Plastid genome sequencing,comparative genomics,and phylogenomics:Current status and prospects

More than 190 plastid genomes have been completely sequenced during the past two decades due to advances in DNA sequencing technologies.Based on this unprecedented abundance of data,extensive genomic changes have been revealed in the plastid genomes.Inversion is the most common mechanism that leads to gene order changes.Several inversion events have been recognized as informative phylogenetic markers,such as a 30-kb inversion found in all living vascular plants minus lycopsids and two short inversions putat...     

Demographic history of the Tibetan antelope Pantholops hodgsoni(chiru)

The Tibetan antelope(chiru,Pantholops hodgsoni),a heavily poached species and symbol of the QinghaiTibetan Plateau(QTP),is noted worldwide for its special calving migration.This species originated in the early Quaternary and it is interesting to know how the following climatic oscillations affected its demographic dynamics in the climate-sensitive QTP.In this study,we analyzed the mitochondrial D-loop region from 312 individuals sampled in all of the six major populations.We found high rates of gene flow and little genetic differentiation between populations,suggesting that the calving migration may have homogenized the genetic pool of this species.Both mismatch distribution analyses and coalescent simulations suggested that this species experienced a demographic expansion approximately 600-200 Kyt following the retreat of the large glaciers developed in the QTP at 800-600 Kyr,rather than at the end of the last glacial age,as previously suggested based on a limited sample size.In addition,we found evidence of a chiru population decrease probably related to the human settings at the QTP during the middle Holocene.     

氮素对短葶飞蓬生长和次生代谢产物积累的影响

以不同氮素供应对短葶飞蓬(Erigeron breviscapus)进行了人工栽培试验,探讨氮素对药用植物生长和次生代谢产物含量及产量的影响作用规律.结果显示:氮素施用量与短葶飞蓬植株生物量呈极显著的正相关;而与灯盏乙素和总咖啡酸酯含量则表现出显著的负相关;对总咖啡酸酯和灯盏乙素的产量没有显著的促进作用.植株灯盏乙素和总咖啡酸酯含量与生物量呈现极显著的负相关;与植株含氮量也存在极显著的负线性关系,变化规律与"碳素/营养平衡假说"预测的一致.研究表明,植株生长与次生代谢有效成分积累间存在一定的权衡关系,过多的施用氮肥提高药材产量时将会导致黄酮等酚类次生代谢有效成分含量下降.     

珙桐中一个与低温相关基因的克隆及其表达研究

低温诱导膜蛋白是由低温诱导表达蛋白基因编码的一类疏水性蛋白,在植物抵御寒冷环境时起着一定的保护作用。从珙桐cDNA文库中获得一个未知基因（DiRCI）,该基因长539bp,其中包括174bp的开放阅读框,92bp的5′末端非编码区和273bp的3′末端非编码区,编码57个氨基酸残基蛋白,在氨基酸水平上同源性较高的是车前草的低温诱导膜蛋白（登入号：ACA66247.1）,其相似性为89.5%。半定量RT-PCR分析发现,25℃以上,该基因在珙桐各器官中基本上均未表达,但经8℃低温处理时,在成熟叶片、叶柄和成熟未萌发的种子中均有表达,但是在根中基本没有表达,进一步研究发现该基因在24h～48h内表达量增多并达到最高值,48h后其表达量逐渐减弱直至消失,说明该基因确实与低温诱导相关,从而初步推测该基因为低温诱导膜蛋白基因。该基因的克隆丰富和保存了珙桐基因资源,并为进一步研究冷胁迫的分子机制奠定了基础。     

夏块菌与青刚栎形成外生菌根形态变化的研究

夏块菌（Tuber aestivum）是一种具有较高经济价值的菌根食用菌。对夏块菌与青刚栎（Cycloba-lanopsis glauca）在形成菌根过程中不同阶段的菌根形态变化进行了研究,结果显示：用夏块菌孢子液接种青刚栎苗后,第14天起开始形成淡乳色的外生菌根,外延菌丝刚毛状;第一至第二个月可形成黄褐色、褐色外生菌根,外延菌丝刚毛或羊毛状。外生菌根为单根,长1～4mm,直径150～250μm。菌套厚12～20μm,平坦或自菌根延伸出刚毛状菌丝,外延菌丝束黄绿色;哈替氏网菌丝直径1～1.5μm。菌根老化后变暗褐或萎缩。外延菌丝束呈黄绿色是夏块菌菌根区别于其它块菌菌根最重要的形态特征。     

