三氯乙烷污染环境中脱卤素杆菌的多样性

三氯乙烷(1,1,1-Trichloroethane,TCA)是一种易挥发的氯代烃,密度大于水,曾作为金属清洗剂和高效溶剂在工业上广泛应用.近年来三氯乙烷对环境及人类健康的危害引起人们的关注,其自然分解过程较为困难,在环境中的存在具有一定的持久性.由于不合理的排放和意外泄漏等原因,三氯乙烷已成为地下水中最普遍的污染物之一,严重威胁生态系统和人体健康,是美国环保署(EPA)所确定的优先污染物.研究表明,Peptococcaceae科的脱卤素杆菌属(Dehalobacter)细菌纯培养物或含有Dehalobacter的混合培养物可催化三氯乙烷及1,1,-二氯乙烷还原脱氯,在其降解过程中起关键作用[1 3],并可利用含有Dehalobacter的菌群对三氯乙烷污染场地进行生物治理[4],其中Dehalobacter 16SrRNA基因的特异性探针被用作生物标记物来评价三氯乙烷污染场地的生物降解潜能[4-5].     

实时荧光定量PCR检测非酒精性脂肪性肝炎新西兰兔肠道内菌群的变化

目的 应用实时荧光定量-聚合酶链反应法(fluorescent real-time polymerase chain reaction,RT-PCR)法对高脂喂养诱导非酒精性脂肪性肝炎(nonalcoholic steatohepatitis,NASH)新西兰兔的粪便中大肠埃希菌、乳酸杆菌及双歧杆菌属的数量进行定量检测分析.方法 14只雄性新西兰兔随机分为模型组和对照组,分别用普通饲料和高脂饲料喂养12周,取粪便提取细菌组DNA,根据细菌的16S rDNA基因序列设计大肠埃希菌、乳酸杆菌及双歧杆菌属的种属特异性引物,进行实时荧光定量PCR反应,定量分析不同细菌的数量.结果 模型组动物病理学检测肝细胞脂肪变性,提示模型成功.对照组与模型组动物粪便中细菌数量分别为大肠埃希菌(11.48 ±1.09,7.39 ±0.81)、乳酸杆菌(4.94±0.95,5.65 ±0.91)、双歧杆菌属(4.07 ±0.97,6.45±0.90),经统计学分析表明模型组较对照组大肠埃希菌数量明显增多(t=-3.282,P =0.013),而乳酸杆菌、双歧杆菌属数量变化无统计学意义(t1=-1.204,P1=0.268;t2=0.423,P2=0.683).结论 NASH模型组粪便内大肠埃希菌数量较正常组增多,提示大肠埃希菌数量与非酒精性脂肪性肝病(Nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)有关,而乳酸杆菌及双歧杆菌数量无明显变化,其与NAFLD的关系有待进一步研究.     

微生物来源的纤溶活性酶研究进展

微生物是溶栓药物的重要来源。到目前为止,已发现可产生纤溶活性酶的微生物主要有：β-溶血性链球菌、金黄色葡萄球菌、芽孢杆菌属的多种细菌、海洋假单胞菌、链霉菌及真菌。本文就微生物产生纤溶活性酶的来源、理化性质、作用机制、基因结构与改造、临床应用等方面进行了综述。     

鲸偶蹄目核糖核酸酶10基因的分子进化研究

核糖核酸酶10由RNase10序列编码,是脊椎动物特有的生殖酶,其研究主要集中在生理功能,系统的分子进化研究相对甚少。本文,我们基于24个鲸偶蹄目代表物种的基因组分析,共获得26条RNase10序列。在偶蹄目的印度水牛和野猪中首次检测到RNase10发生基因复制,而其它22个物种均为单个基因。系统发育分析揭示鲸目的齿鲸亚目和须鲸亚目形成单系;偶蹄目的反刍亚目最先分歧,猪次目和胼足亚目形成单系。具有核糖核酸酶活性的保守功能区“CKXXNTF”发生了改变,等电点显著低于RNASE A的典型成员,揭示鲸偶蹄目RNase10可能丢失了RNASE A具有的核糖核酸活性和抗菌活性。另外,选择压力分析共检测到13个正选择位点,其中2个位点在结构半胱氨酸附近。总之,我们基于基因组分析深入揭示了鲸偶蹄目RNase10的分子进化机制,解开了鲸偶蹄目RNase10的分子进化之谜,为今后开展RNase10功能研究奠定了理论基础。     

