东湖浮游生物群落DNA指纹结构及其与环境理化因子的关系

对武汉东湖5个不同湖区的浮游生物群落DNA进行了RAPD指纹分析,并探讨了DNA指纹结构与环境理化因子的关系．结果表明：所筛选的9条随机引物共扩增210条大小为150～2000bp的谱带,多态率为93．3％．各站点平均有42条谱带,其中Ⅳ站最多（53条）,Ⅴ站最少（35条）．Ⅰ站的PO4^3--P、TP含量最高,Ⅴ站的NH4^＋-N、TN、NO2^--N含量最高,Ⅳ站各理化因子含量均低于其他站点,站点间COD、碱度、硬度、钙含量差异不大．相似性聚类分析表明,基于RAPD标记的浮游生物群落指纹将5个站点划分为两类：Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ站聚为一枝,Ⅳ、Ⅴ站聚为另一枝．这与湖区主要理化因子的聚类结果一致．说明东湖不同湖区浮游生物群落DNA指纹与其环境理化因子密切相关．     

洞庭湖浮游生物群落DNA指纹与理化因子的关系

对东洞庭湖7个采样站点的浮游生物群落DNA多态性进行了RAPD指纹分析,并探讨了其DNA指纹与理化因子的关系。结果如下:(1)从80条随机引物中筛选出的11条引物共获得148条谱带,多态率为98.6%;所用引物在各站点可获得45—70条扩增谱带,平均为57.6条,其中Ⅳ站最少;(2)Ⅳ站的泥沙含量最高(75.5mg/L),其他各站在1.2—40.3mg/L;各站点间的pH值比较接近,都呈弱碱性;Ⅰ站的TN、TDN及TP含量最高,Ⅲ站的TDP最高,但各站点相差不大。相似性聚类分析表明,浮游生物群落DNA指纹将7个站点划分为两大类———Ⅳ站作为单独的一类而明显有别于其他6个站点,这与洞庭湖浮游生物分布的主要制约因子———泥沙含量的聚类结果是一致的。因此,研究表明浮游生物群落DNA指纹与环境主要限制因子是密切相关的,这类资料的积累将为建立简易、有效的水资源质量评价体系提供科学依据。     

野生稻基因组随机扩增多态性DNA(RAPD)分析

用18个随机引物对2份栽培稻、12份包含有六个基因组型的野生稻DNA进行了扩增,共获得147个多态性DNA片断,把这些多态性DNA片断作为遗传位点用UPGMA法计算出各材料间的遗传相似性系数,并作了聚类分析．主要结果如下：1普通野生稻同栽培稻的亲缘关系很近,其中江永普通野生稻更接近于粳稻．2．CCDD组的Oryzalatifolia和EE组的O．australiensis遗传多态性相似。3．B、C、D、E组的遗传多态性相似,组成一个复合体,此复合体与A组的遗传多态性也相似,而F组则相距较远．4．O．mcyeriana和Rhynchofyzasabulata尚未确定组型,RAPD测定结果表明,前者与其它组型的种亲缘关系较远,后者则与AC复合体的种较近．     

东方(鱼屯)生长激素基因内含子2的克隆与多态性分析

以暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)、红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)、星点东方鲀(Takifugu niphobles)共82个个体为对象,运用PCR产物电泳检测、单链构向多态性(SSCP)技术和克隆测序技术检测到生长激素(Growth Hormone, GH)基因内含子2的长度和序列多态性。结果表明,3个群体中GH基因内含子2存在9种长度类型,分别为A、B、C、D、E、F、G、H、I,变异频率达到24.22％。对这9种序列进行比对分析,(1)发现9种长度类型A、G、T、C的平均百分比为17.15％、20.77％、37.38％、24.70％,其中G+C(45.47％)含量与A+T(54.53%)的含量差异不显著;(2)9种序列分别长351 bp、327 bp、319 bp、303 bp、295 bp、291 bp、287 bp、283 bp和271 bp,引起长度变化的主要原因是短串联序列TCTG的重复 (重复次数从20到40不等); (3)发现4个突变位点,其中3个转换位点为83(C→T),101(A→G)296(G→A),一处颠换位点103(C→A)。用UPGMA法构建分子系统树,发现DD与II首先聚为一类,然后依次与GG、AA聚为一大类,BB与CC,EE与HH分别聚为一类,最后再与FF聚为一大类,由此可见GH基因内含子2在品种间的差异远大于品种内差异。     

多个SPF鸡品系的RAPD分析

目的用RAPD方法分析三个品系SPF鸡的遗传变异,以指导SPF鸡群的育种工作.方法对三个SPF鸡品系F、M及B系和对照H纯系分别采血样30个,等量混匀为三个混合样,提取DNA,筛选随机引物,优化反应体系后进行PCR扩增,计算品系内平均相似系数,根据品系间遗传距离进行聚类分析并绘制树状聚类图.结果60个随机引物中有13个产生清晰稳定的多态条带,B系品系内平均相似系数为0.903,F系和M系分别为0.673和0.755,H系为0.968;聚类分析的结果是每个品系的三个样品先聚为一类,然后F系与M系、B系与对照H系分别聚为一类.结论F系和M系的纯合程度均较低,而B系较高;F系与M系的遗传距离较近,而与B系之间距离较远,三者亲缘关系以F系与M系较近,这与各个品系的引种背景相一致.     

