Hydroxychloroquine-mediated inhibition of SARS-CoV-2 entry is attenuated by TMPRSS2

Hydroxychloroquine, used to treat malaria and some autoimmune disorders, potently inhibits viral infection of SARS coronavirus (SARS-CoV-1) and SARS-CoV-2 in cell-culture studies. However, human clinical trials of hydroxychloroquine failed to establish its usefulness as treatment for COVID-19. This compound is known to interfere with endosomal acidification necessary to the proteolytic activity of cathepsins. Following receptor binding and endocytosis, cathepsin L can cleave the SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2 spike (S) proteins, thereby activating membrane fusion for cell entry. The plasma membrane-associated protease TMPRSS2 can similarly cleave these S proteins and activate viral entry at the cell surface. Here we show that the SARS-CoV-2 entry process is more dependent than that of SARS-CoV-1 on TMPRSS2 expression. This difference can be reversed when the furin-cleavage site of the SARS-CoV-2 S protein is ablated or when it is introduced into the SARS-CoV-1 S protein. We also show that hydroxychloroquine efficiently blocks viral entry mediated by cathepsin L, but not by TMPRSS2, and that a combination of hydroxychloroquine and a clinically-tested TMPRSS2 inhibitor prevents SARS-CoV-2 infection more potently than either drug alone. These studies identify functional differences between SARS-CoV-1 and -2 entry processes, and provide a mechanistic explanation for the limited in vivo utility of hydroxychloroquine as a treatment for COVID-19.     

溶藻细菌BS01产二异丁氧基苯基对塔玛亚历山大藻生长的影响

摘要:【目的】利用一株溶藻细菌BS01分泌的杀藻化合物(二异丁氧基苯基)胺作用于赤潮藻———塔玛亚历山大藻(Alexandrium tamarense),研究该化合物对塔玛亚历山大藻的作用效果及可能的作用机制。【方法】利用10和20μg/mL的杀藻化合物处理塔玛亚历山大藻,观察藻细胞的响应。【结果】研究发现,利用20μg/mL的杀藻化合物处理藻,24 h后杀藻率达到84.1%,此时细胞内叶绿素a的含量仅为对照的58.5%。而当对藻细胞最大光化学效率(Fv/Fm)进行测定时发现,20 μg/mL的浓度处理24 h后,最大光化学效率相比于对照细胞降低了55.5%,这说明藻细胞的光合作用过程受到抑制。细胞内部的活性氧(ROS)水平在处理0.5 h后即开始增高,并导致细胞内部的脂质过氧化,使细胞内丙二醛(MDA)的含量上升。藻细胞的抗氧化酶如超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)的活性也有不同程度的增高,以清除细胞内部的活性氧。利用透射电镜观察发现,20 μg/mL的浓度处理24 h后,细胞内重要的细胞结构解体,细胞严重空泡化,显示出细胞死亡的特征。【结论】杀藻化合物(二异丁氧基苯基)胺能够通过引起藻细胞内部氧化损伤的方式引起藻细胞的死亡,同时该化合物仅针对少数几种藻类具有杀藻效果,因此该杀藻化合物在赤潮的治理方面具有较好的应用前景。     

高硫高砷金精矿生物预氧化条件优化

摘要:【目的】研究温度以及返回液添加量对体系中氧化效果以及金(Au)氰化浸出率的影响。【方法】针对某高硫高砷金精矿建立了一套连续生物预氧化体系(氧化时间6 d),比较不同的温度(40℃和45℃)和返回液添加量(0和600mL)对生物预氧化效果的影响:间隔8 h连续测定氧化体系中的氧化液、氧化渣以及氰化渣中的总Fe、总S、总As以及SO4 2－和Au含量;并用16S rRNA基因克隆文库的方法对体系中的浸矿菌群结构进行分析。【结果】结果显示,提高温度和添加氧化返回液都会改变体系:升高温度在一定程度上提高了体系的氧化程度,主要表现为显著降低了尾渣中总铁、总硫含量,显著提高了尾渣中的S6 + 比例,并且降低前三槽氧化体系的耗碱量;投加返回液则会降低体系的氧化程度,主要表现为显著提高了尾渣金品位和铁含量,显著降低了尾渣中的S6 + 以及Au 浸出率;Dissimilarity和DCA结果表明温度变化对体系的影响更为显著;氧化过程中的Au 浸出率、硫氧化率以及As 去除率,三者互为显著正相关;克隆文库结果显示,该浸矿菌群主要包括3类细菌: Acidithiocacillus caldu (71%)、Leptospirillum ferriphilum (23%)和Sulfobacillus thermosulfidooxidans(6%),基于97%相似性的OTU覆盖率达93.67%。【结论】研究结果表明,相对于添加返回液,温度变化会更显著的改变体系反应效率。提高体系温度有利于矿物的氧化,而添加返回液会降低Au浸出率。本文首次研究了连续生物预氧化过程中温度梯度和返回液添加对体系的影响,本研究结果对中温生物预氧化工业生产的工艺优化、降低工业运行成本具有重要的指导意义。     

