CircCCNB1 silencing acting as a miR-106b-5p sponge inhibited GPM6A expression to promote HCC progression by enhancing DYNC1I1 expression and activating the AKT/ERK signaling pathway

Background: Circular RNAs (circRNAs), which generally act as microRNA (miRNA) sponges to competitively regulate the downstream target genes of miRNA, play an essential role in cancer biology. However, few studies have been reported on the role of circRNA based competitive endogenous RNA (ceRNA) network in hepatocellular carcinoma (HCC). Herein, we aimed to screen and establish the circRNA/miRNA/mRNA networks related to the prognosis and progression of HCC and further explore the underlying mechanisms of tumorigenesis.Methods: GEO datasets {"type":"entrez-geo","attrs":{"text":"GSE97332","term_id":"97332"}}GSE97332, {"type":"entrez-geo","attrs":{"text":"GSE108724","term_id":"108724"}}GSE108724, and {"type":"entrez-geo","attrs":{"text":"GSE101728","term_id":"101728"}}GSE101728 were utilized to screen the differentially expressed circRNAs (DE-circRNAs), DE-miRNAs, and DEmRNAs between HCC and matched para-carcinoma tissues. After six RNA-RNA predictions and five intersections between DE-RNAs and predicted RNAs, the survival-related RNAs were screened by the ENCORI analysis tool. The ceRNA networks were constructed using Cytoscape software, based on two models of up-regulated circRNA/down-regulated miRNA/up-regulated mRNA and down-regulated circRNA/up-regulated miRNA/down-regulated mRNA. The qRT-PCR assay was utilized for detecting the RNA expression levels in HCC cells and tissues. The apoptosis, Edu, wound healing, and transwell assays were performed to evaluate the effect of miR-106b-5p productions on the proliferation, invasion, and metastasis of HCC cells. In addition, the clone formation, cell cycle, and nude mice xenograft tumor assays were used to investigate the influence of hsa_circ_0001495 (circCCNB1) silencing and overexpression on the proliferation of HCC cells in vitro and in vivo. Furthermore, the mechanism of downstream gene DYNC1I1 and AKT/ERK signaling pathway via the circCCNB1/miR-106b-5p/GPM6A network in regulating the cell cycle was also explored.Results: Twenty DE-circRNAs with a genomic length less than 2000bp, 11 survival-related DE-miRNAs, and 61 survival-related DE-mRNAs were screened out and used to construct five HCC related ceRNA networks. Then, the circCCNB1/miR-106b-5p/GPM6A network was randomly selected for subsequent experimental verification and mechanism exploration at in vitro and in vivo levels. The expression of circCCNB1 and GPM6A were significantly down-regulated in HCC cells and cancer tissues, while miR-106b-5p expression was up-regulated. After transfections, miR-106b-5p mimics notably enhanced the proliferation, invasion, and metastasis of HCC cells, while the opposite was seen with miR-105b-5p inhibitor. In addition, circCCNB1 silencing promoted the clone formation ability, the cell cycle G1-S transition, and the growth of xenograft tumors of HCC cells via GPM6A downregulation. Subsequently, under-expression of GPM6A increased DYNC1I1 expression and activated the phosphorylation of the AKT/ERK pathway to regulate the HCC cell cycle.Conclusions: We demonstrated that circCCNB1 silencing promoted cell proliferation and metastasis of HCC cells by weakening sponging of oncogenic miR-106b-5p to induce GPM6A underexpression. DYNC1I1 gene expression was up-regulated and further led to activation of the AKT/ERK signaling pathway.     

