Genome‐wide association study of callus induction variation to explore the callus formation mechanism of rice

Rice(Oryza sativa) is one of the most widely cultivated food crops, worldwide. Tissue culture is extensively used in rice breeding and functional genome research. The ability to induce callus determines whether a particular rice variety can be subjected to tissue culture and Agrobacterium-mediated transformation. Over the past two decades, many quantitative trait loci(QTLs)related to callus induction traits have been identified;however, individual genes associated with rice callus induction have not been reported. In this study, we characterized three callus-induction traits in a global collection of 510 rice accessions. A genome-wide association study of the rice population in its entirety as well as subpopulations revealed 21 significant loci located in rice callus induction QTLs. We identified three candidate callus induction genes, namely CRL1, Os BMM1, and Os SET1, which Rese are orthologs of Arabidopsis LBD17/LBD29, BBM, and SWN,respectively, which are known to affect callus formation.Furthermore, we predicted that 14 candidate genes might be involved in rice callus induction and showed that RNA interference(RNAi)-mediated disruption of Os IAA10 inhibited callus formation on tissue culture medium.Embryo growth in the Os IAA10 RNAi line was not inhibited by synthetic auxin(2,4-D) treatment, suggesting that Os IAA10 may perceive auxin and activate the expression of downstream genes, such as CRL1, to induce callus formation. The significant loci and candidate genes identified here may provide insight into the mechanism underlying callus formation in rice.     

Plant peroxisomes:Small organelles with versatility and complexity

<正>Peroxisomes are small, highly dynamic, and multifunctional organelles in eukaryotes. Essential to plant survival, peroxisomes house various crucial metabolic activities, such as degradation of hydrogen peroxide(H_2O_2), lipid metabolism, photorespiration, and hormone biosynthesis and catabolism, and remodel their proteome in response to developmental and environmental changes(Hu et al. 2012; Pan and Hu 2018).     

小鼠胸主动脉血管管壁结构和平滑肌细胞表型的年龄变化

目的:通过研究小鼠胸主动脉血管直径和管壁厚度以及平滑肌细胞表型标志物波形蛋白(Vimentin)和平滑肌细胞肌动蛋白(α-SM-actin)的表达,探讨胸主动脉在发育、成熟和老化过程中血管管壁结构和平滑肌细胞表型的变化。方法:将24只昆明小鼠按年龄分成4组:3天组、3个月组、6个月组和16个月组。采用HE染色和免疫荧光术分别观察胸主动脉血管管壁结构以及Vimentin和α-SM-actin的表达变化。结果:随着年龄的增长,胸主动脉血管直径和管壁厚度增加,以16个月小鼠胸主动脉的直径最大和管壁最厚,但细胞密度减少。3天小鼠胸主动脉的Vimentin表达较高,6个月表达下降,16个月重新上调;而α-SM-actin在3天小鼠的胸主动脉表达较低,6个月表达增加,16个月表达出现下调,其差异均有统计学意义(P0.05)。结论:小鼠胸主动脉的直径和管壁的厚度随年龄的增长而增加,而细胞的密度则随着年龄增加而减少;平滑肌细胞的表型从幼龄时的合成表型转变为收缩表型,老龄时又转变为合成表型。     

