鹅观草属、披碱草属、猬草属和仲彬草属物种的RAMP分析及系统学意义

对鹅观草属、披碱草属、猬草属和仲彬草属4属23个物种进行了RAMP分析。结果表明属间变异极大,多态性极高。31个引物组合产生的286条DNA扩增片段均具有多态性。聚类分析显示鹅观草属、披碱草属、猬草属和仲彬草属物种各自聚为一类;Roegneria alashanica、R．elytrigioides和R．magnticaespes聚类在一起;猬草属的模式种Hystrix patula与披碱草属物种聚类在一起,而Hystrix duthiei和H．longearistata单独聚为一类;形态相似、染色体组相同、地理分布一致的物种聚类在一起。本研究结果基本上同形态学和细胞学研究结果相吻合,将鹅观草属、披碱草属和仲彬草属作为属分类等级处理比较恰当,而猬草属的系统地位有待进一步确认。RAMP标记可作为评价多年生小麦族物种遗传多样性和亲缘关系的一种分子标记技术。     

利用RAPD-PCR技术分析东北地区16种小卷蛾的亲缘关系

利用RAPD-PCR技术对东北地区黄卷蛾族的16种小卷蛾的基因组进行随机扩增,构建出系统发育树,对其亲缘关系进行分析.系统树显示褐卷蛾属的3个种、条卷蛾属的两个种和黄卷蛾属的4个种的聚类方式和传统形态分类法基本一致.也发现了一些与传统分类结论不完全一致的现象,如同属的忍冬双斜卷蛾和棉花双斜卷蛾在系统树上没有聚在一起,而和不同属的松褐卷蛾、樱桃铅卷蛾聚在一起等.分析同属和不同属种间的遗传距离,初步得出以下结论,遗传距离0.7可以作为属的分类依据,同一属的种间遗传距离小于0.7,不同属的种间遗传距离大于0.7.     

基于淫羊藿属(Epimedium L.)核型似近系数的聚类分析及其系统演化意义

为揭示淫羊藿属(Epimedium L.)植物染色体组遗传与进化,阐明该属植物系统亲缘关系和现代地理分布格局形成。该文对淫羊藿属植物51个分类群(43种、1亚种、6变种和1个栽培品种)和2种温哥华属(Vancouveria Morren et Decne.)植物的根尖进行了有丝分裂中期染色体核型分析,并运用核型似近系数聚类分析方法对这53个分类群植物的核型进行了聚类研究。结果表明:所有种类的染色体数均为12,二倍体(2n=2x=12),第1对同源染色体均为随体染色体,核型均为Stebbins的2A或1A型。可见,淫羊藿属植物染色体组在遗传进化中确实较为保守,种间核型非常相似。核型似近系数聚类分析为淫羊藿属植物系统进化研究提供了一些明显的线索。分析结果完全支持该属属下两个亚属(Subgen.Rhizophyllum和Subgen.Epimedium)的划分。亚属Epimedium的核型似近系数聚类结果显示,该类群物种间的系统亲缘关系与地理分布密切相关。核型似近系数分析结果还发现,来自东亚地区的淫羊藿属植物染色体组具有明显的变异,显示了更高的遗传多样性。基于上述研究结果,推断了淫羊藿属植物现代地理分布格局的形成过程。该研究结果可为淫羊藿属植物的资源利用、系统分类和遗传演化等领域的研究提供参考。     

日本囊对虾4个地理群体线粒体16S rRNA序列及遗传结构分析

对我国东南沿海日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)的4个地理群体广东群体(GD)、台湾群体(TW)、福建群体(FJ)和浙江群体(ZJ)的线粒体16S rRNA基因片段进行PCR扩增,对产物进行测序后分析。经比对获得470bp的核苷酸分析序列,发现了16个变异位点,得到了10种单倍型。广东、台湾、福建和浙江群体的核苷酸多样性依次分别为0.0008、0.0010、0.0051、0.0015,各群体均存在独有的单倍型和共有单倍型。群体遗传距离分析表明各群体间保持着一定的遗传差异,其中福建群体与其他群体之间存在着较远的遗传距离并保持了较高的遗传多样性。另外,利用其423bp的16S rRNA同源序列探讨了对虾科6个属共12种对虾的系统进化关系,囊对虾属与沟对虾属亲缘关系较近聚为一支,其他4个属的10种对虾聚为一支。     

