RNA:诱导基因沉默

在生物体中,双链RNA(double-strand RNA,dsRNA)裂解后的小RNA可以诱导细胞质和基因组水平外源基因沉默。所谓基因沉默(gene silencing)是指生物体中特定基因由于种种原因不表达。小RNA能诱导互补信使RNA在转录后降解。RNA沉默是基因组水平的免疫现象,代表了进化过程中原始的基因组对抗外源基因序列表达的保护机制,在动植物进化中起着重要作用,RNA沉默具有抵抗病毒入侵、抑制转座子活动等作用,并调控蛋白编码基因的表达,具有十分诱人的应用前景。     

鱼腥藻PCC7120细菌光敏色素缺失突变体的自催化重组研究

采用聚合酶链式反应（PCR）从鱼腥藻PCC7120 DNA中扩增出细菌光敏色素缺失突变体基因aphA（26-320）、aphA（27-320）、aphA（28-320）、aphA（29-320）和aphA（32-320）。利用表达载体pET30a进行高效表达,获得的AphA缺失突变体脱辅基蛋白在一定的反应体系下与藻蓝胆素进行了体外重组的研究。研究表明：AphA（26-320）体外重组获得的色素蛋白具有与植物光敏色素相似的可逆光致变色效应,同时酸性尿素变性实验和Zn^2＋荧光电泳实验显示藻蓝胆素和以上蛋白质发生共价连接。AphA（26-320）与藻蓝胆素重组产物的Pr／Pfr吸收峰处于660／610nm。其他4个缺失突变体,AphA（27-320）、AphA（28-320）、AphA（29-320）、AphA（32-320）和藻蓝胆素的重组产物中则没有发现可逆光致变色信号,表明这些缺失突变体不能和藻蓝胆素发生自催化重组。维系细菌光敏色素AphA与色素自催化连接的裂合酶结构域位于AphA（26-320）包含的肽链之中。     

鸡大肝大脾病毒RT—PCR检测方法的建立及其检测

鸡大肝大脾病(Big liver and spleen disease,BLS)是发生于商品代肉用产蛋母鸡的一种传染性疾病,1980年最先在澳大利亚发现,1988年Handlinger等对该病进行了描述.感染鸡直到性成熟后才出现临床症状,仅表现为精神沉郁、产蛋下降或达不到产蛋高峰.死亡率为1%.剖检患鸡或死亡鸡见肝脏、脾脏肿大,呈现腹膜炎和肠炎.     

HPV感染、FHIT蛋白表达与非小细胞肺癌的相关性研究

目的探讨人乳头瘤病毒感染在NSCLC发生中的病因学意义,同时分析FHIT蛋白表达与NSCLC发生及HPV感染的关系.方法采用PCR方法选用通用型引物和HPV16、18型特异性引物分别对42例NSCLC及14例肺良性病变组织进行检测.免疫组化SP法检测FHIT蛋白的表达水平.结果 HPV DNA检出率肺癌组为42.9%,肺良性病变组为7.1%,二者有显著性差异(P<0.05).HPV感染率在肺鳞癌(53.6%)显著高于腺癌(21.4%),且随着分化程度降低,其感染率增高,在吸烟患者(57.7%)显著高于不吸烟患者(18.8%);FHIT蛋白异常表达率肺癌组为61.9%,与肺良性病变组(28.6%)比较有显著性差异(P<0.05).肺癌中HPV阳性组FHIT蛋白异常表达率为83.3%,明显高于HPV阴性组(45.8%,P<0.05).结论 HPV感染与NSCLC组织学类型、分化程度及吸烟有关,它可能是导致NSCLC发生的重要病因学因素之一;FHIT蛋白异常表达与NSCLC发生及HPV感染有关,HPV可能通过诱导FHIT表达异常参与NSCLC的发生发展过程.     

