通过系统分析揭示组蛋白修饰模式与转录因子结合之间的关联

转录因子对顺势调控元件的选择性结合,在哺乳动物细胞类型特异的基因表达中扮演重要的角色.这个过程受到染色质表观遗传状态的潜在调控.近期,染色质免疫共沉淀结合测序的研究提供了大量泛基因组水平的数据,阐述转录因子结合以及组蛋白修饰的位点,这为系统地研究转录因子和表观遗传标记之间的空间及调控关系提供了基础.该研究对公共数据库中的染色质免疫共沉淀结合测序数据进行整合分析,涉及5个细胞系中的85种转录因子、9种组蛋白修饰,目的是研究转录因子结合位点与组蛋白修饰模式以及基因表达在泛基因组水平上的关联.作者发现,不同转录因子与组蛋白修饰的共定位模式高度一致,并且组蛋白修饰在距离转录因子结合位点约500碱基对的位置富集.作者还发现,转录因子结合位点的占有率与活性组蛋白修饰的水平和双峰模式正相关,并且启动子区域组蛋白修饰的双峰和共定位模式和基因的高转录水平相一致.组蛋白修饰模式、转录因子结合位点的占有率与基因转录之间的关联暗示了细胞可能利用的基因表达调控机制.     

宫颈癌肿瘤标志物的研究进展

宫颈癌相关肿瘤标志物是宫颈癌组织和细胞由于癌基因及其产物的异常表达所产生的抗原和生物活性物质,包括蛋白质、酶、激素、癌基因产物等.近年来肿瘤标志物成为肿瘤基础和临床应用的一个十分活跃的领域.其对宫颈癌的辅助诊断、判别类型、估计预后、评价疗效、定位诊断、靶向治疗等均具有重要指导意义.目前与宫颈癌有关的生物标记物有数十种,包括人乳头状瘤病毒感染、细胞周期调节蛋白、细胞凋亡相关因子等.随着研究的深入,这些生物标记物在临床上已显示出广阔的应用前景.     

TCT、HPV检测在宫颈锥切术后复发中的预测价值

目的:评估薄层液基细胞学检查(thinprep cytologic test,TCT)和人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)检测在宫颈锥切术后复发中的预测价值。方法:随访531例病理诊断为子宫颈上皮内瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)Ⅱ-Ⅲ级接受宫颈锥切术的患者,分别于术后3、6个月及术后每6-12月随访1次,以TCT及HPV检测作为随访的检测指标,若二者有一项异常,行阴道镜下活组织检查,病理证实存在子颈上皮内瘤变Ⅰ-Ⅲ级者视为复发。采用敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值表示TCT、HPV检测性能。结果:531例患者中10%(54例)的患者出现不同级别的病变复发。TCT在术后预测病变复发的灵敏度77%,特异度72%;HPV在术后预测病变复发的灵敏度95%,特异度60%,TCT联合HPV预测病变复发的灵敏度100%,特异性80%。术后HPV负荷量100 RLU/PC者较HPV负荷量100 RLU/PC者而言术后病变复发的风险增高,差别有统计学意义(P0.01),术后HPV负荷量100 RLU/PC是锥切术后病变复发的高危因素。结论:使用细胞学联合HPV检测是有效的预测宫颈锥切术后病变复发的方法,术后高HPV负荷量与病变复发相关,并可对术后复发高风险人群进行分流,临床需严密随访。     