鳜塘浮游生物DNA序列多样性、水质和疾病的关系

应用RAPD技术研究了鳜塘水生生态系统中浮游生物群落α-多样性,分析了浮游生物群落DNA序列丰富度与水质和疾病发生之间的关系,探讨了池塘养殖密度和短周期、小密度、高投饵量养殖方式对浮游生物群落DNA序列丰富度及水质的影响.结果表明：1)鳜塘浮游生物群落DNA序列丰富度与水质综合指数呈显著负相关关系(P<0.01); 2)池塘高密度养殖会造成浮游生物丰富度降低和水质综合指数升高;3)短周期、小密度、高投饵量的养殖模式对环境的损伤较大;4)浮游生物群落DNA指纹01矩阵和水质理化因子样品聚类分析表明,发病塘在水质理化因子和浮游生物群落上具有相似性,为鳜疾病预报模型的建立奠定了基础.     

2005年第16届国际生物学奥林匹克竞赛实验考试答案

第,部分DD问题2问题5问题3B DB问题,问题4第2部分问题IA问题4C问题7D问题10G问题13C问题16A问题19B问题22B问题25第3部分问题ID问题ZF问题SB问题SB问题11D问题14B问题17问题20B问题23D问题3C问题6E问题gC问题12E问题15E问题18A问题21A问题24B问题4A问题7B问题8一3A问题8一6F问题10C问题13C第4部分问题,B问题4A问题7D问题10D问题13A问题16B问题SC问题8一ID问题8一4G问题8一7E问题11A问题14A问题6 ACE问题8一ZC问题8一SB问题gB问题12C问题ZB问题SD问题SA问题11B问题14G问题17D问题3C问题6E问题gD问题12F问…     

2005年第16届国际生物学奥林匹克竞赛理论考试答案

题号答案题号答案题号答案题号答案题号答案题号答案题号答案题号答案l一l A l一2 B l一3 D 1-4 E 2 C 3 C 4 B 5 A 6 E 7 D 8 B 9 D l0 ll B l2 D l3 C l4 AC 15 E l6 B l7 B l8 B l9 A 20 C 2l B 22 E 23 B 24 D 25一l G 25一2 F 25一3 D 25--4 A 25一5 B 26 27 28 C 29 E 30     

第11届国际生物奥林匹克竞赛(2000)理论试题B答案

细胞生物学1.删除2 .1,3,5 ,6 ,73.删除4 .2 ,6　 2 ,3,4 ,5　 6　 1,3,5　 1,3,5　 8　 75 .A　　 B6 .A　　B　　C　　 E　　D　　F7.7a.(1) 5 80　　 (2 ) 3407b. 8.DNA解旋酶 2引发酶 1DNA聚合酶 有 3′- 5′外切核酸酶活性 5DNA连接酶 4拓扑异构酶 DNA聚合酶 有 5′- 3′外切核酸酶活性 39.　　 C)　　　· H　　　　　　· H　　　　　　·E　　　　　　·F10 .RNA聚合酶 DNA聚合酶 聚合酶在 DNA区域开始识别和结合 A B聚合方向 D D酶在模板链上移动的方向 C C核苷酸底物加到生长链上的核苷酸类型 F E3′- 5′外…     

第13届国际生物奥林匹克竞赛(2002)实验试题答案

(续 2 0 0 3年第 38卷第 6期第 5 7页 )实验 动物系统学和形态学Q1.　 (5分 )A B C D E F G H I J0 1 0 1 0 2 0 4 0 1 0 1 0 1 0 1 0 5 0 3Q2　 (5分 )A B C D E F G H I J0 1 0 2 0 4 0 5 0 1 0 6 0 3 0 70 80 9Q3　 (10分 )A B C D E F G H I JK + + +L +M ++ +N +O +P +R ++S ++T ++ +++ +Q4 A　 (4分 ) 　□　□　　 　□　□Q4 B　 (1分 )　　□Q5　 (5分 )A B C D E F G H I J0 3 0 1 0 2 0 2 0 3 0 3 0 1 0 1 0 3 0 2Q6　 (10分 )　　 A.Gammaruspulex(钩虾 )　 B.Anopheles sp.(疟　蚊 )　 C.H irudo …     

Genetic Differentiation and Conservation of 14 Surviving Individuals of Euryodendron excelsum Endemic to China