“甘蔗复合群＂能源植物遗传育种研究进展

“甘蔗复合群”是一类极具生物能源开发潜力的禾本科C4植物。近年来由于世界能源危机的影响和植物遗传育种研究的发展,国内外学者对“甘蔗复合群”植物资源评价和能源育种研究越来越重视。本文介绍了“甘蔗复合群”的基本概念、属种分类及核心类群等研究背景。同时以甘蔗属和芒属核心资源为例,从“甘蔗复合群”能源植物遗传育种的角度综述了国内外相关研究进展。旨在总结前人的理论研究成果和杂交育种实践经验,探讨相关类群在植物系统分类和种质资源利用中存在问题与对策,为我国“甘蔗复合群”能源植物的应用基础研究和产业化开发利用提出建议。     

“甘蔗复合群”能源植物遗传育种研究进展

“甘蔗复合群”是一类极具生物能源开发潜力的禾本科C4植物。近年来由于世界能源危机的影响和植物遗传育种研究的发展,国内外学者对“甘蔗复合群”植物资源评价和能源育种研究越来越重视。本文介绍了“甘蔗复合群”的基本概念、属种分类及核心类群等研究背景。同时以甘蔗属和芒属核心资源为例,从“甘蔗复合群”能源植物遗传育种的角度综述了国内外相关研究进展。旨在总结前人的理论研究成果和杂交育种实践经验,探讨相关类群在植物系统分类和种质资源利用中存在问题与对策,为我国“甘蔗复合群”能源植物的应用基础研究和产业化开发利用提出建议。     

基于髭鲷属鱼类Cyt b基因全序列探讨髭鲷属在鲈总科的分类地位

为探讨髭鲷属鱼类的分类地位,克隆了两种髭鲷属鱼类(横带髭鲷和斜带髭鲷)的线粒体Cyt 6基因全长序列,并利用线粒体Cyt b基因序列分析了鲈总科6个科29种的分子系统进化关系.结果表明:髭鲷属与石鲈科的其他5个属的遗传距离超过了科问水平的遗传距离,存在较远的遗传分化.29种鲈总科鱼类分成了两大类群,石鲈科的矶鲈属、仿石鲈属、厚唇椒鲷属、异孔石鲈属和石鲈属的物种聚为一起形成石鲈科的一个独立分支,与亲缘关系较近的鲷科、梅鲷科和笛鲷科形成一个类群;而隶属于石鲈科的髭鲷属与石鲷科及雀鲷科形成另一个类群.髭鲷属与其他石鲈科鱼类的亲缘关系已经超过了科问的遗传分化水平,而在遗传距离及系统进化分析上髭鲷属仍然隶属于鲈总科.本研究支持将髭鲷属提升为髭鲷科的观点.     

基于SSR标记分析小豆及其近缘植物的遗传关系

本研究利用87对SSR引物分析了80份栽培小豆(Vigna angularis)、22份野生小豆(V.angularis var.nipponensis)以及10份豇豆属(共7个种)近缘植物,旨在比较豇豆属不同种的遗传多样性,并分析种间的遗传关系.结果显示87对SSR引物在112份小豆及其近缘植物资源中共检测到667个等位变异.其中有75个、71个和82个SSR位点分别在栽培小豆、野生小豆和近缘植物中表现为多态.随机抽样分析发现,平均每SSR位点检测到的等位变异数目为近缘植物>野生小豆>栽培小豆,与多态信息含量(PIC)值一致,说明近缘植物及野生小豆中蕴含着丰富的遗传变异,是栽培小豆育种的重要基因来源.聚类分析显示,栽培小豆、野生小豆和近缘植物间的遗传分化比较明显,分别聚为三大类,其中栽培小豆的遗传背景与其生态环境相对应;近缘植物又可以分为三个亚类,亚类间的遗传距离与其亲缘关系相对应.本研究结果也说明利用SSR标记辅助豇豆属的种间分类是可行的.     

