肠道噬菌体组生物信息学分析方法的研究进展

噬菌体是感染细菌的病毒,广泛存在于各类环境中。由于传统实验研究的局限性及噬菌体基因的特异性,导致对肠道噬菌体的研究很少。随着宏基因组测序技术的发展和各种生物信息分析软件的开发,可以通过噬菌体组学,加深对肠道噬菌体的认识。噬菌体组分析流程主要包括原始数据质量控制和预处理,病毒基因组序列的拼接组装,类病毒颗粒的筛选和系统分类注释以及进化分析和预测相应宿主细菌。本文对噬菌体组分析流程和其中所需要的常用生物信息分析工具和数据库进行详细的介绍,可以为肠道噬菌体研究以及相关的研究人员提供参考。     

鼎湖山南亚热带季风常绿阔叶林C贮量分布

在对1hm 2永久样地调查的基础上结合优势树种C含量的实测值, 对鼎湖山南亚热带季风常绿阔叶林的C贮量及其空间和种群分布特点进行了分析,结果表明 (1)鼎湖山季风常绿阔叶林现存C贮量为89.75t@hm -2 ,其中, 干、枝、叶、根分别占总量的53.09%、25.36%、2.64%和18.31%; (2)数量上小径级个体占有绝对优势,1hm 2样地内 DBH ＜20cm的个体占总数的95%,个体数量随径级的增加而迅速减少,而C贮量的径级分布则大致呈"M"形; (3)根据树木高度分为4个层次,即Ⅰ层( h ≥20m),Ⅱ层(10＜ h ≤20m),Ⅲ层(5< h ≤10m)和Ⅳ层( h ＜5m), 各亚层之间C贮量与该层次的高度呈正相关,占总C贮量的比例依次为53.97%、31.37%、 11.26%和3.40%.在垂直方向上,干、枝、根C贮量变化与总C贮量的变化趋势大体一致 ,叶的C贮量则以Ⅱ层最大; (4)优势种群对季风常绿阔叶林C贮量贡献排序为 锥栗 C astanopsis chinensis＞荷木Schima superba＞黄果厚壳桂Cryptocarya concinna＞厚壳桂 Cryptocarya chinensis＞肖蒲桃Acmena acuminatissima＞黄杞Engelhardtia roxburghi ana＞白颜树Gironniera subaequalis＞臀形果Pygeum topengii＞橄榄Canarium album＞窄叶半枫荷Pterospermum lanceaefolium＞华润楠Machilus chinensis＞鸭脚木Scheffler a octophylla＞韶子Nephelium chryseum.成熟度较高的种群 C贮量较高,起主导作用.     

新疆博格达山上二叠统非海相网状遗迹化石

新疆博格达山上二叠统乌拉泊组和井井子沟组为一套厚逾１０００－２４００ｍ的湖泊－河流相沉积。在凝灰质砂岩、泥岩和沉凝灰岩中产生丰富的网状类遗化石,主要类别包括Ｔａｈｌａｓｓｉｎｏｉｄｅｓ？ｔｅｉｃｈｆｏｒｉｍｉｓ ｉｃｈｎｏｓｐ．ｎｏｖ．,Ｔ．？ｃｆ．ｔｅｉｃｈｆｏｒｍｉｓ ｉｃｈｎｏｓｐ．ｎｏｖ．,Ｐａｒａｄｉｄｙｍａｕｌｉｃｈｎｕｓ ｒｅｔｉｃｕ－ｌａｒｉｓ ｉｃｈｎｏｓｐ．ｎｏｖ．和节肢动物拖     

Remopleurides nasutus Lu的新认识

ＲｅｍｏｐｌｅｕｒｉｄｅｓｎａｓｕｔｕｓＬｕ的新认识袁文伟周志毅（中国科学院南京地质古生物研究所南京２１０００８）关键词三叶虫新属Ｈｅｘａｃｏｐｙｇｅ奥陶纪卢衍豪１９５７年建立了桨肋虫类三叶虫的一个新种,ＲｅｍｏｐｌｅｕｒｉｄｅｓｎａｓｕｔｕｓＬｕ...     

富勒烯的生物活性研究进展

90年代初以来,富勒烯类化合物的生物活性逐渐引起人们的注意,初步研究表明在抗艾滋病毒、酶活性抑制、切割DNA、光动力学治疗等方面具有独特的功效.此类化合物在生化、医学、药物学等领域有良好的应用前景.     

三孢布拉氏霉发酵生产β-胡萝卜素的研究

利用三孢布拉氏霉发酵生产天然β－胡萝卜素。在30L发酵罐中,平均生物量31．3g干菌重／L发酵液和胡萝卜素1213．1mp／L;在3M³发酵罐中,平均生物量38.0g干菌重／L发酵液和胡萝卜素1146．5mg／L。将中试样品经HPLC分析,在总色素中β-胡萝卜素占92～96％,其他类胡萝卜素占8～4％;在β-胡萝卜素中,反式异构体占90～95％,9－、13－、15－顺式异构体占10～5％。结晶β－胡萝卜素呈多种形状,但大多数为两端锥形的棱柱体。在胡萝卜素提取中,工艺和技     

磁场处理对螺旋藻多糖生产影响的初步研究

一定磁场强度（0～0．6T）处理下培养的螺旋藻生长加快,于物质积累增多,由072mp／Inl增加到0．80mg／ml;多糖含量提高,由4．2％增加到5．1％．磁场处理使培养液电导率随磁场强度增加而降低,使NO^-₃-N含量随磁场强度增加而增加,有利于细胞吸收和新陈代谢。