Isolation and alga-inhibiting characterization of Vibrio sp. BS02 against Alexandrium tamarense

The bacterium BS02 which is closely related to the genus Vibrio sp. and capable of inhibiting the toxic dinoflagellate Alexandrium tamarense was isolated from a mangrove area in Zhangjiangkou, Fujian Province, China. The bacterium was not species-specific since it displayed varying degrees of lysing activities against eight of the eighteen algae tested. There was a close interaction between initial bacterial and A. tamarense cell densities, indicating that algal growth was prompted at low bacterial concentrations, while the number of the alga cells was reduced at high concentrations. Alga-lysing characterization of Vibrio sp. BS02 suggested that the alga-lysing substance was extracellularly produced, less than 500 in molecular weight, as well as non proteinaceous, stable under wide range of temperature and pH conditions, UV radiation, repeated freezing and thawing and heavy metal treatments. These findings suggested that BS02 could play an important role in controlling harmful algal blooms.     

九龙江口沉积物TCBS(Thiosulfate Citrate Bile Salts Sucrose)菌群的分布

【目的】调查九龙江流域对厦门海域潜在的病原菌"污染",为相关侵染性病害的预防和控制提供有价值的资料。【方法】通过TCBS(Thiosulfate Citrate Bile Salts Sucrose)培养基从九龙江河口沉积物中分离到158株细菌,应用16S rRNA基因-RFLP(限制性酶切图谱多样性分析)及16S rRNA基因序列分析等方法对158株细菌进行分子鉴定。【结果】研究结果表明九龙江口沉积物中分布的TCBS菌群分别属于7个属,其中假单胞菌属(Pseudomonas)占28%,气单胞菌属(Aeromonas)占24%,假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)占19%,希瓦氏菌属(Shewanella)占13%,芽孢杆菌属(Bacillus)占11%,弧菌属(Vibrio)占4%,嗜冷杆菌属(Psychrobacter)占1%。不同站位TCBS菌群的组成及各菌群的相对差异明显,其中上游区域以非嗜盐或耐盐细菌为主,下游区域以嗜盐细菌和耐盐细菌为主,具有典型的河口细菌分布特征。盐度对各TCBS菌群的分布具有重要的影响。弧菌在整个河口区所占的比例不大(6%-19%)且集中在下游区域。【结论】九龙江口存在大量的条件致病菌,其中以气单胞菌属为代表的耐盐菌,对厦门海域存在陆源性污染的风险;绝大多数弧菌属于海洋土著细菌,正常情况下(非流行性弧菌病期间)非来源于九龙江冲淡水的直接污染。     

海洋病毒——海洋生态系统结构与功能的重要调控者

摘要：作为海洋生态系统中的重要成员,海洋病毒在调节海洋生态系统中的群落结构、种群数量、物质循环、生物间遗传物质的转移以及气候变化等方面起着重要的作用。本文概述了近年来对海洋病毒的研究进展,讨论了海洋病毒对海洋生态系统结构和功能的重要调控作用,并对海洋病毒的研究前景进行了展望。     

微生物在碳的海洋生物地球化学循环中的作用

微生物在碳的海洋生物地球化学循环中的作用郑天凌,王海黎,洪华生（厦门大学环境科学研究中心３６１００５）ＲｏｌｅｏｆＭｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓｉｎＢｉｏｇｅｏｃｈｅｍｉｃａｌＣｙｃｌｉｎｇｏｆＣａｒｂｏｎｉｎＯｃｅａｎｓ．￥ＺｈｅｎｇＴｉａｎｌｉｎｇ...