塔里木马鹿维生素D受体（VDR）基因结构 和功能的预测与分析

为了分析塔里木马鹿（Cervus elaphus yarkandensis）维生素D受体（VDR）基因的结构和相关功能,本研究从前期研究获得的塔里木马鹿和天山马鹿（C. e. songaricus）皮肤组织转录组测序结果中,获得上调表达的塔里木马鹿VDR基因的序列,对塔里木马鹿VDR基因进行实时荧光定量PCR（qPCR）验证,利用相关软件进行同源性比对、系统进化树构建和生物信息学分析。实时荧光定量PCR结果显示,VDR基因在转录组测序的结果与qPCR的结果中表达趋势一致,均为上调。基于VDR基因同源性比对结果显示,塔里木马鹿与白尾鹿（Odocoileus virginianus,GenBank登录号XM_020889235.1）的遗传距离较近,同源性最高;与褐家鼠（Rattus norvegicus,GenBank登录号NM_017058.1）的遗传距离较远,同源性最低。系统进化树也证实了这个结果。生物信息学分析结果表明,塔里木马鹿VDR蛋白由20种氨基酸组成,分子质量为32.92 ku,理论等电点为5.73,不稳定系数为33.56,总平均亲水性为﹣0.298,脂溶系数94.95,无跨膜区,无信号肽,无O-糖基化位点,有1个N-糖基化位点,有15个磷酸化位点,最有可能位于内质网膜中,二级结构和三级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,有3个低复杂度区域,无保守结构区域。     

卡拉库尔羊MHC-DRB3基因的遗传多样性研究

目的:实验通过MCH-DRB3基因来探讨卡拉库尔羊的遗传多态性,为绵羊遗传资源的合理利用及保护提供理论基础和科学依据.方法:采用PCR-Clone测序方法首次对卡拉库尔羊的MHC-DRB3基因的第二外显子进行分子遗传多态性检测与分析.结果:总共检测出35种单倍型,总的单倍型多样度(Hd)为0.958,核苷酸多样性(Pi)为0.05786,平均核苷酸差异数(k)为16.49062,简约信息多态位点数为54.卡拉库尔羊MHC-DRB3基因的氨基酸序列的氨基酸组成进行分析可知含量最多的氨基酸是精氨酸(Arg),平均含量为12.9%,含量最低的氨基酸是蛋氨酸(Met),平均含量为0.018%.结论:从以上参数可以看出卡拉库尔羊具有很高的遗传多样性.     

基于GWR模型的于田绿洲土壤表层盐分空间分异及其影响因子

以于田绿洲为研究靶区,利用24个采样点的土壤表层盐分数据,选取9个与土壤表层盐分密切相关的影响因子,结合空间自相关、传统回归分析和地理加权回归模型,分析表土盐分的空间分布特征及其影响因子的空间分异.结果表明:于田绿洲表土盐分在空间上并非随机分布,而是存在较强的空间依赖关系,空间自相关指数为0.479.地下水矿化度、地下水埋深、高程和温度是影响干旱区平原绿洲表土积盐的主要因子,这些因子具有空间异质性,选取的9个环境变量中除土壤pH值外,其他变量对表土盐分的影响强度均存在显著的空间分异.GWR模型对存在空间非平稳性数据的解释能力和估计精度都优于OLS模型,而且在模型估计参数的可视化上具有明显优势.     

新疆哈密山区天山马鹿(Cervus elaphus songaricus)的种群数量调查*

查清新疆东部哈密山区野生天山马鹿(Cervus elaphus songaricus)种群的现状,可为有效保护与合理利用野生马鹿资源提供科学依据。我们通过截线抽样法和遥感技术,弄清哈密山区天山马鹿的栖息地范围,估算马鹿的种群数量及种群密度。在哈密山区野生天山马鹿分布区域共设计了28条样线,总长度60.1 km,遇见马鹿233头,通过计算得到该地区马鹿天山亚种种群平均密度为(2.83?1.01)头/km2。栖息地面积374.35 km2,估计马鹿总数为(1 057.56?379.71)头左右。雌雄比例2.24:1,幼体和亚成体的总数量多于成体和老体总数。研究区域内马鹿的种群密度和资源总数量比往年的调查结果有所上升;马鹿的分布海拔高度比较一致,但种群的大小具有不均匀性;从性比和年龄结构来看该研究区域的马鹿种群面向着数量的增长趋势。     

干旱区绿洲城市树木健康评估及影响因素——以乌鲁木齐市为例

树木作为城市绿色基础设施重要组分,其健康直接影响城市生态系统服务及人居环境质量。城市化进程加快导致生态土地缺失,同时缺乏合理养护加之极端自然条件干扰对树木健康造成严重威胁。为揭示城市树木健康风险及影响因素,对乌鲁木齐市核心城区117个样地绿化树木进行健康评估,从4个维度12个指标构建树木健康分级体系,基于样地调查结果,分析树木组成、结构、关联性、健康状况及影响因素,揭示乌鲁木齐市不同功能区树木健康差异。旨在为研究区树木健康保护、城市绿地可持续经营及城市生态文明建设提供理论依据和数据支撑。结果表明：（1）乌鲁木齐市城市园林树木乔灌比为8.3 ： 1,树木多样性与种间关联程度较低。榆树占比高达43.87%,其中白榆占比22.62%,是主要优势树种;（2）不同树种健康程度呈现差异性,榆树类健康状况呈现圆冠榆 > 大叶榆 > 白榆 > 垂枝榆特征;（3）城市不同功能区树木健康也呈现异质性;以公园和居住小区树木健康分值较高,而行道树和学校庭院树木健康分值相对较低,且冗余分析进一步揭示地面铺装、林木配置结构、生长空间和胸径对树木健康影响程度最为显著。未来优化城市树木生境条件、提升物种丰富度、加强古树名木保育和提高园林绿化管理水平是维护和提升绿洲城市树木健康的重要举措。     

