聚赖氨酸和它的溴化氢结合物结构变化的红外光谱研究

聚赖氨酸(PLys)和它的溴化氢结合物(PLys-HBr)在不同的相对湿度(R.H.)下,用红外光谱仪测得它们的结构变化.固态PLys-HBr(平均分子量(MW)55000)在40%R.H.以下能保持无规卷曲结构,在40—70%R.H.之间为β-折叠,70%R.H.以上为α-螺旋.PLys由于它们的平均分子量不同,结构变化差别较大.PLys(MW 55000)在各种相对湿度下保持α-螺旋,直至96%R.H.才出现β-折叠.PLys(MW 14000)在40%R.H.以下能保持无规卷曲结构,在40—85%R.H.之间主要为β-折叠,85%R.H.以上为α-螺旋.     

水合诱导的多肽二级结构变化—红外光谱法研究

在不同相对湿度(R.H.)下,用红外光谱法研究了聚赖氨酸(PLys,MW14000)、聚赖氨酸溴化氢结合物(PLvs-HBr,MW55000)和聚谷氨酸钠(PGA-Na,MW80000)的二级结构随时间的变化.在R.H.=60%下,三种多肽由无规卷曲向β-结构转变的时间相近,约需9分钟;而由α-向β-结构转变时,PGA-Na所需时间约为PLas和PLys-HBr的二倍.然而在R.H.=90%左右下,由β-向α-结构转变时,PLys和PLys-HBr所需时间反为PGA-Na的二倍.在R.H.=90%左右下由无规卷曲向α-结构转变时,PLys和PLys-HBr出现β-折叠结构,而PGA-Na则无.实验表明了在不同水合度下侧链基团对构象变化的影响.     

聚α—氨基酸纤维的研究

<正> 在制造具有动物纤维相似性质的合成纤维时,应当引入蛋白质结构的慨念。丝是一种富含β-折叠结构的多肽,而羊毛则富有α-螺旋结构。当α-氨基酸聚合成聚α-氨基酸时,其一级结构与蛋白质一样为多肽,但其二级结构则可为α-螺旋、β-折叠或无规线圈,如果一种聚α-氨基酸纺成富含β-折叠     

小麦多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白的部分结构

为了弄清小麦多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 (polygalacturonase inhibitingprotein ,PGIP)的作用机制 ,并为其在基因工程中的应用提供依据 ,对其结构进行了研究 .用Edman降解法测得小麦PGIP的N端序列为Lys Pro Leu Leu Thr Lys Ile Thr Lys Gly Ala Ala Ser Thr .用CD谱研究其二级结构 ,发现小麦PGIP天然态含有 4 3 7%的 β折叠和 13 1%的α螺旋 .酸碱和温度变性引起了二级结构改变 .不完全变性阶段 ,二级结构的变化表现为α螺旋无明显变化 ,β折叠遭到破坏 ;活性完全丧失阶段 ,β折叠变化很小 ,α螺旋含量明显减少 .用NR R(非还原 还原 )双向对角线SDS PAGE鉴定出小麦PGIP含有链内二硫键 .用去糖基化法确证了小麦PGIP的糖含量为 2 2 %.小麦PGIP与双子叶植物PGIP相比 ,一级结构差异较大 ,同源性由 36 %变为 9%;二级结构相似 ,都是高 β 折叠的蛋白 ;均具有链内二硫键 ;在糖含量上也相似 .研究结果为进一步弄清小麦PGIP作用机理打下了基础 ,同时对于植物抗赤霉病基因工程具有重要意义 .     

人类免疫缺损病毒(HIV)的空间结构及金丝桃蒽酮素诱导的HIV光敏损伤的Raman光谱研究

获得了人血清中的HIV1—HIV2及金丝桃蒽酮素诱导的该病毒光敏损伤的Raman光谱. 其中突出的谱线指定为病毒糖蛋白的碳水化合物, RNA, 蛋白质和类脂. HIV1—HIV2的Raman光谱受控于组分碳水化合物的Raman散射. 它的碳水化合物中D-甘露糖和N-乙酰基葡萄糖的谱线非常明显, 并且D-甘露糖的异头Cl位存在着β构型, 结合的病毒RNA双螺旋呈A型构象. 病毒RNA的骨架磷酸基团、核糖和碱基(包括碱基之间氢键)的谱线完整、清晰, 病毒蛋白质的二级结构有α-螺旋、β-折叠、β-回折和无规卷曲, 它的侧链丰富、多彩, 有色氨酸、苯丙氨酸和“埋藏的”酪氨酸, 有稳定的具有扭曲-扭曲-扭曲构象的二硫键和具有扭曲、反式二种构象的碳硫键, 还有巯基、离子化和非离子化的羧基等. 病毒的脂双层分子可能处于有序的液晶相或凝胶相. 金丝桃蒽酮素诱导人类免疫缺损病毒(HIV1—HIV2)的光敏损伤, 使该病毒的各个组分发生了不同程度的变化, 有序的A型RNA变为无序, 它的垂直的碱基-碱基相互作用被破坏, 并有碱基之间氢键的断裂. 此外, 核糖和4个碱基的一些基团有明显的损伤. 与此同时, 病毒蛋白质的有序结构(α-螺旋和β-折叠)减少, 无规卷曲增加, 反式C—S键有较强的损伤. 埋藏在蛋白质三维结构中的酪氨酸虽然有损伤, 但仍是“埋藏的”. 属于病毒包膜糖蛋白的碳水化合物, 包括D-甘露糖和N-乙酰基葡萄糖的一些基团有一些变化. 病毒类脂中亲水的胆碱C—N基团也有损伤, 它可能是金丝桃蒽酮素与类脂的结合地点, 然而该脂双层可能仍处于有序的液晶相或凝胶相. 因此, 在本实验条件下, 人类免疫缺损病毒HIV1—HIV2的空间结构有一些损伤, 这些损伤可能会阻断病毒的传染, 遏制它的发育和繁殖. 激光Raman光谱从分子水平提供了HIV1—HIV2的空间结构光敏损伤的某些直接的证据.     