听觉对拟环纹豹蛛(Pardosa pseudoannulata)定位猎物的影响

为探明蜘蛛的听觉感受器在寻觅定位猎物中的作用,在实验室内比较拟环纹豹蛛(Pardosa pseudoannulata)对有果蝇振翅声源端和无声源端的反应。结果表明:近距离内,拟环纹豹蛛对有声源端选择指数显著高于无声源端,但距离增大至15 cm后,拟环纹豹蛛选择指数无显著差异;拟环纹豹蛛停留时间也呈类似变化,距离12 cm内,拟环纹豹蛛在有声源端停留时间较长,多于总观察时间的1/2,且拟环纹豹蛛在有声源端停留时间显著高于无声源端,距离增加后,拟环纹豹蛛对声音敏感程度下降,停留时间无显著差异;总之,离声源距离越近,拟环纹豹蛛对声音的敏感性越高,随着距离增加,敏感性逐渐降低,声源间距与拟环纹豹蛛成功定位猎物有明显负相关性,拟环纹豹蛛在一定距离下可以依靠听觉定位猎物;另外,拟环纹豹蛛性别对听觉感受器的敏感度有一定影响,雌性拟环纹豹蛛对果蝇振翅声音更为敏感,选择指数更高。     

P—gP、MRP1、GST-П与新疆维吾尔族宫颈癌新辅助化疗疗效的相关性研究

Ig1的：探讨新疆维吾尔族宫颈癌新辅助化疗前后P-gP、MRPI和GST-П的表达及其与化疗疗效的关系。方法：运用S-P法分别检测维吾尔族妇女宫颈鳞癌组织22例新辅助化疗前后及正常宫颈组织20例P-ge、MRPI和GST-TF的表达水平。结果：①新疆维吾尔族正常宫颈、初治宫颈癌组织中P—gp的阳性表达率分别为10％、40．9％;MRP1的阳性表达率分别为15％、31．8％;GST-П的阳性表达率分别为45％、9．01％。P．gP和GST．丌在各组间比较差异均有统计学意义（P〈0．05）MRP1差异无统计学意义（P〉0．05）。@NACT后宫颈癌组织中P．Pg阳性表达显著上升（P〈0．05）,有统计学意义。NACT后宫颈癌组织中MRP1、GST-П阳性表达上升但差异无统计学意义（P〉0．05）。⑨新疆维吾尔族妇女新辅助化疗前宫颈鳞癌组织中P—gP、MRP1及GST-Tr表达阴性和阳性患者NACT有效率无显著性差异（P〉0．05）。结论：P-pg、MRP1、GST-П无法作为化疗敏感性指标预测维吾尔族宫颈鳞癌新辅助化疗疗效     

我的未来不是梦——关注大熊猫基因组图

遗传学家,DNA结构发现者,诺贝尔奖得主,詹姆斯·沃森曾经说过:"过去,我们认为命运是天数;现在,我们知道命运在很大程度上取决于基因"。如今,几乎所有生物学领域、任何研究对象的科学研究都离不开基因。同是诺贝尔奖获得者的约翰·萨尔斯顿更是用一句话解析了基因研究在现代生命科学研究领域的重要地位"现代的生物学研究,已经离不开基因库"。     

