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犬MC1R基因T105A基因座多态性及 与毛色性状相关性的研究The 总被引:4,自引:2,他引:2
为了检测犬MC1R基因T105A基因座的多态性,并分析该多态性与犬毛色表型的相关性,抽取111只外科手术学实验用杂种犬血液并提取DNA,记录毛色表型。采用PCR-RFLP技术,对MC1R基因T105A基因座进行基因多态性分析,并对该基因座DNA进行克隆测序;用二元变量相关分析的统计学方法分析基因座多态性与毛色性状之间的相关性。经PCR-RFLP分析结果表明,T105A基因座序列具有多态性,表现为A、B二个等位基因和AA、AB及BB 3种基因型。A、B等位基因频率分别为72.97%和27.03%,基因杂合度(H)为0.39。基因型AA频率为55.86%,BB为9.91%,AB为34.23%。对T105A多态性片段DNA克隆测序后发现,MC1R基因在编码第105位氨基酸的密码子第一个碱基存在由G到A的单碱基突变,该突变导致第105位氨基酸发生由丙氨酸向苏氨酸的改变。统计分析结果表明MC1R基因T105A基因座的多态性与毛色性状不存在显著的相关性,这可能是由于外科手术学实验用犬是杂种犬,其遗传背景不同所致,尚须在纯种犬群体中进一步研究MC1R基因对毛色的影响。
Abstract: In order to detect the polymorphism of T105A in MC1R gene in dogs and to analyze the relationship between the genetic polymorphisms and phenotypes of dog coat color, the blood samples of 111 cross-breed dogs were taken and their genomic DNAs were extracted. The phenotypes of dog coat color were recorded. The T105A locus of MC1R gene in the canine was detected through the technology of PCR-RFLP. Furthermore, the polymorphic fragments at T105A were sequenced. The relationships between the polymorphism of T105A and coat color trait were analyzed by the statistical methods of bivarate correlation analysis. By the method of PCR-RFLP, the T105A polymorphism was found with two alleles A and B and three genotypes AA, AB and BB. The frequencies of two alleles were 72.97% and 27.03%, respectively. The heterozygosity of T105A locus was 0.39. The frequencies of three genotypes were 55.86%, 34.23% and 9.91%, respectively. According to the results of sequencing, one base change from G to A at the position 105 was found at T105A locus and it altered amino acid at the position 105 from alanine to threonine. According to the statistical analysis, no significant association between the polymorphism of MC1R gene and the coat color was found and the result may be due to the differences of genetic background. Further research on MC1R gene should be done in pure breed dogs. 相似文献
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细胞生物过程具有时序动态性,蛋白质功能模块是驱动细胞生物过程的功能单位。为了蛋白质功能模块识别,本文将细胞生物过程建模为动态时序表达相关蛋白质相互作用网络(DTEPIN);构建子块矩阵以表示动态时序表达相关蛋白质相互作用网络;利用子块矩阵特殊性,分析时空复杂度和并行性;优化设计马尔可夫聚类算法,以识别动态时序表达相关蛋白质相互作用网络中的蛋白质功能模块。为了支持基于子块矩阵马尔可夫聚类过程,本文运用图形处理器并行计算矩阵乘积。实验结果表明,与已有同类算法相比,所设计算法识别的蛋白质功能模块,统计匹配质量更高且精确匹配数量更多。 相似文献
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本文以茄子抗青枯病自交系和感病自交系为试材,在接种青枯病菌后,对调控抗性反应的不同信号传导基因进行表达特性分析。结果表明,在9个基因中,EDS1、PAD4、NPR1、SGTI和WRYK70等5个基因的表达均随着接种诱导时间延长而增加,而且在抗病自交系‘E-31’中的表达量要高于感病自交系‘E.32’;而JAR1、NDR1、EIN2YeaRARl等基因的表达随着接种诱导时间的增加,表达水平变化不大。初步推断EDS1、PAD4、NPRI、SGTI和WRYK70可能与调节茄子抗青枯病抗性反应有关。同时茄子在接种后活性氧的含量均增加,但是感病植株的含量高于抗病植株。 相似文献
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陈清华王文岚任杰李娅谢小萍凌孝臣李金声 《现代生物医学进展》2012,12(10):1872-1875
