几种经济植物UFGT基因的生物信息学分析

本文根据在GenBank中已登录的葡萄、玉米、水稻、草莓、拟南芥和苹果等植物的类黄酮-3-O-葡萄糖基转移酶基因的核苷酸序列和氨基酸序列,应用生物信息学软件预测了其理化性质、疏水性/亲水性、导肽、跨膜结构、卷曲螺旋结构、二级结构、功能结构域及高级结构,并构建了类黄酮-3-O-葡萄糖基转移酶蛋白家族的系统进化树.结果表明这几种植物的UFGT基因核苷酸序列除葡萄存在2个外显子外,其它植物均存在1个外显子.含量最丰富的氨基酸是Leu、Ala、Gly、Val和Ser等,除葡萄、苹果UFGT属于不稳定类蛋白外,其余均属于稳定类蛋白.进一步研究分析表明,这几种植物UFGT蛋白存在明显的疏水区和亲水区、信号肽、跨膜结构以及卷曲螺旋.二级结构组成上比例相似,并且都由α-螺旋、延伸链和无规则卷曲所组成.它们都存在UDPGT、COG1819和MGT等保守域.除了拟南芥外,其它几种植物都能够通过同源建模建立UFGT蛋白的三维结构.进化分析表明,把它们的UFGT 基因分成5个类群,其中3个大类群,另外陆地棉和野芭蕉的UFGT基因分别单独成一类.本工作将为深入研究该蛋白在植物花、果实和叶片等器官颜色变化中发挥的功能,开展生物大分子结构模拟以及药物设计提供抛砖引玉的作用.     

珍稀油料树种琴叶风吹楠果实和种子形态变异

以云南野生琴叶风吹楠(Horsfieldia pandurifolia)为材料,对39株树的果实和种子的形态进行变异分析。结果表明,果实和种子形态指标株间变异大,株内变异小。单株间果实表现出从卵圆形至长椭圆形的变异,果长4~7 cm,先端圆钝至锐尖,基部不同程度偏斜,与文献记录差异较大;单株间种子形态表现出从卵形、长卵形至细长形或近锥形的变异。单株平均种长变幅为25.05~35.66 mm,种宽为13.30~19.62 mm,长宽比为1.47~2.32,单因素方差分析表明此3个性状单株间差异极显著(p<0.01)。灰白色种皮具褐色斑块,种脐和胚位于种子基部,种子先端突尖或具短喙是稳定的性状,有重要的分类学价值。     

平茬高度对云南松苗木碳氮磷化学计量特征的影响

为了解平茬对云南松(Pinus yunnanensis)苗木各器官碳(C)、氮(N)、磷(P)含量及其化学计量特征的影响,探讨C、N、P含量间的相关关系及其异速生长关系,本研究对不同平茬高度(对照、5、10和15 cm)的云南松苗木采样测定,分析主根、侧根、茎、侧枝、母株针叶、萌条枝、萌条针叶共7个器官的C、N、P含量及其C∶N、C∶P、N∶P值。结果表明：除C含量在平茬高度间无显著差异外,N含量、P含量、C∶N、C∶P、N∶P在平茬高度、器官、平茬高度×器官间均存在极显著差异;随着平茬高度的增加,N含量、P含量和N∶P呈现先上升后下降趋势,而C∶N和C∶P呈现相反的趋势;不同平茬高度下各器官营养元素含量及比值的变异系数波动低,表明平茬对C、N、P含量及其化学计量稳定性的影响较小;平茬处理下C含量与N、P含量间的相关关系有一定的改变,随着平茬高度的增加,C含量与N、P含量间的相关关系减弱;平茬未改变它们之间的异速生长关系,表现为C的积累速率低于N和P,苗木生长以N调控为主;综合来看,平茬改变植株体内的营养元素含量,进而改变植物体内C、N和P含量的平衡关系,云南松苗木表现以N调控为主,随...     

小麦全蚀病菌荧光抗体制备方法研究

1970年,Choo,Y.S.和Holland,A.A.首次采用荧光抗体方法对小麦全蚀病菌(Gaeumannomyces graminis,简称WTAF)进行了观察和比较。他们认为,荧光抗体技术在真菌混合区系的生态研究中,用以识别和追踪某些真菌是有价值的。     

样本量对云南松幼苗生物量模型构建及预估精度的影响

为探究不同样本量对生物量模型构建及建模精度的影响，以实际调查的20个家系，共615株云南松幼苗为例，通过编写计算机程序建立进行简单随机抽样，构建不同样本量云南松幼苗各器官及单株生物量异速生长方程。利用决定系数（R²）、估计值标准误（SEE）、均方根误差（RMSE）、总相对误差（RS）及平均误差绝对值（MAB），对模型拟合优度与精度进行比较分析。结果表明：幂函数方程可较好地用于估测云南松幼苗生物量；随着样本量的增加模型精度评估指数MAB呈幂函数形式逐渐减小；当样本数量小于200时MAB较为敏感，模型精度较差，样本量大于200时，其精度随样本量逐渐增加，但变化幅度逐步减小并趋于稳定。因此，根据MAB的变化趋势，样本量达到200时可以构建精度较高且稳定模型。