甘薯杂交F_1群体材料的遗传多样性研究

甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)作为世界上一种重要的粮食、饲料、工业原料及新型能源作物,从有性生殖F1选择优良实生系进行选择育种一直是甘薯育种的重要方式。为了优化甘薯杂交育种方法,合理选配杂交组合,提高育种效率,本试验利用SSR标记研究了甘薯杂交群体基于SSR标记及13个农艺性状的遗传多样性,得到了群体内的聚类图,并且筛选出了甘薯的高产株系。群体SSR标记的聚类分析结果显示,群体材料与各亲本遗传距离比较远,被聚为3类,而亲本单独聚在另外一类。13个农艺性状的聚类将亲本与部分群体材料聚在了一起,且将群体材料和亲本材料作为一个整体时,其遗传距离的变异高达30%以上,远远高于SSR标记所获得的遗传变异系数。     

高粱抗旱种质筛选及遗传多样性的SSR分析

对61份高粱育种材料进行了抗旱性鉴定,旨在筛选既有较好抗旱性能又具较高丰产性能的高粱种质供育种利用。本研究筛选出抗旱性3级以上的材料14份,其中1级抗旱材料2份。选用109对SSR引物对61份高粱种质进行了遗传多样性分析,结果表明51对引物有较好的多态性,共扩增到508个等位变异片段,平均每个标记获得10个等位基因,多态性信息量(PIC)值平均为0.6615,变幅0.0322~0.9134。聚类分析结果表明,61份高粱材料聚成4类,聚类结果与根据地理来源、遗传背景的分类结果基本一致。中国高粱恢复系之间的遗传距离较近,说明我国目前的恢复系材料遗传基础狭窄,应在育种中拓宽恢复系的遗传基础。     

不同藻类对成熟前文蛤的生长及其生化成分的影响

为了找到适于文蛤(Meretrix meretrix)暂养、育肥的藻类,通过实验观察了不同藻类对成熟前文蛤生长的影响.实验共分为5组,分别单独投喂4种单胞藻,包括海水小球藻(CMorella vulgaris)(A组)、球等边金藻(Isochrysis golbana)(B组)、青岛大扁藻(Platymonas halgolandica)(C组)和牟氏角毛藻(Chaetoceros müelleri)(D组),及混合投喂海水小球藻、球等边金藻与牟氏角毛藻(E组).结果表明,单胞藻无论是单独投喂还是混合投喂,对成熟前文蛤的壳长和体重增长没有显著影响(P>0.05),其常规生化成分如蛋白质、脂肪、总糖及各种脂肪酸含量在某些实验组之间存在显著性差异(P<0.05).E组蛋白质含量(63.57%)最低,与其他组之间存在显著性差异;E组脂肪含量(8.17%)除低于D组(8.64%)外,高于其他3组,但与其他组间无显著性差异;E组总糖含量(7.08%)除低于C组(7.62%)外,高于其他3组,与其他组之间存在显著性差异(P<0.05).亚油酸(C18:2)、亚麻酸(C18:3)和花生四烯酸(C20:4)均为C组最高,含量分别为2.06%、2.28%和6.50%,与其他组之间存在显著性差异.EPA以D组为最高(8.51%),DHA以B组为最高(10.33%).     

Phylogenetic analysis of the genus Microbacterium based on 16S rRNA gene sequences

Abstract 16S rRNA gene (rDNA) studies of the six species of the genus Microbacterium, M. lacticum, M. laevaniformans, M. dextranolyticum, M. imperiale, M. arborescens and M. aurum , were performed and the primary structures were compared with those of 29 representative actinobacteria and related organisms. Phylogenetic analysis indicated that six species of the genus Microbacterium and representative four species of the genus Aureobacterium appear to be phylogenetically coherent as was suggested by Rainey et al., although the peptidoglycan types of these two genera are different (peptidoglycan type B1 or B2). Thus, the phylogenetical analyses revealed that members of actinobacteria with group B-peptidoglycan do not cluster according to their peptidoglycan types, but form compact cluster different from actinobacteria or actinomycetes with group A-peptidoglycan.     

