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微生物学作为生命科学最基础学科之一 ,历来都是推动生命科学整体进步的原动力。在微生物世界建立发展起来的分子遗传学、数量分类学、分子系统发育进化理论 (例如Woese生命 3域和系统发育树 )及其研究方法 ,奠定了 2 0世纪生命科学基础研究整体取得重大突破的坚实基础[1 ] 。如何认识利用和改造微生物世界奇特的生命现象和丰富的生物资源 ,一直是人类求生存斗争实践中最迫切的永恒研究主题。全球性“暴发性感染疾病”现象就是研究热点领域之一[2 ] ,近年来研究表明该现象与病原菌的“遗传因子转移”有密切关系 ,这类转移事件还加速了… 相似文献
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系统发育研究已是澄清所有进化历史问题的必由之路。选择合适的分子标记以及最大限度地挖掘和利用其所包含的系统发育信息是构建可靠的系统发育树的关键。等位基因杂合子(Intra-individual allele heterozygotes, IIAHs)是核基因内含子作为系统发育研究中的分子标记时常常出现的现象。如何挖掘并利用其中所包含的系统发育信息成为近年来系统发育学的研究热点。文章从此现象的产生、杂合子的分离以及现有的研究方法3个方面详尽概述, 阐述了IIAHs及其在系统发育分析中的最新研究进展。 相似文献
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青藏高原黄绿蜜环菌纯培养菌种的分离培养及分子鉴定 总被引:6,自引:1,他引:5
首次从采自青藏高原、与高原牧草嵩草属Kobresia草本植物形成外生菌根的黄绿蜜环菌Armillarialuteo-virens子实体中分离获得一组织分离菌株,运用rDNA-ITS和rDNA-IGS-1测序技术对该组织分离菌株是否为黄绿蜜环菌的纯培养菌种进行分子鉴定,并基于黄绿蜜环菌的5.8S/ITS和IGS-1序列进行核酸序列数据库GenBank同源性检索比对、构建系统发育树。结果表明,本研究获得的黄绿蜜环菌子实体组织分离菌株即为其纯培养菌种。基于ITS的系统发育分析表明黄绿蜜环菌与口蘑科内其它属间物种的系统发育关系较远;基于IGS-1的系统发育分析表明黄绿蜜环菌与蜜环菌属内的其它种序列差异较大,系统发育关系较远,而与Lepiota属内的部分种具有较近的系统发育关系。本研究首次基于分子手段对我国青藏高原的黄绿蜜环菌种进行了分离培养、分子鉴定和系统发育分析,为黄绿蜜环菌的科学分类提供了分子依据。 相似文献
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随着人类基因组和一些模式生物、重要经济生物以及大量微生物基因组测序的完成,生物学整体研究业已进入基因组时代.最近5~10年以来,利用基因组结构信息进行系统发育推断的研究形成了分类学和进化生物学中的前沿领域之一.相对于核苷酸或氨基酸序列中的突变而言,基因组的结构变化--内含子的插入/缺失、反转录子的整合、签名序列、基因重复以及基因排序等--是更大空间(或者时间空间)尺度上的相对稀缺的系统发育信息,一般用于科和科以上阶元间的亲缘关系研究.基因组全序列的获得和其中各基因位置的确定有利于将基因组中不同层次的系统发育信息综合起来,利用全面分子证据(total molecular evidence;包括基因组信息,DNA、RNA、蛋白质的序列信息,RNA和蛋白质的高级结构等)进行分子系统学研究. 相似文献
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流式细胞术在水体微型生物分子生物学研究中的应用 总被引:2,自引:0,他引:2
流式细胞术(FCM)是利用流式细胞仪对微小生物颗粒物的多种物理、生物学特性进行定量,并对特定细胞群体进行分选的分析测量技术。流式细胞仪是当代激光、流体力学、光学和电子计算机等学科技术高度发展的产物,是生命科学研究领域中先进的仪器之一。FCM最早应用于海洋生物学是在80年代中期,特别是1988年发现原绿球藻后[1],FCM成为研究水生微型生物(包括超微型生物)的重要手段。近年来,该领域的有关研究已成为海洋生命科学的研究热点,并从最初区分、记数不同微型浮游植物种群,发展到现在DNA分析和以荧光分子探针为辅助手段的系统发育分析… 相似文献
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基因树冲突与系统发育基因组学研究 总被引:1,自引:0,他引:1
随着越来越多的基因序列被运用于系统发育重建中,随之产生的基因树冲突已成为分子系统发育研究中日益突出的问题.因此,在分子系统发育研究中,应正确理解基因树和物种树之间的差异,充分注意和分析基因树冲突的原因,正确解释分子系统发育的结果.本文通过一些典型实例分析了在多基因系统发育研究中引发基因树冲突的三类主要原因:随机误差、系统误差和生物学因素.在此基础上,对近年来兴起的系统发育基因组学进行了介绍,并以稻属Oryza研究为例,阐述了系统发育基因组学方法在解决基因树冲突以及系统发育研究中的优势和应用价值,并进一步探讨了解决基因树冲突的策略和方法,以期为分子系统发育研究提供一些肩示和帮助. 相似文献