逆转录-聚合酶链式反应技术检测"歇马杏"主要病毒

目的：调查“歇马杏”携带主要病毒的情况。方法：利用作者已建立的ACLSV、PNRSV和PDVRT—PCR检测体系对4宁省大连市地方特产“歇马杏”田间植株携带三种病毒的情况进行了调查。结果：被检植株ACLSV、PNRSV和PDV的单独感染率分别为83．33％、83．33％和190％,复合感染率达到76．67％,但带毒程度不同。     

基质金属蛋白酶2、9和血管内皮生长因子在碱烧伤小鼠角膜组织中的表达

采取滤纸片放置法,用1mol／L的NaOH在小鼠角膜中央进行碱烧伤,建立动物模型。取烧伤前和烧伤后的小鼠角膜制备组织切片,用抗MMP2、抗MMP9和抗VEGF的抗体分别进行免疫组化染色,检测它们在碱烧伤前后的小鼠角膜组织中的蛋白表达情况;提取碱烧伤前和碱烧伤后不同时间点的小鼠角膜组织的总RNA并进行逆转录,以获得的逆转录产物作为模板,用特异的引物和探针进行实时定量PCR,分别检测MMP2、MMP9和VEGF在碱烧伤前后的小鼠角膜组织中转录水平的变化;提取碱烧伤前后小鼠角膜的蛋白组分,用明胶底物酶谱的方法检测其中MMP2和MMP9的活性变化。结果表明,浸透1mol／L的NaOH的滤纸小片,对小鼠角膜进行碱烧伤可以有效地诱导角膜新生血管形成,烧伤后3-4d就有明显的新生血管形成,至第8、9d左右开始退行。免疫组化结果显示,正常角膜中没有MMP9和VEGF表达,MMP2表达极低;碱烧伤后3种因子的表达均上升。实时定量PCR的结果显示MMP2在碱烧伤后表达升高,第3d达到最高随后下降;MMP9在正常角膜组织中没有表达,碱烧伤后第1d达到最高之后开始下降;VEGF在正常角膜中也没有表达,碱烧伤后第4d达到高峰之后开始下降。以上结果说明碱烧伤后的角膜组织中MMP2、MMP9和VEGF的表达均经历先上升后下降的变化,与角膜愈合及新生血管发育和退化过程相吻合。     

RNAi作用机制与抗病毒研究

RNA干扰是指导入针对特异靶基因产物的同源双链RNA可导致细胞特定基因缺失或减退的显型,是体内抵御外源感染的一种重要保护机制。目前,RNA干扰作为一种简单、有效的代替基因敲除的遗传工具,正在被用于功能基因组学、基因治疗、基因表达调控等多个研究领域。本文主要综述了RNA干扰发生的机制,并兼述其在抗病毒方面的应用。     

大肠杆菌和志贺氏菌O 抗原糖基转移酶与聚合酶的生物信息学研究

利用生物信息学手段对大肠杆菌和志贺氏菌的110个O抗原糖基转移酶与39个O抗原聚合酶的序列进行分析,探讨这两种酶的序列和结构特点。统计了其序列一致性,密码子使用和（G+C）%含量的特点;讨论了O抗原糖基转移酶和聚合酶对底物的特异性;推测了6组糖基转移酶的功能;通过对蛋白拓扑结构的预测,发现O抗原聚合酶中广泛存在一个位于细胞周质中的亲水环（Loop）,是可能的功能区域;通过对蛋白高级结构的预测,发现O抗原糖基转移酶属于两个不同的蛋白超家族。     

鳞翅目昆虫基因组中微卫星DNA的特征以及对其分离的影响

本文根据我们对鳞翅目昆虫棉铃虫和松毛虫以及其它动物 (筏蜘蛛、朱、鳕鱼和飞蝗 )的微卫星富集性基因组DNA文库的筛选和分析结果 ,结合其它实验室已发表的资料 ,对鳞翅目昆虫基因组中微卫星DNA的丰度和结构特点进行了较为系统的分析。结果表明 :与其它类群相比 ,尽管鳞翅目昆虫物种间存在差异 ,但其基因组中存在明显偏多的侧翼序列重复的、以多拷贝形式存在的微卫星位点 ,且其中相当一部分以基因家族的形式存在。微卫星DNA家族通常可以在序列分析阶段被识别出来 ,但很多多拷贝位点只有通过一系列后续分析才能被检查出来。这应是鳞翅目昆虫中微卫星位点的优化率相对偏低的主要原因。棉铃虫和松毛虫基因组中三相重复微卫星丰度相对较高 ,从而从某种程度上补偿了这些物种微卫星分离过程中因丰度低、多拷贝位点比例高所带来的困难。棉铃虫微卫星DNA家族侧翼序列中多聚T/A序列的存在表明 ,逆转录转座或逆转录侵染可能是在基因组中形成多拷贝微卫星位点和微卫星DNA家族的重要机制之一