利用相互染色体涂色技术分析两株人肺腺癌细胞系(A549和GLC-82)的核型特征

肺癌是全世界癌症死亡中的一个主要的原因。除吸烟外,一些肺癌患者的发病与氡气污染相关。该研究采用包括染色体分选、正向和反向染色体涂色技术,分析了两株肺腺癌细胞系A549和GLC-82的核型特征。A549和GLC-82细胞系都属于非小细胞肺癌细胞系,但诱因不同,后者来源于一个长期生活在氡气污染环境肺癌病人的癌组织。染色体涂色结果表明,这两株肺癌细胞系发生了复杂的染色体重排。在A549和 GLC-82细胞系中,除正常染色体拷贝数变化外,还分别存在13条和24条畸变染色体。约一半的畸变染色体是通过非相互易位形成的,其余的畸变染色体则是通过一些正常染色体的片段缺失或重复而产生的。尽管这两株肺癌细胞系都没有共同的畸变染色体, 但它们似共享两个染色体易位断裂点：HSA8q24和12q14。     

沿江地区土地利用生态风险评价——以长江三角洲南京地区为例

基于改进的相对生态风险模型,从风险源强度、受体暴露度以及风险效应三方面构建土地利用生态风险评价指标体系,以子流域为单元分析南京地区土地利用生态风险空间分异及影响因素,结果表明:综合生态风险值总体分布较分散,高风险区位于江北八百河流域、老山北坡及南坡河系、石臼湖流域,风险源强和受体暴露度较高,风险效应值较低,潜在生态风险很高,应重点实施环境治理,强化土地生态环境建设;较高风险区位于一干河、二干河、句容河、秦淮中游、江宁河、向阳河、固城湖、境外常州太湖流域,风险源强和受体暴露度中等,应加强环境治理,强化土地利用规划引导与集约利用;较低和低风险区包括境外沿江八卦洲、沿江靖安板块、沿江秦淮河、沿江汤水河、沿江滁河、横溪河、牛首河、前进河、马鞍山长江流域,风险源强和受体暴露度较低,风险效应值低,主要分布于沿江以及山地丘陵河流上游地区,沿江流域近年排污治理力度较大有效保证了低风险源强值,而山地丘陵河流上游植被覆盖度一般较高,人为影响相对较弱,应注重生态环境维护和土地集约利用;其他流域综合生态风险中等,应加强生态环境监测,防止生态环境恶化。     

中国新纪录属——异粗额蚜属(半翅目,蚜科)

记述了中国蚜科Aphididae长管蚜亚科Macrosiphinae1新纪录属——异粗额蚜属Anaulacorthum Ghosh & Raychaudhuri,1972;重记述了张家界异粗额蚜Anaulacorthum zhangjiajiensis(Zhang,1992)的形态特征,提供了该种的地理分布与寄主植物信息,绘制了形态特征图。研究标本保存在中国科学院动物研究所国家动物博物馆。     

哺乳动物Toll样受体与组织再生修复

机体损伤后通过诱导组织细胞产生复杂而又相互调控的系列反应,来促进损伤组织的再生.不同细胞因子、生长因子及细胞之间的协调平衡对于组织再生的调节非常重要,免疫系统在此过程中起着极其重要的作用.Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)可识别微生物病原体,在触发机体防御性抗病原微生物免疫反应中发挥着重要作用,是先天免疫系统中必不可少的重要成分,TLRs内源性配体的存在提示TLRs不仅可诱导机体防御性的抗微生物免疫反应,同时还是机体损伤后启动组织再生修复的敏感监测系统.本文概述了TLRs及其内源性配体,以及TLRs在诱导损伤后组织再生中的作用.TLR内源性配体及其在组织再生过程中的作用为促进机体损伤组织的再生修复提供了新的思路策略.     

C型钠尿肽及其受体在急性肺损伤大鼠肺组织的表达变化及其意义

目的了解C型钠尿肽及其受体NPRB在急性肺损伤大鼠肺组织中的表达变化规律。方法采用LPS注射建立ALI大鼠动物模型。将动物分为生理盐水组(N组),LPS干预1 h组(LPS 1 h组),LPS干预3 h组(LPS 3 h组),LPS干预6 h组(LPS 6 h组),通过RT-PCR检测各组大鼠肺组织CNP及NPRB mRNA的表达情况,以及免疫组化检测各组大鼠NPRB的表达变化,以生理盐水组作为阴性对照。结果正常大鼠肺组织可表达CNP及NPRB,LPS干预后,CNP显著升高,LPS 6 h达到高峰,与对照组比较有显著性差异(P0.05);相反,NPRB在LPS干预后出现表达降低,与对照组比较有显著性差异(P0.05)。结论CNP与NPRB的表达变化可能是导致肺损伤加重的重要原因之一。