核盘菌AROM蛋白的三级结构分析

核盘菌编码AROM蛋白的arom基因已经被克隆测序,本文根据该基因翻译的氨基酸序列用同源模建方法和从头模建方法分析了AROM蛋白各结构域的三级结构和功能位点,以及该蛋白二聚体可能的组装方式。结果表明,核盘菌AROM蛋白的脱氢奎尼酸合酶结构域进一步由N-端含有一个Rossmann折叠的α/β结构域和C-端的α螺旋结构域组成;5-烯醇丙酮酰莽草酸-3-磷酸合酶结构域则由两个相似结构域组成,每个结构域含有不同拷贝数的β折叠和α螺旋;莽草酸激酶结构域的N-端由三个β折叠组成;脱氢奎尼酸酶结构域为(α2β2)3多肽,在N-端有一对反平行的β链,在C-端有loop环;莽草酸脱氢酶结构域含有一个由α/β组成的催化结构域和一个含有Rossmann折叠的NADPH结合结构域。     

用激光拉曼探讨不同相对湿度下聚赖氨酸分子的二级结构

本文报导了聚赖氨酸分子的二级结构因其含水量变化而变化.用T.L Lippert等人提出的方法对不同含水量下的聚赖氨酸分子的激光拉曼光谱进行了定量计算.结果表明分子二级结构中的x螺旋、β折叠及无规卷曲成份有明显差异.当分子中相对湿度在0～33%时它的二级结构主要为无规卷曲成份;当湿度在90%-75%时分子的主键盘方式以α螺旋为主;而当湿度小于75%大于40%范围时分子的二级结构改变以β折叠和无规卷曲的肽链构象.     

猪SLA-DR二级结构预测及同源模建

应用EXPASY服务器（http：／／www．expasy．oh／tools）上的SOPMA法对SLA—DR的α链和口链进行二级结构的预测,并与人的HLA—DR相应的α链和β链的氨基酸和二级结构成分比较,在此基础上同源模建SLA—DRα链、β链及复合体SLA—DR的三级结构。结果显示,SLA—DR的α链各二级结构成分α螺旋、β折叠、转角和无规则卷曲的数目分别为36、61、4和69,β链中分别为42、56、16和74。α链和β链各二级结构成分与复合体SLA—DR具有高度的符合率,分别达到98．7％（α螺旋）、99．1％（β折叠）、83．3％（转角）和97．2％（无规则卷曲）。各功能区分析,SLA—DR的α1和β1区为结合抗原的高变化区。同源模建和三级结构分析表明SLA—DR的α链和口链具有独立的三级结构,并可以组成复合体SLA—DR。     

用激光拉曼探讨不同相对湿度下聚赖氨酸分子的二级结构

本文报导了聚赖氨酸分子的二级结构因其含水量变化而变化.用T.L Lippert等人提出的方法对不同含水量下的聚赖氨酸分子的激光拉曼光谱进行了定量计算.结果表明分子二级结构中的x螺旋、β折叠及无规卷曲成份有明显差异.当分子中相对湿度在0～33%时它的二级结构主要为无规卷曲成份;当湿度在90%-75%时分子的主键盘方式以α螺旋为主;而当湿度小于75%大于40%范围时分子的二级结构改变以β折叠和无规卷曲的肽链构象.     

FTIR法定量研究水对聚赖氨酸溴化氢结合物二级结构的影响

付里叶变换红外光谱定量法研究表明,在０～１００％相对湿度（ＲＨ）范围内,聚赖氨酸溴化氢结合物（ＰＬＫ－ＨＢｒ）干膜的水合原则上分为无规卷曲、β－折叠和α－螺旋三个构象稳定阶段,其水合行为远较文献报导的复杂。在任一水合度下都不是纯单一结构,其红外谱均由多个吸收组分组成,而且,β－折叠的类型还可能发生变化。