Process-oriented ecological modeling approach and scientific workflow system

A scientific workflow system is designed specifically to organize, manage and execute a series of research steps, or a workflow, in a given runtime environment. The vision for scientific workflow systems is that the scientists around the world can collaborate on designing global-scaled experiments, sharing the data sets, experimental processes, and results on an easy-to-use platform. Each scientist can create and execute their own workflows and view results in real-time, and then subsequently share and reuse workflows among other scientists. Two case studies, using the Kepler system and BioVeL, are introduced in this paper. Ecological niche modeling process, which is a specialized form of scientific workflow system included in both Kepler system and BioVeL, was used to describe and discuss the features, developmental trends, and problems of scientific workflows.     

表皮生长因子受体基因突变检测方法改进及初步临床验证

目的:改进现有的检测表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的荧光PCR法并开发出新的试剂盒,将其与直接测序法和ARMS法进行对比,验证该试剂盒用于临床诊断的敏感性、特异性和准确性。方法:收集2013年6月至2015年8月手术确诊的141例非小细胞肺癌(NSCLC)的石蜡包埋组织标本。采用盲法分别使用直接测序法、ARMS法和新试剂盒检测EGFR突变,比较新试剂盒与其他两种检测方法的差异,结果不一致时采用三种方法分别重复检验一次。结果:三种方法检测成功率均为100%,新试剂盒与直接测序法测得结果完全一致的比率达75.9%(107/141),在直接测序法测得的96例突变阳性中,92例在新试剂盒检测中得到验证(95.8%)。而直接测序法显示突变阴性的45例中,新试剂盒检测发现了23例突变阳性,两种检测方法的结果存在统计学差异(x2=40.745,P0.05)。与直接测序法进行比较,新试剂盒检测EGFR突变的敏感性、特异性分别为95.8%、48.9%,阳性预测值、阴性预测值分别为80.0%、84.6%,检测准确度为80.9%。以ARMS检测法为金标准,新试剂盒测得结果完全一致的比率达84.4%(119/141),两者的一致性比较好(K=0.749,P0.05),敏感性、特异性分别为94.1%、86.4%。结论:改进后EGFR基因突变检测的试剂盒在技术上较好地控制了检测结果的假阳性和假阴性,该检测方法较直接测序法具有更好的敏感性和准确性,与现有的ARMS法一致性较高。     

PowerLab生理数据采集分析系统简介

澳大利亚ADInstruments是生命科学领域全球领先的计算机数据采集分析系统制造商。从创始至今20余年来，公司产品的不断发展和对客户需求的紧密关注使得我们的系统被科研和教育工作广泛选用。名的PowerLab（MacLab）系统是ADInstnanents的核心产品，它为生命科学的科研和教学工作提供了优秀的工具，已经成为全球使用最为广泛的生物信号采集分析系统之一，在世界各个国家广泛用于生命科学的各个领域。     

封面故事

<正>生物系统中存在大量相对独立的、具有特定生物功能的网络模块,其中自调控(或自反馈)环路是最典型、最简单的调控网络模块。对于某些模式生物,自反馈环路已经被辨识,例如,在模式生物E.coli的转录网络中,超过40%的转录因子都依赖于     

研究表明蝗虫走路不凭“感”觉靠“视觉”

一项新研究发现，蝗虫并不是靠“感觉”走路，而是依靠“视觉”精确定位自己的每一步，这表明人类可能低估了蝗虫的视觉导向系统。此前研究表明，昆虫大多靠触角等器官凭“感觉”行走或飞行，依靠视觉引导行走对于脑部较小的昆虫来说似乎过于高级。     

小型SPECT／CT系统研制成功

日前，中科院高能物理研究所研制成功的小型SPECT／CT系统，性能指标达到国际同类设备的先进水平，通过了专家验收。     

基于孔径编码技术的γ射线成像系统通过专家验收

中国科学院计划财务局于2012年5月29日组织专家对高能物理研究所承担的院重大科研装备研制项目“基于孔径编码技术的γ射线成像系统”进行了现场验收。     

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便携多路环境数据采集系统

便携多路环境数据采集系统姜仕仁，常杰，葛滢（杭州大学生物科学与技术系，３１００１２）ＡＰｏｒｔａｂｌｅＭｕｌｔｉ－ＰａｓｓａｇｅＥｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌＤａｔａＡｕｔｏ－ＳａｍｐｌｉｎｇＳｙｓｔｅｍ．￥ＪｉａｎｇＳｈｉｒｅｎ；ＣｈａｎｇＪｉｅ；Ｇｅ...