动物毛发石蜡切片的制作

目的:探讨哺乳动物针毛横断面的快速简易的制作方法,从毛发横断面上观察毛发微观结构。方法:取新疆部分哺乳动物(马鹿塔里木亚种Cervus elaphus yarkandensis,藏羚羊Pantholops hodgsoni,野双峰驼Camelus bactrianus,狍子Capreolus capreolus)的毛发,先将其清洗然后经浸蜡、包埋、切片、染色、封片等一系列过程的研究,得发毛横断面。结果:各动物毛发微观结构差异显著:马鹿塔里木亚种,毛皮质极薄,毛髓质占大多数;藏羚羊,由若干多边行空囊组成,内部中空;野双峰驼,毛皮质与毛髓质所占比例相当;狍子,毛皮质约占2/3,毛髓质约占1/3。结论:为利用哺乳动物毛发进行种属鉴定奠定一定科学理论基础。     

保护新疆马鹿塔里木亚种的建议

马鹿塔里木亚种分布于新疆塔里木盆地各沿河地带,强度适应荒漠生境。采用分子系统学方法研究表明,世界马鹿分为东西两大系统,马鹿塔里木亚种是我国唯一属于西部系统的亚种。在中国濒危动物红皮书中被列为濒危(E)亚种,按国际自然与自然资源保护联盟(IUCN)1993年制定的世界物种红色名录濒危定级标准,属于极危级(EN)。自20世纪50年代以来,由于自然和人为因素的影响,种群数量急骤下降,现今马鹿塔里木亚种在塔河流域被隔离为莎雅、尉犁和且末3个小种群,当前该亚种正受到栖息地减小和片断化的双重影响,而且因遗传漂变和近亲繁殖的不断增加也进一步加剧它的濒危程度。为有效保护该物种特提出可行的保护建议。     

陈旧家禽血液基因组DNA的快速提取

目的:建立一种从陈旧家禽血液中快速提取基因组DNA的方法。方法:以传统蛋白酶K法为基础进行优化。以陈旧鸡血为实验材料,新鲜抗凝鸡血为对照,经过生理盐水预处理、高浓度SDS裂解液和蛋白酶K消化、酚氯仿抽提后,对产物进行凝胶电泳检测、紫外分光光度检测和PCR扩增。结果:提取时间缩短为5～6h,所得基因组DNA纯度高、产量大,可用于后续分子生物学实验。结论:快速从陈旧家禽血液中提取DNA的方法被成功建立。     

新疆维吾尔族群体线粒体DNA高变区Ⅰ遗传多态性

[目的]研究维吾尔族群体线粒体DNA高变区Ⅰ序列遗传多态性。[方法]收集240份新疆8个地域维吾尔族无关个体mt DNA高变区Ⅰ进行测序分析。[结果]发现多态性位点数为:喀什、和田、库车、且木、伊犁、哈密、吐鲁番、尉犁维吾尔族分别为75、98、59、111、75、46和94。单倍型多样性分别为:喀什群体为0.996±0.014,和田群体为0.993±0.014,库车群体为0.993±0.015,且木群体为0.993±0.014,伊犁群体为0.993±0.013,哈密群体为0.995±0.012,吐鲁番群体为0.993±0.012,尉犁群体为0.994±0.023。用HVRⅠ序列多态性数据计算Fst和d A两种遗传距离,相关系数为r=0.993(P0.01)。[结论]中国的维吾尔族人群mt DNA其遗传多态性和个体识别力比较高,并且维吾尔族群体是东亚与欧洲人群的过渡人群,这些数据可用于法医学、人类学、遗传制图个体识别等领域研究。     

新疆维、哈、蒙古族-HTT基因启动子区多态性的研究

采用聚合酶链反应(PCR)技术,对我国新疆维吾尔族、哈萨克族和蒙古族三个正常群体5-HTT基因启动子区(5-HTTLPR)的一个插入/缺失多态性进行了研究。结果显示:5-HTTLPR等位基因及基因型频率分布在三个民族中没有较大差异,短片段等位基因S有较高的分布频率。X2检验证明,三个民族群体的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。经分析,维吾尔族的观测杂合度(Hobs)、期望杂合度(Hexp)、多态信息量(PIC)分别为0.4167、0.4845和0.3759;哈萨克族的Hobs、Hexp和PIC分别为0.4141、0.4338和0.3396;蒙古族的Hobs、Hexp和PIC分别为0.4639、0.4386和0.3425。结果可为人类学、法医学鉴定及疾病的关联研究提供遗传学数据。