离子阱串联质谱仪质荷比测量误差统计分析

离子阱串联质谱仪是蛋白质组研究中一种高通量,高灵敏度的分析仪器。目前对影响离子阱质谱仪质荷比测量误差的因素和数据产出后系统误差的校正方法还没有系统的分析。利用两批蛋白质标准品的数据和统计方法分析了离子阱质谱仪质荷比测量误差的分布规律,对测量的质荷比和信号强度对测量误差的影响进行了分析。在此基础上,提出了一种对质谱数据进行系统误差再校正的方法和一种根据信号强度确定误差容限的模型。     

整体蛋白质电喷雾质谱原位解析

蛋白质组学系统研究了生物体蛋白质组,尤其是一定生理、病理条件下差异表达的蛋白;对蛋白质序列、翻译后修饰及其位置的定性鉴定可以帮助我们系统地了解蛋白质的结构和功能。随着软电离技术(如电喷雾电离技术)及高质量测量精度、高质量分辨质谱仪(如轨道阱质谱仪)的发展与相对普及,完整蛋白质的质谱表征(即所谓的自上而下蛋白质组学)已成为可能且渐渐流行起来;相应的数据库搜索引擎和蛋白质鉴定生物信息学工具也有了一定的进展。本文对作者研发的蛋白质电喷雾质谱原位解析算法"同位素质荷比及轮廓指纹比对"及整体蛋白质数据库搜索引擎"Protein Goggle2.0"(http://proteingoggle.tongji.edu.cn/)做一个概述。     

不同寄主桑寄生中化学成分的差异性分析CSCD

为了探讨寄主植物对桑寄生代谢物合成积累的影响,本文采用超快速液相色谱-三重四极杆飞行时间串联质谱(UFLC-Triple TOF-MS/MS)结合多元统计分析技术对不同寄主来源桑寄生中化学成分差异性进行研究。通过二级串联质谱分析,对其质谱数据进行峰匹配、峰对齐、滤噪处理等,并进行特征峰提取;用主成分分析(PCA)和偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)处理数据;根据一级质谱精确质荷比和二级质谱碎片信息,结合软件数据库搜索、标准品比对及相关文献进行成分鉴定。结果显示,10个不同寄主来源桑寄生样品的化学组成得到有效区分;初步筛选并鉴定出19个差异化学成分,其中4种共有差异化学成分呈现出不同的变化规律。本研究为揭示寄主植物对桑寄生代谢产物合成和积累的影响以及不同寄主桑寄生质量评价提供基础资料。     

UHPLC-QTOF-MSMS比较两种不同基原火炭母的化学成分

为评价不同基原火炭母药材的质量差异,本文采用超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱联用(UHPLC-QTOF-MSMS)技术研究火炭母原变种和硬毛火炭母(变种)的化学成分。结果表明:酚酸类、黄酮类成分是火炭母原变种及硬毛火炭母的主要成分;通过与标准品对照,没食子酸、绿原酸、鞣花酸和槲皮苷等4个成分被准确鉴定;其余21个峰通过一级质谱精确质荷比和二级质谱碎片、结合数据库匹配及参考文献等进行结构鉴定。这一分析方法快捷方便,可快速区别火炭母原变种和硬毛火炭母中的化学成分,为全面研究火炭母药材的质量标准和品质评价等提供科学依据。     

MALDI-TOF质谱技术对克罗诺杆菌的鉴定与分型

以基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)技术用于克罗诺杆菌的鉴定与分型。通过对获得的克罗诺杆菌属典型菌株、阴沟肠杆菌和产气肠杆菌近似菌株以及克罗诺杆菌分离株的蛋白质质量图谱进行对比分析,找出克罗诺杆菌特征性离子峰,将其作为鉴定克罗诺杆菌的生物标识物;对全细菌蛋白质质量图谱进行聚类分析,将克罗诺杆菌属进一步划分为不同类型,结果显示,4株克罗诺杆菌参考菌株质量图谱约在5740(m/z)离子质荷比处出现1个相近离子峰,28株克罗诺杆菌分离株中27株(占96.4%)表现出相同结果;32株克罗诺杆菌被分为6种类型(以50%距离水平为分类界限)。MALDI-TOFMS作为一种新的技术,不仅能够用于克罗诺杆菌的鉴定,而且根据获得的细菌蛋白质质量图谱可将克罗诺杆菌划分为不同类型。     