外源cGMP调控盐胁迫下黑麦草种子萌发机制

c GMP(cyclic guanosine-3',5'-monophosphate)是一类环化核苷酸,能响应植物非生物胁迫的信号分子。以c GMP的膜透性类似物8-Br-cGMP为供体,研究c GMP对盐胁迫下黑麦草种子萌发及生理指标的影响。通过计算萌发指标、测定种子萌发过程中各项生理指标,探讨c GMP对黑麦草种子萌发时耐盐机制的作用。结果表明:低浓度(50 mmol/L)盐胁迫能促进黑麦草种子的萌发,随着盐浓度(100、150、200、250 mmol/L)的增加黑麦草种子的萌发率逐渐降低甚至抑制其萌发。而加入20μmol/L c GMP能缓解100 mmol/L Na Cl胁迫对黑麦草种子造成的伤害,使黑麦草种子的发芽率、发芽势、发芽指数、活力指数分别提高了7.4%、133.3%、52.1%、104.2%。此外,研究发现加入20μmol/Lc GMP能够促进100 mmol/L Na Cl盐胁迫下黑麦草萌发期根的生长,比单独100 mmol/L Na Cl盐胁迫处理下的黑麦草植株全长、根长、叶长分别提高了2.5、2.8倍和2.6倍,种子在萌发过程中可溶性糖、可溶性蛋白含量、淀粉酶活性,脯氨酸含量分别提高了47.9%、15.7%、94.3%、117.4%,而淀粉含量、MDA含量、电导率,O_2~-产生速率分别降低了40.9%、128.7%、88.6%、211.9%。说明20μmol/Lc GMP通过提高可溶性糖,可溶性蛋白含量及脯氨酸含量,同时减少MDA、O_2~-的产生,以此缓解盐胁迫对黑麦草种子的伤害、同时促进淀粉水解,从而加速种子萌发。     

胶州湾典型河口湿地土壤溶解性无机碳分布特征

选择胶州湾大沽河与洋河河口湿地作为研究区,在平行于海岸带方向的光滩和垂直于海岸带方向的河漫滩分层采集土壤样品,测定土壤溶解性无机碳(DIC)含量、相关离子含量及土壤理化性质.应用Duncan方法及Pearson相关分析法进行分析,探讨土壤DIC分布特征及影响因素.结果表明: 光滩土壤DIC含量总体呈现距入海口越远含量越高的趋势,水体的冲刷作用是导致河流入海口处土壤DIC含量最低的主要原因.河漫滩土壤DIC含量总体呈现随距海距离增加而先降低后升高的趋势,主要是受人类活动等综合因素的影响.互花米草入侵使土壤DIC含量明显降低,这是入侵物种根系的转化作用所导致的.养殖活动改变了养殖池塘自身的环境因子,进而改变了土壤DIC分布规律,表现为表层土壤DIC含量高于光滩而其余土层略低于光滩.相关性分析表明,土壤DIC含量与土壤含盐量及总无机碳含量呈显著正相关、与土壤pH呈显著负相关.     

不同折叠状态的Apocyt．C插膜后构象的研究

比较了不同折叠状态的鸡心脱血红素细胞色素ｃ（Ａｐｏｃｙｔ．ｃ）对大豆磷脂单分子层的插入能力和对酸性、中性磷脂单分子层的插入能力。不同折叠状态的Ａｐｏｃｙｔ．ｃ与大豆磷脂脂质体作用后的内源荧光发射谱提示它们各自在膜上的构象状态不同。与纯磷脂脂质体作用后的圆二色谱发现,溶液中折叠状态不同的鸡心Ａｐｏｃｙｔ．ｃ与膜作用后的构象也不同,溶液中处于无规心Ａｐｏｃｙｔ．ｃ与ＤＭＰＧ脂质体作用后的构象也呈α螺旋,但螺旋含量明显低于前者。折叠状态的鸡心Ａｐｏｃｙｔ．ｃ与ＤＭＰＣ作用后,其构象几乎没有变化。     

低浓度蜂毒素在溶液中的自聚集

低浓度蜂毒素在溶液中的自聚集韩学海,隋森芳（清华大学生物科学与技术系生物膜与膜生物工程国家重点实验室,北京１０００８４）关键词蜂毒素;自聚集;多肽构象蜂毒素（ｍｅｌｉｔｔｉｎ）是由２６个氨基酸残基组成的多肽,是欧洲蜜蜂（Ａｐｉｓｍｅｌｌｉｆｉｃｅｒａ...     

