生物DNA条形码:十年发展历程、研究尺度和功能

DNA条形码为现代生物学研究提供了丰富的分子信息、标准的数据平台和通用的技术规程。本文从动物、植物和微生物等三方面简要梳理了生物DNA条形码近十年来的兴起和发展历程。参照DNA条形码特征,将其生物学功能归纳为基本功能(如储备数据、鉴别物种)、延伸功能(如构建系统发育关系、服务特定行业、编制新一代生物图志)以及潜在功能(如物种整合)等三类。根据研究尺度,划分出类群(主要是专科专属类研究)、群落(以自然保护区和大型固定样地构成的生物群落)和区域(生物多样性热点地区)等三个水平。列出了国际生命条形码组织开展的十大类研究项目,从系统与分类学、生物多样性保护、系统发育进化生态学和数字化平台建设等四个方面分析了DNA条形码方法涉及的若干重要科学议题,并指出在各学科应用时可能遇到的问题。DNA条形码技术在生物科学领域潜力巨大,但还需在研究和论证过程中不断完善。     

军民融合区域协同医疗信息化平台的建设与应用

军民融合区域协同医疗信息化平台的主要功能包括公众服务、医疗机构协同、社区卫生保健、妇幼保健、政府管理决策支持及第三方服务等。信息化平台的应用有效缓解了“看病难、看病贵”的矛盾,推动医疗卫生机构的发展,强化卫生行政部门监管职能,促进了军队卫生事业的发展。     

以基地平台为抓手,促进生物技术创新与转化

生物技术领域技术创新与成果转化类基地平台是开展生物技术关键技术研究,推动应用示范、成果转化及产业化的重要载体。通过对近年来我国生物技术领域技术创新与成果转化类基地平台发展现状进行梳理分析,探讨基地平台在促进生物技术创新与转化中的作用,总结优势和不足,为其今后的发展建设提供参考和借鉴。     

我国生物技术基地平台现状与发展建议

生物技术是21世纪以来新一轮科技革命和产业变革的核心,而生物技术基地平台是开展生物技术研究、生产和服务的载体,是生物技术创新体系的重要组成部分。对世界主要发达国家及我国生物技术基地平台的总体规模和建设情况进行梳理分析,并借鉴国外经验,提出改进我国生物技术基地平台建设的政策建议,以供参考。     

生物基丁二酸产业化发展及态势分析

<正>丁二酸作为一种重要的四碳化合物,在工业上,无论是在中间产物、有机合成材料还是专用化学品中,都起到了平台化合物的作用,尤其在农药、食品、燃料、染料、香料、塑料、油漆和材料工业得到了广泛的应用,而生物基丁二酸以其具有节约大量的石油资源并且可以降低由石化方法产生的污染等优点而受到广泛关注。随着生物基丁二酸的工业化技术趋于成熟,全球生物基丁二酸大规模商业化项目也出现陆续投产现象。对丁二酸市场现状及趋势、生物基丁二酸生产企业竞争态势以及产业化技术进行了分析。     

美国Verdezyne公司扩大生物基十二烷二酸产能

2014年4月21日,美国Verdezyne公司宣布,利用其拥有专利的酵母平台技术和下游过程技术,成功生产了1吨多生物基十二烷二酸（dodecanedioicacid,DDDA）。密歇根生物技术研究所（MichiganBiotechnologyInstitute,MBI）和密歇根州立大学（MSU）生物经济研究所（BioeconomyInstitute,BEI）帮助Verdezyne公司在4000L规模的装置上进行了试生产。     

酿酒酵母生物基化学品转化合成平台的研究进展

<正>酿酒酵母作为极具潜力的细胞工厂。近年来被广泛应用于合成各种生物基化学品的研究。文章介绍了酿酒酵母作为细胞工厂的特点和优势,从拓展底物范围、加强前体物供给以及优化产物合成三个方面介绍了以酿酒酵母作为转化合成平台,生产生物燃料、大宗化学品或精细化学品等的研究进展,并举例介绍了优化丁醇和青蒿素前体青蒿酸及紫穗槐二烯的合成的相关进展。     

兔后交叉韧带断裂后外侧胫骨平台退变的组织学研究

目的：探讨兔后交叉韧带（Posterior cruciate ligament,PCL）断裂对外侧胫骨平台组织学的影响。方法：48只家兔膝关节随机配对为实验侧和对照侧造模,造模后第4、8、16、24周各随机处死12只,行外侧胫骨平台大体观察、HE染色、免疫组化检测基质金属蛋白酶13（matrix metalloproteinase-13,MMP-13）、基质金属蛋白酶抑制剂1（Tisse inhibitor-1 of matrix metalloproteinasel,TIMP-1）表达。结果：①大体观察,随时间延长,实验组外侧胫骨平台软骨出现磨损,呈灰黄色,弹性差,骨赘形成。②组织学观察,随时间延长,胫骨平台软骨纤维化,细胞排列紊乱,簇聚细胞出现频率增加。⑧实验组MMP-13、TIMP—1表达均高于对照组,有显著性差异。P〈0．05。④实验组MMP-13、TIMP-1表达阳性率第4、8、16周逐渐升高,24周下降,各组比较有显著性差异,P〈0．05。结论：①兔膝关节PCL断裂会引起外侧胫骨平台软骨退行性变,且该退变随着时间的推移逐渐加重。②MMP-13与TIMP-1在PCL断裂膝关节外侧胫骨平台中的表达呈现先高后低的变化规律,造成MMP-13与T1MP-1的失衡,加速软骨退变。⑨MMP-13与T／MP-1表达增高提示MMP-13与TIMP—1可能参与了PCL断裂后外侧胫骨平台软骨的退变过程。     

以色~lJCompugen公司用动物模型验证新型多肽阻断蛋白的相互作用

20l1年3月7日,以色列Compugen公司宣布,利用专有的蛋白质相互作用阻断剂（protein．proteininteractionblockers,PPIb10Ckers）平台开发出新型多肽CGEN．25068,在动物实验上取得了好成绩。CGEN．25068在免疫反应过剩的特定疾病中发挥着重要作用,被设计来阻止某些蛋白质之间的相互作用。阻止嗜中性白细胞（neutrophil）和单球细胞表达的靶标蛋白与其他蛋白质相互作用的CGEN一25068,     

蛋白质网络聚类算法分析平台的设计与实现

蛋白质网络聚类是识别功能模块的重要手段,不仅有利于理解生物系统的组织结构,对预测蛋白质功能也具有重要的意义。针对目前蛋白质网络聚类算法缺乏有效分析软件的事实,本文设计并实现了一个新的蛋白质网络聚类算法分析平台ClusterE。该平台实现了查全率、查准率、敏感性、特异性、功能富集分析等聚类评估方法,并且集成了FAG-EC、Dpclus、Monet、IPC-MCE、IPCA等聚类算法,不仅可以对蛋白质网络聚类分析结果进行可视化,并且可以在不同聚类分析指标下对多个聚类算法进行可视化比较与分析。该平台具有良好的扩展性,其中聚类算法以及聚类评估方法都是以插件形式集成到系统中。