PCR-测序法对啮齿类动物汉坦病毒的检测和基因分型

目的探讨PCR-测序法在啮齿类动物汉坦病毒临床检测中的应用价值。方法以Genbank 7种血清亚型24株汉坦病毒代表性毒株为基础,从病毒基因S片段序列设计引物,采用邻位相连法进行系统进化分析,以该方法对浙江省近年从野生啮齿类动物中临床分离的汉坦病毒毒株进行分型鉴定。结果所建系统发育树将所分析的毒株分为5个区域,引起HFRS的四种血清型具有较稳定的拓扑结构,且能与引起HPS的血清型进行区分。11株实验毒株进行PCR扩增和测序,结果表明该引物具有高度的敏感性和特异性,其中9株浙江省分离的血清型未知毒株的系统发育分析发现其包含引起HFRS的3株HTN和1株SEO血清型,其他5株属两种未知血清型。讨论所建立的PCR-测序法具有用于临床检测汉坦病毒的价值。     

饲喂复合乳酸菌制剂对犊牛粪便微生物多样性及其功能的影响

目的 本试验利用高通量测序技术探究复合乳酸菌制剂对犊牛粪便微生物多样性、组成结构的影响并进行功能预测。方法 选取3头体重为（150±10） kg的安格斯犊牛散栏饲养，犊牛自由采食基础日粮。试验开始后，在基础日粮上灌喂15 mL复合乳酸菌制剂，每日两次，连续7 d。分别于试验期第0 d、第3 d和第7 d肛门采集基础牛粪便（第0 d:D0；第3 d:D3；第7 d:D7），采用16S rRNA测序对微生物进行多样性分析和功能预测。结果 从犊牛粪便样品中共获得优化序列258 156条，OTU聚类共获得1 409个OTU。通过α-多样性分析发现，与D0组相比，D3组犊牛粪便微生物Ace指数（F=6.541,P=0.031）和Chao1指数（F=10.898, P=0.010）显著升高，Shannon指数（F=0.277,P=0.767）和Simpson指数（F=0.097,P=0.909）无显著性变化。PCA分析发现，未饲喂复合乳酸菌制剂与饲喂乳酸菌制剂的犊牛粪便微生物组成存在显著差异（R=0.366,P=0.049）。在门水平上，粪便中的厚壁菌门和拟杆菌门为优势菌门。与D0组相比，D7组髌...