质谱数据库查询软件的应用与评价

最近的蛋白质组学研究进展表明以质谱为核心的蛋白质组学在分子生物学,细胞生物学乃至将来的系统生物学中都扮演着一个举足轻重的角色。毫无疑问,在质谱鉴定过程中,质谱仪本身的精度对实验结果有着至关重要的作用;除此之外,质谱结果数据库查询软件的准确性直接影响了查询结果的准确性。本文就目前常用的质谱数据库查询软件的工作原理,统计结果评价等方面做一简要综述。     

青海湖地区狗獾分类地位和狗獾属进化历史探讨

本研究选择线粒体细胞色素b (cytochrome b, Cyt b)和控制区(control region, CR)片段作为分子标记, 探讨了青海湖地区狗獾(Meles sp.)的系统发育地位和狗獾属分歧时间。研究结果支持目前将狗獾属分为4个种的结论。Cyt b和CR片段序列拼接后总长1,652 bp, 23条序列共定义了21个单倍型。研究结果表明欧亚大陆狗獾分为东西两个支系, 每个支系进一步分为两个种: 东部支系包括亚洲狗獾(M. leucurus)和日本狗獾(M. anakuma); 西部支系包括欧洲狗獾(M. meles)和西南亚狗獾(M. canescens)。贝叶斯树和单倍型网络关系图都支持青海湖地区狗獾属于亚洲狗獾。分歧时间的估算结果与古生物学证据相符, 东部支系和西部支系在2.24 Ma左右产生分歧, 西南亚狗獾在1.27 Ma左右从欧洲狗獾分出, 而日本狗獾和亚洲狗獾的分化时间为0.99 Ma左右。     

赛罕乌拉自然保护区藻类植物区系及群落结构特征

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1989—2011年东洞庭湖草洲出露面积变化及其与水位响应的关系

基于多时相的Landsat MSS/TM/ETM⁺遥感影像数据,采用决策树分类法提取1989—2011年共49景东洞庭湖不同水位条件下的草洲出露面积,结合1985—2011年城陵矶日水位数据及数字高程模型,分析草洲时空变化特征并阐明其变化趋势.结果表明: 研究区出露草洲面积受水位影响显著,两者呈极显著的线性关系(R²=0.875,P<0.001),出露草洲面积随水位的升高而逐渐减小,且水位越高,对草洲出露面积的影响越小.草洲出露面积随水位呈现规律性变化,1—7月,水位上升,草洲面积减少;7—12月,水位下降,草洲出露面积增加.1989—2011年,草洲出露面积持续增加,新增草洲主要由泥滩地转化而来;草洲扩张是各高程段草洲面积共同增加的结果,低位洲滩(黄海高程22～25 m)草洲面积的快速增加是湿地草洲扩张的主导部分.各高程水位变化是研究期间东洞庭湖草洲出露面积变化的主要原因.     

长白山红松针阔混交林与开垦农田土壤呼吸作用比较

利用静态箱式法测定长白山红松(Pinus koraiensis)针阔混交林及其开垦农田的土壤呼吸作用。结果表明,两者土壤呼吸作用的日动态和季节动态均主要受温度影响,农田土壤呼吸作用的日变化极值出现时间较林地提前,最大值出现在12∶00左右,比林地提前6 h左右,最小值在凌晨5∶00左右,早于林地2~3 h;在生长季,土壤呼吸速率与10 cm土壤含水量关系不显著,而与土壤5 cm温度呈显著的指数关系;农田土壤温度高于林地,但在整个生长季(5~9月)林地土壤释放CO₂量(2 674.4 g·m^-2)约为农田(1 285.3 g·m^-2)的2倍;观测期间,农田土壤呼吸速率占林地的比例范围在23.4%~76.3%之间,说明土壤呼吸作用还受不同土地利用方式下植被类型等的影响。农田和红松针阔混交林土壤呼吸作用的Q₁₀值分别为3.07和2.92,农田土壤呼吸作用的Q₁₀ 值估计可能偏大。森林转变为农田后,环境、生物因子以及土壤养分含量和物理性质发生改变,共同影响土壤呼吸作用的强度和动态特征。     