沃特世发布台式质谱仪Xevo TQ-XS

正沃特世公司近日隆重推出了全新的Xevo~TQ-XS质谱仪——目前市场上灵敏度极高的台式串联四极杆质谱仪。该款质谱系统采用全新的Step Wave TM XS离轴离子源技术,并结合了离子光学器件、检测技术和电离技术,具有高灵敏度。该款产品所具备的性能提升依靠了多项先进技术。全新的Step Wave XS离轴离子源技术在第二级四极杆中配备了分段四极杆传输光学元件,能够有效去除中性物质,从而以更强的聚焦离子束将离子传输至检测器。通过这     

二次离子显微镜及其在生物医学中的应用

二次离子显微镜是由离子源激发样品表面原子产生二次离子,通过质谱仪将不同原子产生的离子分离并在显示系统上成像,以确定不同元素在样品中的分布图。较高的图像分辨率(0.5—1μm)和极高的灵敏度(浓度低于10^-19g/μm³)使得生物样品含有极低浓度甚至是痕迹量的元素分析成为可能。目前,二次离子显微镜已广泛应用于细胞生物学、核医学、植物生理学和人类病理学等领域。     

评估SELDI-TOF-MS技术检测肾移植术后病人尿液的能力

目的:研究表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测肾移植术后病人尿液中蛋白质的能力。方法:根据尿液标本中蛋白质浓度进行稀释处理,采用SELDI-TOF-MS技术,用3种不同芯片(NP20、CM10、IMAC30)与蛋白质浓度的不同组合分别检测肾移植术后病人的尿液。结果:采用NP20/蛋白质未稀释、CM10/蛋白质浓度约0.1g/L、IMAC30/蛋白质浓度约2g/L时,质谱图中蛋白质峰的个数和丰度达到最佳;单一芯片中NP20捕获质荷比为5000～20000的蛋白质能力最佳,而CM10和IMAC30在质荷比为2000～5000时有较大的捕获能力;3种芯片中CM10具有最大的捕获蛋白质的能力。结论:3种芯片检测尿液中蛋白质的能力不同;为了更好地发现疾病特异性标志物,最好多种芯片同时检测,且在各种芯片得到最佳质谱图时的浓度进行检测。     

实用性同位体标记技术

同位体标记技术．诸如iTRAQ（相对和绝对定量的同位体标签）．可以通过报道子离子信号对多元肽进行定量。因为用RAQ允许对多达8个不同的标签集进行分析．所以比只容纳2—3个标记物的代谢标记技术（重同位素标记）更为优越。虽然如此．直至最近在用离子阱质谱仪进行的串联质谱分析中低质量片段的回收率都很差．所以在许多分析平台中很难应用ITRAQ．     

基于LC-MS/MS和GC-MS/MS技术分析“川朴”与“温朴”的差异化学成分

为了探讨厚朴不同商品规格药材化学成分的整体差异,本文采用液相色谱-串联四极杆飞行时间高分辨质谱(LC-Triple TOF MS/MS)和气相色谱-串联质谱(GC-MS/MS)结合多元统计分析技术对"川朴"与"温朴"的化学成分进行比较分析。通过串联质谱分析,对其质谱数据进行峰匹配、峰对齐、滤噪处理等进行特征峰提取;用主成分分析(PCA)和偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)进行数据处理。非挥发性成分的LC-Triple TOF MS/MS分析,根据一级质谱精确质荷比和二级质谱碎片信息,结合软件数据库搜索、标准品比对及相关文献进行成分鉴定;挥发性成分的GC-MS/MS分析,质谱图与NIST05质谱数据库匹配及参照相关文献进行成分鉴定。结果显示,"川朴"与"温朴"样品间的化学组成得到明显区分;初步筛选并鉴定出21种非挥发性差异成分和9种挥发性差异成分。该结果从化学角度为建立"川朴"与"温朴"药材辨识的新方法以及厚朴商品药材质量的综合评价提供基础资料。