基于线粒体COI基因序列的文蛤属（软体动物门：帘蛤科）系统发育关系

测定了4种文蛤属贝类的15个个体的COI基因序列,并从GenBank下载了短文蛤(M petechialis)的相应序列.比对后的序列长度为574bp,包括93个简约信息位点,A、T、C和G的平均含量分别为21.15%、44.71%、14.05%和20.09%.通过对序列的分析,共定义了12个单倍型:文蛤(M.meretrix)4个,斧文蛤(M.lamarckii)2个,丽文蛤(M.lusoria)3个,琴文蛤(M.lyrata)1个,短文蛤2个.以青蛤(cylina sinensis)为外群,用MP法和贝叶斯法构建系统树.结果显示,短文蛤、丽文蛤和文蛤为亲缘关系较近的物种,支持短文蛤和丽文蛤为文蛤的同物异名的观点.     

Chlorobaculum macestae sp. nov., a new green sulfur bacterium

The investigated green sulfur bacterium, strain M, was isolated from a sulfidic spring on the Black Sea Coast of the Caucasus. The cells of strain M are straight or curved rods 0.6-0.9 x 1.8-4.2 microm in size. According to the cell wall structure, the bacteria are gram-negative. Chlorosomes are located along the cell periphery. Strain M is an obligate anaerobe capable of photoautotrophic growth on sulfide, thiosulfate, and H2. It utilizes ammonium, urea, casein hydrolysate, and N2 as nitrogen sources and sulfide, thiosulfate, and elemental sulfur as sulfur sources. Bacteriochlorophyll c and the carotenoid chlorobactene are the main pigments. The optimal growth temperature is 25-28 degrees C; the optimal pH is 6.8. The strain does not require NaCl. Vitamin B12 stimulates growth. The content of the G+C base pairs in the DNA of strain M is 58.3 mol %. In the phylogenetic tree constructed on the basis of analysis of nucleotide sequences of 16S rRNA genes, strain M forms a separate branch, which occupies an intermediate position between the phylogenetic cluster containing representatives of the genus Chlorobaculum (94.9-96.8%) and the cluster containing species of the genus Chlorobium (94.1-96.5%). According to the results of analysis of the amino acid sequence corresponding to the fmo gene, strain M represents a branch which, unlike that in the "ribosomal" tree, falls into the cluster of the genus Chlorobaculum (95.8-97.2%). Phylogenetic analysis of the amino acid sequence corresponding to the nifH gene placed species of the genera Chlorobaculum and Chlorobium into a single cluster, whereas strain M formed a separate branch. The results obtained allow us to describe strain M as a new species of the genus Chlorobaculum. Chlorobaculum macestae sp. nov.     

中国纩蚜属研究及新种新亚种记述(同翅目:纩蚜科)(英文)

通过对中国纩蚜属的研究,作者提出纩蚜属的现代地理分布呈岛状分布的格局;并推测该属的起源中心可能在欧洲,现代分化中心可能在中国的横断山脉地区。从动物地理的角度,探讨了该属内的系统发育关系。同时,发现一新种,即云杉纩蚜Mindaurspiceasuctusspnov.。正模为无翅孤雌蚜,副模为5只有翅孤雌蚜和8只无翅孤雌蚜,分布在云南省昆明市,辽宁省沈阳市和熊岳县。一新亚种,即冷杉纩蚜三圈亚种M.abietinustriprimesensorissp.nov.,正模为有翅孤雌蚜,副模为3只有翅孤雌蚜,分布在云南省丽江市玉龙山。一新纪录种,即冷杉纩蚜指名亚种M.abietinusabietinusKoch1856。并且给出种的检索表,模式标本存放在中国科学院动物研究所标本馆。