高温对环带锦斑蛾幼虫滞育的抑制作用

本文报道了高温（31℃）对环带锦斑蛾幼虫滞育发生的抑制作用。当幼虫暴露于31℃ 时,所有个体都继续发育,与光周期无关。在诱导滞育的光周期条件(L12∶D12)下,光期的高温配合不同的暗期低温（15～28℃）,导致几乎所有个体滞育,但当暗期为5℃时,滞育率反而下降;相反,当光期的低温配合不同持续时间的暗期高温（31℃）时,则几乎所有的个体都继续发育,这说明高温在暗期发挥着重要的作用。在暗期给予不同时间长度（2、4、 6、8、10、12 h）的高温处理,结果表明一个2 h的高温处理就能有效地抑制滞育的发生。在暗期的不同时间给予4 h高温处理,显示了幼虫在暗期开始后的第一个4 h (18:00～22:00 )对高温最敏感,完全抑制了滞育的发生。最后讨论了高温调节滞育机制在该虫生活史上的适应意义。     

蠢猪不蠢

提起猪,人们自然会联想到《西游记》中的猪八戒,尤其是当看到“八戒背媳妇”等妙趣横生的情节时,人们常常会忍俊不禁,拍案叫绝。你看它那副傻样子,肥头大耳,笨手笨脚,其是集“肥”与“笨”于一身,现“蠢”与“傻”于一行。然而在日常生活中,猪与人类的关系是如此密切,以致于猪的形象经过文人的艺术加工,更显得亲切生动,独具一格。一、驯养由来猪在动物分类上属偶蹄目,猪科,下分5属,9种,原产旧大陆,后来引进到其他地区。最早的猪出现于四千多万年前的渐新世早期,欧洲的原古猪是最早的代表之一。猪的演化特点是体型逐渐增大。在新生代中、晚期,原始野猪沿着多条适应辐射方向发展,形成     

人之友——马类今昔谈

提起马,真可谓家喻户晓,尽人皆知。马与人类相随数千年,终日辛劳,任劳任怨,是人类的忠实朋友和助手。正如一位作家所说:“马所表露于外的,正是最有益于人类内心的。”     

亚高山草甸弃耕地植物群落演替的数量研究 Ⅰ.群落组成分析

本文采用由植被的空间序列推断时间上演替系列的方法对甘南亚高山草甸弃耕地上的植物群落组成进行了分析。结果表明:(1)弃耕初期,莎草、禾草类在群落中的地位从开始时的71%急剧地下降到弃耕十二年时的6%;以后随着密丛型的莎草、禾草的侵入,它们地位又开始上升而恢复到30%—40%;杂类草的地位在开始时上升较快,而到了后期又有所下降;毒害草在群落中的地位基本稳定,保持在10%左右。(2)群落的种丰富度、均匀度、Simpson多样性指数随弃耕年限增加而增大,而群落优势度随弃耕年限而减小。(3)优势度-多样性曲线在弃耕初期为几何分布型,中后期演变为对数正态分布型,而对放牧顶极群落又近似于MacArthur分布型。     

两种外生菌根真菌对镉胁迫的生理生态响应

为了解彩色豆马勃(Pisolithus tinctorius,Pt)和褐环乳牛肝菌(Suillus luteus,Sl)的耐镉(Cd)机制和Cd积累特征，本研究分析了Pt和Sl在3个Cd²⁺浓度(0.1、1.0和10.0 mg·L^-1)下细胞形态、胞外分泌物和抗氧化物质等的生理生态变化。结果表明：Sl细胞发生质壁分离且细胞壁明显增厚，而Pt细胞变形严重且内含物大量流出；Pt和Sl均可分泌异羟肟酸型铁载体；不同有机酸的分泌量因菌株不同而表现出多样性，其中琥珀酸是Pt和Sl主要分泌的有机酸；此外，Pt和Sl抗氧化酶活性及非酶抗氧化物质含量的变化也因菌株不同而异；随Cd²⁺浓度的增加，Pt和Sl抗坏血酸过氧化物酶(APX)活性和抗坏血酸(AsA)含量均有明显的增加趋势；超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)、谷胱甘肽还原酶(GR)活性及还原型谷胱甘肽(GSH)含量变化不同，其中Pt GSH含量与GR活性呈现相反的变化趋势，低浓度Cd胁迫使Pt和Sl的SOD活性显著增强，Pt的CAT活性先降低后升高。综上所述，Pt和Sl...