骨化三醇联合腹膜透析疗法治疗慢性肾功能衰竭的临床疗效及对患者血清ProGRP、Cysc、Chemerin水平的影响

目的:探讨骨化三醇联合腹膜透析疗法治疗慢性肾功能衰竭的临床疗效及对患者血清Pro-Gastrin-Releasing Peptide (ProGRP)、CystatinC(Cysc)、Chemerin水平的影响。方法:选取我院2017年2月至2018年1月收治的98例慢性肾功能衰竭患者,按照随机数表法将其分为观察组(n=51)和对照组(n=47)。对照组采用腹膜透析疗法治疗,观察组采用骨化三醇联合腹膜透析疗法治疗。观察和比较两组治疗前后肾功能指标尿素氮(blood urea nitrogen,BUN)、血清肌酐(Serum creatinine Cr)、24小时尿蛋白(24 h urinary protein,24 h UP),生化指标白蛋白(albumin,Alb)、血红蛋白(hemoglobin,Hb)及红细胞(red blood cell,RBC),胃泌素释放肽前体(ProGRP)、血清胱抑素(Cys C)、趋化素(Chemerin)水平的变化,6个月、1年生存率及不良反应的发生情况。结果:治疗后,观察组BUN、SCr、24hUP水平均显著低于对照组[(13.95±3.06)mmol/L vs.(21.10±3.85)mmol/L,(260.12±40.32)μmol/L vs.(354.93±51.06)μmol/L,(1.75±0.45)g/24 h vs.(2.67±0.80)g/24 h](P0.05);Alb水平显著低于对照组[(27.85±3.58)g/L vs.(33.06±4.27)g/L](P0.05);Hb、RBC显著高于对照组[(91.72±13.46)g/L vs.(82.36±10.15)g/L,(379.47±92.08)×1012/L vs.(315.70±73.24)×1012/L](P0.05);ProGRP、Chemerin水平显著低于对照组[(49.23±4.72)pg/mL vs.(63.87±7.30)pg/mL,(37.02±6.15)μg/L vs.(30.63±4.81)μg/L](P0.05);Cysc水平显著高于对照组[(80.75±16.08)mL/min vs.(98.81±18.07)mL/min](P0.05);6个月、1年生存率均显著高于对照组[96.08%(49/51) vs. 91.49%(43/47),90.20%(46/51) vs. 74.47%(35/47)](P0.05);不良反应总发生率显著低于对照组[17.65%(9/51) vs. 44.68%(21/47)](P0.05)。结论:骨化三醇联合腹膜透析疗法治疗慢性肾功能衰竭的临床效果显著优于单用,其可有效减轻患者的临床症状,纠正电解质紊乱,改善肾功能和预后,可能与降低血清ProGRP、Chemerin水平及提高血清Cysc水平有关。     

乙醛脱氢酶2可减少氧化损伤诱导的心肌细胞凋亡

乙醛脱氢酶2 (aldehyde dehydrogenase 2, ALDH2)是线粒体特异性酶,已被证明参与氧化应激诱导的细胞凋亡,而在心肌细胞中的作用知之甚少。本研究旨在通过用特异性ALDH2抑制剂大豆苷抑制ALDH2活性来研究ALDH2在抗霉素A诱导的心肌细胞凋亡中的作用。应用抗霉素A和大豆苷诱导小鼠心肌细胞,然后测定ALDH2酶活性、细胞内活性氧(reactive oxy gen species, ROS)含量和细胞凋亡,应用RT-PCR和蛋白质印迹法(Western blotting)检测ALDH2 m RNA和蛋白表达。结果表明,抗霉素A (40μg/mL)可诱导新生心肌细胞凋亡,而大豆苷(50μmol/L)能有效地抑制ALDH2活性而对细胞凋亡没有影响,并且可显著增强抗霉素A诱导的心肌细胞凋亡(53.72%～71.33%, p<0.05)。与单独用抗霉素A处理的细胞相比,抗霉素A和大豆苷共处理的心肌细胞中活化的丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)信号传导途径(p38-MAPK)的磷酸化也显著增加。本研究初步表明,改变线粒体ALDH2活性可能是减少氧化损伤诱导的心肌细胞凋亡的潜在选择。     

木薯果胶甲基酯酶抑制因子MePMEI1的生物信息学分析

为探讨木薯MePMEI1的分子结构特征。通过PCR扩增和测序技术及生物信息学分析工具对木薯MePMEI1基因进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果表明木薯MePMEI1基因编码区全长609 bp,编码202个氨基酸残基;MePMEI1基因编码蛋白分子量21.78 k D,理论等电点(pI)约为5.51;生物信息学预测发现,木薯MePMEI1蛋白是稳定的亲水蛋白;具有跨膜区为分泌蛋白;含有1个PMEI结构域,1个糖基化位点,31个磷酸化位点;二、三级结构以α螺旋和无规则卷曲为主。该蛋白的生物功能可能与细胞被膜、酶和生长因子等相关。木薯MePMEI1基因的生物信息学分析为进一步研究其遗传特性和生理生化机制提供了理论依据。     