嵌合鞭毛蛋白和壳聚糖/三聚磷酸(CS/TPP)纳米凝胶封装对鼻接种幽门螺杆菌黏附素诱导的免疫应答的佐剂作用

[目的] 幽门螺杆菌黏附素A（HpaA）是幽门螺杆菌疫苗的一种有希望的抗原。探索嵌合鞭毛蛋白（cFLN）和壳聚糖/三聚磷酸（CS/TPP）纳米凝胶包封对鼻递送抗原HpaA诱导的免疫应答增强的佐剂作用。[方法] 通过将鼠伤寒沙门氏菌鞭毛蛋白FliC的D0、D1结构域与幽门螺杆菌鞭毛FlaA的D2、D3结构域相结合,构建嵌合鞭毛蛋白cFLN。作为分子内佐剂,嵌合鞭毛蛋白cFLN与黏附素（HpaA）连接构建复合抗原cFLN-HpaA。cFLN、HpaA、cFLN-HpaA在重组大肠杆菌中表达,并通过Ni-NTA预装色谱柱进行纯化。使用离子凝胶法分别将cFLN、HpaA、cFLN-HpaA包封到壳聚糖/三聚磷酸（CS/TPP）纳米凝胶中。[结果] 成功表达和纯化了cFLN、HpaA和cFLN-HpaA,并用离子凝胶法将这3种抗原包封在CS/TPP/纳米凝胶中,制备了包封cFLN的CS/TPP纳米凝胶（cFLN-HpaA NG）、包封HpaA的CS/TPP纳米凝胶（HpaA NG）、包封cFLN-HpaA的CS/TPP/纳米凝胶（cFLN-HpaA NG）。经鼻免疫小鼠后,与HpaA相比,cFLN-HpaA分别导致血清中IgG、IgG1和IgA含量增加2.09倍、1.4倍和2.62倍。与cFLN、HpaA和cFLN-HpaA相比,cFLN NG、HpaA NG和cFLN-HpaA NG分别使血清中IgA、IgG、IgG1和IgG2a的含量增加了1.28至1.71倍。[结论] cFLN和CS/TPP NG可以显著增强鼻腔输送的HpaA诱导的体液免疫。通过检测鼻腔免疫后胃黏膜中IFN-γ、IL-4、IL-17和SIgA的含量,与HpaA相比,cFLN-HpaA分别诱导IFN-γ、IL-4和SIgA的含量增加1.38、1.16和1.58倍。与cFLN-HpaA相比,cFLN-HpaA NG分别使小鼠胃黏膜中IFN-γ、IL-4、IL-17和SIgA的含量增加1.81、1.71、2.16和2.1倍。表明cFLN和CS/TPP NG可以显著增强Th1和Th17型免疫应答。小鼠体内免疫原性研究表明,分子内佐剂cFLN和纳米凝胶包封不仅可以有效增强鼻腔输送HpaA诱导的体液免疫应答,而且还可以增强小鼠胃黏膜中的黏膜免疫应答——Th1和Th17型免疫应答。因此,这些结果表明,cFLN-HpaA NG可能是有希望的经鼻输送的用于预防幽门螺杆菌感染的疫苗系统。     

组蛋白去乙酰化酶3对外周CD4+ T细胞分化的影响

目的 探讨组蛋白去乙酰化酶3（HDAC3）对外周CD4⁺ T细胞分化及功能的调控作用。方法 采用CD4cre酶介导Hdac3杂合基因缺失小鼠（Hdac3^fl/flCD4^cre+/-）及其野生型正常对照小鼠（Hdac3^fl/fl，WT），流式细胞术检测HDAC3缺失对外周CD4⁺和CD8⁺ T细胞比例和数量的影响；在体外佛波酯（PMA）和离子霉素（Ionomycin）刺激条件下，流式细胞术检测HDAC3缺失对CD4⁺ T细胞中IFN-γ、IL-4和IL-17A的表达以及Tfh细胞产生的影响；采用ELISA检测HDAC3缺失对小鼠血清IFN-γ、IL-4和IL-17表达的影响；分选Hdac3^fl/flCD4^cre+/-和WT小鼠外周初始CD4⁺ T细胞，分别在Th1和Th2分化条件下培养，细胞内染色检测HDAC3缺失对Th1、Th2以及Th17相关细胞因子及其特异转录因子表达的影响；采用Microarray检测HDAC3缺失对CD4⁺ T细胞分化亚群相关基因表达的影响；采用链脲佐菌素（STZ）处理小鼠构建I型糖尿病（TIDM）疾病模型，检测HDAC3缺失对T1DM发病的影响。结果 与WT小鼠相比，Hdac3^fl/flCD4^cre+/-小鼠外周CD4⁺和CD8⁺ T细胞的比例和数量显著降低。Hdac3^fl/flCD4^cre+/-小鼠CD4⁺ T细胞及血清中IFN-γ的表达显著降低，而IL-4和IL-17A的表达显著增加，Tfh细胞比例也显著增加；HDAC3缺失抑制体外培养CD4⁺ T细胞向Th1分化但促进其向Th2分化；Microarray检测发现HDAC3缺失导致Th1型细胞谱系基因表达降低，而Th2、Th17以及Tfh细胞谱系基因表达增加；在STZ诱导条件下，HDAC3缺失抑制小鼠T1DM的发生和CD4⁺ T细胞向Th1分化。结论 HDAC3促进外周CD4⁺ T细胞向Th1细胞分化并加重T1DM的发生。