脑胶质瘤IDH1基因突变HRM检测方法的初步建立

在大多数弥漫性人脑胶质瘤中常伴随着异柠檬酸脱氢酶基因(isocitrate dehydrogenase gene)1(IDH1)的突变.有着此突变的胶质瘤患者在临床上有良好的预后效果,因此可以作为胶质瘤患者的分子标记.通过提取石蜡切片中的胶质瘤组织DNA,优化条件以初步建立IDH1基因突变高分辨率熔解曲线分析法(high resolution melting,HRM)检测方法.用HRM对胶质瘤石蜡包埋组织标本中IDH1基因检测突变,并用直接测序法对比,观察反应体系和反应条件的可行性.正交试验结果证明引物最适退火温度为53℃,20μL HRM反应体系中,0.6μmol/L引物,2.5 mmol/L Mg2+,60 ng DNA模板为最佳.HRM IDH1基因突变的结果和直接测序法结果一致,但灵敏度更高.说明此HRM方法简单,特异性强,准确可靠,可为IDH1突变检测的临床应用提供借鉴依据.     

名刊封面

《结构》2010.10 伴侣蛋白的立体结构 科研人员将X光晶体学和电子显微镜学相结合,得到了酸菌属腾冲品系S5第Ⅱ组伴侣蛋白的完全高分辨率开放结构,并且阐明了从开放状态到闭合状态的构象变化。     

基于快鸟影像纹理特性的刺槐林叶面积指数估算

以渭北地区刺槐林为研究对象,通过计算高分辨率影像不同窗口的纹理参数,分别运用一元一次方程、一元二次方程、乘幂模型和指数模型,研究刺槐林野外实测叶面积指数（LAI）与快鸟影像纹理参数间的相关关系,遴选黄土高原地区估算刺槐林LAI最适合的纹理参数以及计算窗口大小.结果表明： 纹理指数对LAI反演精度影响显著,其中角二阶矩阵和熵的估算精度明显高于其他纹理指数;计算窗口的大小显著影响LAI反演精度,非相似度和对比度的反演精度在窗口9×9达到最大,其余纹理指数对于LAI的估算精度随着计算窗口的变大不断降低,在窗口3×3时达到最大;乘幂模型的估算精度低于其他3种方法.     

滩涂湿地入侵种互花米草植被覆盖度的高空间分辨率遥感估算

互花米草是沿海滩涂生态系统的重要入侵物种,其分布状况和覆盖度是湿地生态研究的重要参数和基础。以宁德三沙湾(三都澳)滩涂湿地为研究区,以SPOT6 6 m空间分辨率卫星影像为数据源,对互花米草分布和植被覆盖度进行研究,并与同期10 cm空间分辨率无人机影像进行比较验证。结果表明,影像覆盖区域内互花米草总面积为20.19 km~2,其中蕉城区互花米草分布较广,面积为9.63 km~2,占研究区互花米草总面积的47.70%。互花米草植被覆盖度整体上以40%-60%和60%-80%的中、高覆盖度分布为主,其分布面积分别为5.44 km~2和4.95 km~2,占互花米草总分布面积的26.92%和24.52%,而40%以下的低覆盖度和80%以上较高覆盖度分布相对较少。SPOT6遥感影像估算得到的互花米草植被覆盖度具有较好的精度,与无人机影像值之间的均方根误差RMSE为0.117,线性回归决定系数R~2为0.918,可用于滩涂湿地植被覆盖度分析。     

遥感影像空间分辨率及粒度变化对城市景观格局分析的影响

尺度是景观生态学和遥感领域的重要问题,已有研究主要考虑景观的粒度效应,很少涉及遥感影像空间分辨率对景观格局,尤其是对城市景观格局的影响.基于2000年和2002年分别由ETM 和IRS-PAN影像解译得到的土地利用图,从景观和类型两个层次分析了不同粒度下上海市一城市化样带的景观格局.结果表明,城市景观有明显的尺度效应,空间分辨率和粒度变化都会影响城市景观格局,而道路等线性廊道对尺度变化的敏感则是造成这一影响的主要原因.斑块密度、边界密度、平均斑块分维度、景观聚集度和最大斑块指数的粒度效应比较明显,而景观比例、Shannon多样性指数对粒度变化并不敏感.高分辨率影像适用于城市景观格局,尤其是破碎度的分析,其用于分析的合适粒度是5～10m.     

光学成像在肿瘤研究中的应用

随着分子标记技术的发展,光学成像技术作为一种非侵入性动态成像技术,以其高分辨率、高灵敏度正越来越多的应用于医学和生物学的研究.该文重点介绍了在体生物光学成像技术在肿瘤的转移机制、药物对肿瘤的疗效、肿瘤细胞凋亡、肿瘤血管生成等方面的应用.     

基于高分辨率熔解曲线的常见五种皮肤癣菌分子鉴定

皮肤癣菌是浅表真菌感染的重要致病菌,常见致病菌种包括红色毛癣菌、趾间毛癣菌、絮状表皮癣菌、犬小孢子菌和内弯小孢子菌。本研究基于实时荧光PCR的高分辨率熔解曲线分析技术,以几丁质合成酶1为目标基因设计扩增引物,对经测序鉴定的上述5种皮肤癣菌进行熔解曲线分析,并在方法建立后,对已鉴定的临床菌株进行验证。实验结果表明,使用该方法上述5种皮肤癣菌均能扩增,并表现出不同的熔解曲线和熔解温度值,可有效区分;对其余对照菌及人基因均无法扩增,特异性为100%;临床菌株的熔解曲线分析结果与DNA测序结果一致。本研究提供了一种快速、准确鉴别5种常见皮肤癣菌的方法,可为临床应用和分子流行病学研究提供参考。     

高分辨率熔解曲线分析技术——分子遗传分析的新曙光

背景知识 虽然我们已经进入后基因组时代，遗传学研究仍然有很多尚未解决的问题，其中最重要的工作之一就是检测分析DNA亭列的变异。核酸在序列上的各种突变（如替换／插入／删除／重复）能影响相关基因的表达，进而改变细胞的生理生化活动，最终导致个体层次上的千差万别。在各种序列突变中，单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism，SNP）在基因组中广泛分布，     

首张人脑超清三维图谱问世

历经10年的“大脑”（BigBrain）项目，创造了包含1万亿字节数据的高分辨率精密人脑解剖图。     

《自然-方法学》：新型荧光蛋白可用于活细胞观察

来自德国卡尔斯鲁厄理工学院等处的研究人员发现了一种新的，来自珊瑚虫的荧光蛋白。这种荧光蛋白可以用于高分辨率显微镜下观察活细胞。这一研究成果公布在《自然-方法学》（Nature Methods）杂志上。