金柑花蕾酵母双杂交cDNA文库构建及评价

为了探索金柑花发育的分子机制并研究与金柑花发育相关重要基因编码的蛋白质之间的相互作用,本研究以融安金柑不同生长时期的花蕾为材料,采用SMART技术构建了cDNA文库,对该文库进行了鉴定评价。经检测,所构建的cDNA文库滴度为2.83×10^8cfu/mL,文库库容为1.42×10^10cfu,重组率为97.91%,插入的双链cDNA片段长度主要分布在250~2 000 bp之间。结果表明,该文库达到了建库标准,理论上涵盖了全部与融安金柑花蕾发育相关的基因,为后续利用酵母双杂交技术筛选互作蛋白提供了物质基础。     

小柴胡汤加减联合奥美拉唑对慢性胃炎具有治疗增效作用

本研究选取本院收治的慢性胃炎患者114例并根据治疗方法不同分为对照组和观察组。对照组患者采用奥美拉唑治疗,观察组患者采用奥美拉唑联合小柴胡汤加减治疗,分析小柴胡汤加减联合奥美拉唑对慢性胃炎血清表皮生长因子(EGF)、胃黏膜氧化酶-2 (COX-2)蛋白表达情况的影响及护理对策。研究结果表明,治疗前两组患者胃镜检查充血水肿、糜烂、黏膜白相、颗粒增生发生率比较无统计学差异(p>0.05);治疗后,观察组患者各项指标发生率低于对照组(p<0.05);治疗前,两组患者血清EGF、Bcl-2、CRP和胃黏膜COX-2、P-p65表达水平比较无统计学差异(p>0.05),治疗后发现观察组患者血清EGF水平高于对照组,血清Bcl-2、CRP和胃黏膜COX-2、P-p65表达水平低于对照组(p<0.05);治疗前,两组患者在躯体功能、躯体职能、躯体疼痛、情感职能、心理健康评分等生活质量评分上比较无统计学差异(p<0.05),治疗后,观察组患者各项评分高于对照组(p>0.05)。本研究初步结论说明,小柴胡汤加减联合奥美拉唑治疗慢性胃炎疗效显著,可改善患者血清EGF、Bcl-2和胃黏膜COX-2表达水平,提高患者生活质量。     

秦岭山区中国大鲵生境因子的选择

通过对秦岭山区中国大鲵(Andrias davidianus)栖息地生境因子调查、统计,利用R语言分析了各因子与大鲵生境选择的相关性,得出研究结果:秦岭山区影响大鲵生存的主要因子为栖息地类型(相关系数r=0.98),其次是水温(相关系数r=-0.8)、河岸坡度(r=-0.6)和p H (r=-0.6);浊度(相关系数r=0.5)、电导率(r=0.49)、DO(r=0.4)、人为干扰(r=0.35)和海拔(r=0.31)对大鲵分布影响不大。研究结果为探讨中国大鲵对野生环境的适应性选择提供了参考。     

氰酸盐诱导氧化应激促进肾小管上皮细胞上皮–间充质转化

该研究探讨氰酸盐(cyanate)诱导肾小管上皮细胞氧化应激损伤和促进肾纤维化的作用。氰酸盐作用HK-2肾小管上皮细胞后, CCK8法检测其对细胞活力的影响;倒置显微镜观察细胞形态的改变; DCFH-DA法检测细胞ROS水平;细胞免疫荧光和Western blot分别检测E-cadherin、Fibronectin、α-SMA的表达; Western blot检测TGF-β的表达水平。结果显示, 2 mmol/L氰酸盐明显下调HK-2细胞的活力(P<0.05),细胞形态变为长梭形。氰酸盐作用24 h后, HK-2细胞内ROS水平呈浓度依赖性升高。免疫荧光和Western blot结果均显示,氰酸盐作用24 h后, HK-2的Fibronectin、α-SMA表达升高, E-cadherin表达下降; TGF-β的表达水平随氰酸盐浓度升高而上调(P<0.05)。以上结果表明,氰酸盐诱导肾小管上皮细胞产生过量ROS,上调TGF-β水平促进细胞上皮–间充质细胞转化(epithelia-mesenchymal transition, EMT)。