土地利用变化情景下浑河-太子河流域的非点源污染模拟

近年来非点源污染已经成为水污染的主要来源,对非点源污染发生机理和控制方法的研究有着重要的科学和现实意义.为了研究不同土地利用方式对非点源污染的影响,本文基于土地利用变化模型CLUE-S模拟了城市规划、历史趋势和生态保护3个预案下浑河-太子河流域土地利用未来变化.应用SWAT模型对非点源污染进行了模拟研究,并结合实测数据对模拟结果进行了评价.结合两个模型研究了3个土地利用预案下非点源污染对土地利用和景观格局变化的响应.结果表明: SWAT模型在浑河-太子河流域模拟精度较高,该模型在研究区具有适用性.城市规划和历史趋势预案下非点源污染负荷不断增加,城市规划方案下最高,生态保护预案下非点源污染负荷呈不断下降趋势.不同土地利用和景观格局对非点源污染有一定的影响,科学合理的生态建设能够有效减少非点源污染负荷.研究结果可以为流域的非点源污染研究提供案例,为非点源污染防治和最佳管理措施的制定提供科学依据,为相关政策制定提供参考.     

柳树β微管蛋白基因家族的克隆和序列分析

该研究克隆鉴定了旱柳和龙爪柳β微管蛋白基因,并对其进行了序列相似性、系统发育、染色体定位以及表达模式的分析。结果显示,2种柳树β微管蛋白基因家族各有20个成员,家族内部成员间核酸和氨基酸序列相似性分别在74.0%和86.6%以上,种间同源蛋白氨基酸序列相似性在85.8%以上,柳树与其它植物β微管蛋白间的氨基酸序列相似性在81.5%以上。系统发育分析显示,柳树β微管蛋白家族被分为4个亚组,结合杨树β微管蛋白基因染色体定位,推测柳树β微管蛋白基因家族经历了杨柳科全基因组重复事件和串联重复事件,而柳树TUB11和TUB12可能来源于区段重复或者转座。基因表达模式分析发现,该家族成员的表达具有一定的组织特异性,并且部分重复基因对在所检测组织中表达差异较大。柳树β微管蛋白基因家族成员序列的高度相似性、成员数量的进化扩张、以及表达模式的多样性可能赋予了细胞分裂与生长更高的灵活性,这对多年生木本植物的生长发育习性意义重大。     

基于无人机遥感监测滩涂湿地入侵种互花米草植被覆盖度

为了实现对沿海滩涂湿地资源与生态环境的有效管理与利用,需要对区域内的入侵种互花米草进行高精度的监测与分析.本文以福建三沙湾为试验区,以低空无人机获取的可见光和多光谱影像为数据源,对互花米草植被覆盖度进行监测与分析,通过NDVI指数模型获取了多光谱影像的植被覆盖度信息,以可见光影像为参考进行了精度检验.结果表明: 影像区互花米草植被覆盖度以40%～60%和60%～80%的中高和高等级覆盖度为主.NDVI模型估算值与真实值之间的均方根误差RMSE为0.06,决定系数R²为0.92,两者具有较好的一致性.     

心理意象加工的子系统的研究

目的:本文主要探索心理意象加工过程的子系统以及它们之间的相互关系。方法:实验设计了四种不同的二维心理意象任务:再现任务,分辨任务,旋转任务和空间任务,分别用来测量被试对整体图像信息的提取能力,细节意象能力,空间操作和空间认知等心理意象能力的不同方面。91名正常的大学本科生(77男,14女)参加了此次实验。结果:心理意象的整体再现和细节意象能力呈显著相关;空间旋转和空间认知能力呈显著相关;而其他能力之间无显著相关性。结论:实验结果表明心理意象加工过程主要分为相时独立的两个子系统,即对心理意象的再现和操作能力。