维吾尔族新发2型糖尿病患者肠道 乳杆菌属和多形拟杆菌的定量研究

目的定量研究维吾尔族新发2型糖尿病(T2DM)患者和糖耐量正常(NGT)人群肠道中乳杆菌属(Lactobacillus genus)和多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)的相对水平。方法严格按照纳入标准、排除标准收集维吾尔族新发T2DM患者96例,NGT 98例。提取所有研究对象的粪便细菌总DNA后,采用16SrDNA基因实时荧光定量PCR(Real-time PCR)对乳杆菌属和多形拟杆菌的水平进行定量检测;运用Pearson相关性分析乳杆菌属与研究对象的BMI、腰围、臀围、收缩压(SBP)、舒张压(DBP)、空腹血糖(FBG)、甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、高密度脂蛋白(HDL-C)和低密度脂蛋白(LDL-C)的相关性。结果 16SrDNA基因Real-time PCR结果显示:(1)与新疆维吾尔族NGT组相比,乳杆菌属水平在新发T2DM中较低,差异有统计学意义(t=8.557,P=0.000)。但是多形拟杆菌在两组差异无统计学意义(t=0.524,P=0.601);(2)新疆维吾尔族上述人群肠道中乳杆菌属水平与FBG呈负相关(r=-0.334,P=0.000),腰围呈负相关(r=-0.170,P=0.018),TC呈负相关(r=-0.178,P=0.013),TG呈负相关(r=-0.157,P=0.030),收缩压呈负相关(r=-0.255,P=0.000)。结论 Lactobacillus genus水平在肠道中降低可能与2型糖尿病的发病,血糖和血脂代谢有关,其机制需进一步研究探讨。     

一株分离自网箱养殖区沉积物的硫氧化菌B1-1的鉴定及其硫氧化特性

【背景】海水网箱养殖是一种高密度、高投饵的人工养殖方式,其产生的硫化物污染严重影响了海水养殖业的经济效益及可持续发展。【目的】鉴定从网箱养殖区沉积物中分离得到的硫氧化菌B1-1并研究其硫氧化特性,为利用生物技术修复网箱养殖环境提供理论依据。【方法】通过形态观察、生理生化特征及16S rRNA基因序列分析对硫氧化菌B1-1进行鉴定;通过摇床培养对该菌株氧化硫代硫酸盐的最适培养条件(pH、温度、底物浓度、外加碳源、外加氮源、金属离子)进行研究。【结果】该菌株被鉴定为HalothiobacillushydrothermalisB1-1。菌株B1-1生物氧化硫代硫酸盐的最适pH为8.0,最适生长温度为30°C,最适底物浓度为5.0g/L;外加碳源对该菌株氧化能力无显著影响,外加铵盐(硫酸铵或草酸铵)可以将延滞期缩短至12 h,添加Mg~(2+)可以显著提高菌株的氧化能力,氧化率达100%。【结论】Halothiobacillus hydrothermalisB1-1耐盐性较强,对硫代硫酸盐氧化率高,可作为修复受硫化物污染网箱养殖环境的潜在菌株资源。     

串珠镰刀菌素降解菌的筛选及特性分析

从黑龙江省镜泊湖附近的草甸土中筛选到一株能以串珠镰刀菌素(MON)为唯一碳源和能源生长的Y21-2菌株。该菌在含500μg/mL MON的基础培养液中菌数从107增长至10１０。根据常规形态特征分析、生理生化性状、G+C mol%含量测定及16S rDNA基因序列分析将其鉴定为根瘤菌科的苍白杆菌属(Ochrobactrum)。静息细胞试验证实Y21-2菌株细胞内确实存在能够降解MON的酶系。     

嗜盐嗜碱杆菌属的一个新种

从内蒙古自治区哈马台碱湖分离到一株多形态嗜盐嗜碱菌(编号HAM—2),其生长的NaCI浓度范围为12％～30％,最适17.5％;生长的pH范围为7.8～10.4,最适pH9.0～9.5。革兰氏染色阴性。细胞为不规则杆状、椭圆形、三角形等多形态,细胞大小为1.0～2.0×2.0～5.Oμm。该菌株主要极性脂是磷脂酰甘油磷酯(PGP)和磷脂酰甘油(PG),还含有一种未知的次要磷脂成分(PL4)。DNA中G+C含量为59.5mol％。根据这些特征,菌株可归入嗜盐嗜碱杆菌属,又根据细胞形态和极性脂组份不同于该属正式承认的三个种,因此,鉴定此菌株为嗜盐嗜碱杆菌属(Natronobacterium)的—个新种,定名为内蒙古嗜盐嗜碱菌(Natronobacterium innermongoliae Sp.nov.)。     

开发心脏类药物的斑马鱼模型

鲸是世界上最大的动物,长达十几米、体重上百吨;鲸虱则是鲸身上的微小寄生虫,体长仅1厘米。科学家通过鲸虱的血统考察鲸的家世,成功追溯了露脊鲸的进化史。此前,美国《科学》杂志网站报道说,鲸的数量少、寿命长,生物学家很难为它们建立一套准确的     

BF7658α—淀粉酶稳定性的研究

解淀粉芽孢杆菌ＢＦ７６５８即以产生丰富的α－淀粉酶,又能产生丰富的蛋白酶。在０．２ｍｏｌ／ＬｐＨ７．２磷酸缓冲液中,不加任何底物,样品中α－淀粉酶与蛋白酶的比例是１３：１,２１：１,２７：１,３７保温２４小时,α－淀粉酶活力损伯２２．１－８．８％,即α－淀粉酶的稳定性随蛋白酶的增加而减少,因而认为蛋白酶是影响α－淀粉酶稳定性的重要因素。α－淀粉酶的稳定性可以通过选育菌种,选择合适的培养条件,添加钙