目的:研究常压氧与高压氧对成年大鼠脑缺血再灌注损伤后微血管新生影响的差异。方法:将成年SD雄性大鼠随机分为三组:假手术组(SS组)、常压氧治疗组(NBO组)、高压氧治疗组(HBO组),每组又随机分为3、7、10天三个亚组。采用线栓法对NBO组和HBO组大鼠进行大脑中动脉栓塞(MCAO),缺血1.5小时后拔出栓子再灌注,NBO组进行常压氧治疗,HBO组进行高压氧治疗。大鼠分别在3、7、10天麻醉处死,取脑组织切片,血管内皮生长因子(VEGF)、VEGF受体-1(FLT-1)和CD34免疫组化染色,光镜观察取图和统计分析。结果:NBO各组与SS各组相比,VEGF、FLT-1和CD34阳性细胞数目均明显增多(P<0.05);HBO各组与NBO各组比较,7天、10天组VEGF、FLT-1和CD34阳性细胞数目均显著增多(P<0.05)。结论:HBO治疗较NBO治疗对成年大鼠微血管的新生更有促进作用。 相似文献
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广东省蔬菜种质资源收集保存与鉴定利用 总被引:3,自引:0,他引:3
2002-2004年,广东省农业科学院蔬菜研究所引进收集蔬菜种质资源501份,对已有的1642份蔬菜种质进行了繁种和农艺性状鉴定,入广东省蔬菜种质资源库(GVG)保存蔬菜种质1400份,同时对182份蔬菜种质资源进行了抗病性鉴定或营养品质分析,从中鉴定出高抗资源8份,抗病资源16份;完成了广东省蔬菜种质资源数据库的构建,其中包含了1019份已入库保存蔬菜种质的植株或果实图片,实现了广东省蔬菜种质资源数据网上共享。2003-2005年,共有12个利用优异蔬菜种质资源育成的蔬菜新品种通过广东省或国家农作物品种审定。 相似文献
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目的:明确养心通脉方主要成分与次要成分之间是否存在着交互作用。方法:从养心通脉方原方中综合提取出人参皂苷、丹参酮ⅡA、人参多糖、总生物碱、总挥发油5个主要成分部位及复方多糖、丹参菲醌2个次要成分部位。根据L4(23)正交设计组成4个处方:①处方1:基础因子+复方多糖、丹参菲醌;②处方2:基础因子;③处方3:基础因子+复方多糖;④处方4:基础因子+丹参菲醌;另设空白对照组,给予双蒸水。观察各成处方组对心肌缺血大鼠模型心电图J点位移及血液流变学指标的影响。结果:造模后第15 s、30 s、120 s、300 s、600 s,4个处方组心电图J点位移变化与空白组比较,差异均具有显著性(均P〈0.05),而以处方2组的最明显;4个处方组减轻血液流学变全血切变率的程度较之空白组均具有显著性意义(均〈0.01-0.05),其中处方2组改善最为明显。结论:养心通脉方5个主要成分与2个次要成分之间存在着交互作用,而由人参皂苷、丹参酮ⅡA、总生物碱、人参多糖、总挥发油5种成分所组的处方2(即基础因子方),为养心通脉方的最佳有效成分部位方。 相似文献
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大鼠游泳运动疲劳模型力竭标准的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:探讨不同力竭标准判断对负重大鼠游泳运动疲劳程度的影响.方法:成年雄性SD大鼠24只,随机分为对照组、运动组1、运动组2,每组8只,每天对负重大鼠进行游泳训练,运动组1以大鼠连续反复下沉,沉入水下三次,每次超过五秒为力竭标准,运动组2以沉入水下十秒钟,且游泳失去平衡为评判标准,对照组不参与游泳运动,试验期为十天,记录游泳时间,末了处死大鼠,取血液、肝、骨骼肌,同时检测相应组织超氧化物歧化酶活性,乳酸、丙二醛的含量.最后进行统计比较和分析.结果:运动组1随着游泳天数的增加,游泳时间呈逐渐延长趋势,运动组2游泳随着游泳天数的增加,游泳时间呈缩短趋势.运动组1和对照组相比较,血清、骨骼肌丙二醛和乳酸明显高(P<0.05),肝变化不明显(P>0.05);超氧化物歧化酶的活性均明显降低(P<0.05).运动组2和对照组、运动组1相比较,血清、骨骼肌丙二醛和乳酸明显高(P<0.05),肝变化不明显(P>0.05);超氧化物歧化酶的活性均明显降低(P<0.05).结论:采用运动组2疲劳力竭判断标准是可靠的,可用于运动性疲劳机制的试验性研究. 相似文献
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目的:探讨养心通脉有效成分部位方(YTⅡ)促血管生成的作用靶点及其机理.方法:制备养心通脉有效部位方(YTⅡ)和各对照组(YT Ⅰ组、SBW组、bFGF组、KX组)含药血清,并进行心肌缺血模型大鼠心脏血管内皮细胞的培养;观察比较在血管生成的过程中YTⅡ及各对照组对心脏血管内皮细胞"增殖"、"迁移"和"管腔结构形成"不同环节的干预作用.结果:各组药物干预后,心肌缺血大鼠冠状血管内皮细胞的增殖率、迁移率、成管率3类指标均呈现出bFGF组>YTⅡ组>YTⅠ组>SBW组>NS组>KX组递减的趋势.YTⅡ和bFGF对血管生成的不同环节均有明显的促进作用,且显著优于其他各组.结论:养心通脉有效部位方(YTⅡ)益气活血,能刺激血管内皮细胞"增殖"、"迁移"和"管腔结构形成"不同环节,促进缺血肌的血管生成. 相似文献
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犬MC1R基因R306ter与毛色性状相关性研究 总被引:1,自引:0,他引:1
目的 分析犬MC1R基因中R30 6ter位点多态性与犬毛色表型的相关性 ,为遗传育种 ,培育出更加优良的实验用犬奠定基础。方法 采用PCR SSCP技术 ,对MC1R基因R30 6ter位点进行基因多态性检测 ,分析位点多态性与毛色性状之间的相关性 ,并对该位点进行克隆测序。结果 PCR SSCP分析结果表明 ,R30 6ter位点序列具有多态性 ,表现为C、D二个等位基因和CC、CD及DD三种基因型。对R30 6ter多态性片段克隆测序发现 ,MC1R基因在编码第 30 6位氨基酸的密码子处存在一个由CGA到TGA的终止突变。结论 经统计分析结果表明在杂种犬中MC1R基因多态性与毛色性状不存在显著的相关性 ,这可能是由于外科手术学教学用犬是杂种犬 ,其遗传背景不同所致。由于MC1R基因的R30 6ter位点内存在碱基变异 ,因此在杂种犬中表现出明显的PCR SSCP多态性 相似文献