Random amplification polymorphic DNA (RAPD)markers were used to assess the genetic variations and the evolutionary relationships among all 14 individuals of a critically endangered Euryodendron excelsum (Theaceae)population distributed in Ba Jia Zhen,Yangchun,Guangdong,China.Twenty-three random primers detected 156 sites,out of which 95 (60.26%) were polymorphic loci.The number of the observed alleles was 1.6090,and the number of the effective alleles was 1.3471.Nei's gene diversity was 0.1993,and Shannon index was 0.1534.A relatively high level of genetic variation was identified in E.excelsum.An unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) tree established from Jaccard similarity coefficients suggested that 14 individuals were clustered into two subgroups and that the No.2 plant was genetically distant from the rest of the individuals.The UPGMA clustering was also supported by a principle components analysis of RAPD phenotypic data.The management and conservation strategy of E.excelsum was proposed based on our results.     

Genetic Differentiation and Conservation of 14 Surviving Individuals of Euryodendron excelsum Endemic to China

Random amplification polymorphic DNA (RAPD) markers were used to assess the genetic variations and the evolutionary relationships among all 14 individuals of a critically endangered Euryodendron excelsum (Theaceae) population distributed in Ba Jia Zhen, Yangchun, Guangdong, China. Twenty-three random primers detected 156 sites, out of which 95 (60.26%) were polymorphic loci. The number of the observed alleles was 1.6090, and the number of the effective alleles was 1.3471. Nei’s gene diversity was 0.1993, and Shannon index was 0.1534. A relatively high level of genetic variation was identified in E. excelsum. An unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) tree established from Jaccard similarity coefficients suggested that 14 individuals were clustered into two subgroups and that the No. 2 plant was genetically distant from the rest of the individuals. The UPGMA clustering was also supported by a principle components analysis of RAPD phenotypic data. The management and conservation strategy of E. excelsum was proposed based on our results. Translated from Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni, 2005, 44(1) (in Chinese)     

鄱阳湖不同水文期浮游生物群落结构特征和影响因素及水质评价

为阐明鄱阳湖不同水文期浮游生物群落结构特征及其影响因素, 研究于2017年8月(丰水期)和12月(枯水期)在鄱阳湖湖区典型水域设置5个采样点进行浮游生物采样调查。研究期间共鉴定浮游植物8门75属186种, 丰水期与枯水期均以硅藻门和绿藻门为主。共鉴定浮游动物4类76种, 丰水期与枯水期均以原生动物和轮虫为主。方差分析显示: 浮游植物密度与生物量在不同水文期之间的差异均为极显著(P<0.01), 浮游动物丰水期密度高于枯水期, 但无显著差异(P>0.05), 浮游动物生物量(P<0.05)在不同水文期差异显著。冗余分析(RDA)显示: 丰水期透明度和浮游生物呈显著负相关关系, 电导率和浮游生物呈显著正相关。透明度、电导率与营养盐是影响丰水期浮游生物群落结构的主要环境因素, 枯水期水温和溶解氧是驱动鄱阳湖浮游生物群落生态分布的主要环境因素。基于Shannon-Wiener(H′)、Margalef(d)和Pielou(J)等生物多样性指数的水质评价结果表明: 鄱阳湖研究区域水质状态处于寡污-中污之间。研究揭示了2个水文期对通江湖泊浮游生物的影响: 季节变化不改变湖泊浮游生物的物种组成及优势种, 但显著影响浮游生物的丰度及多样性。     

不同来源鼠李糖乳杆菌的随机扩增多态DNA分析

[目的]建立鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus,Lr)菌株之间的分子鉴别方法并分析不同分离株之间的遗传多样性.[方法]从56份采集自中国新疆和田和广西巴马瑶族自治县的长寿老人粪便样本中分离得到的乳酸菌中,经生理生化分析和API 50CHL试验条鉴定,获得10株Lr.对10株Lr分离株和1株Lr标准株ATCC7469进行了随机扩增多态DNA分析,从50条随机引物中筛选到5条在菌株水平上具有鉴别力的引物P14、OPG28、OPG25、P7和P4并建立和优化了Lr菌株RAPD指纹图谱扩增方法.根据RAPD结果计算菌株间的遗传相似系数并进行聚类分析.[结果]获得了清晰稳定的DNA指纹图谱,扩增产物大小在100～2000bp之间,菌株间呈现显著的DNA多态性,不同来源的Lr分离株的遗传相似系数在0.581～0.935之间,在相似系数0.80水平上可以将11株Lr菌株分为5个类群,其中分离自新疆和田的Lr菌株归在类群B和类群C,而分离自广西巴马瑶族自治县的Lr菌株归在类群D和类群E.[结论]应用RAPD方法对Lr菌株进行分子鉴别是可行的,不同来源的Lr之间存在着较大的种内遗传多态性和不同的亲缘关系.     

中国蜜环菌生物种的RAPD分析

以中国蜜环菌(Armillaria mellea (vahl: Fr.) Kummer)生物种B．生物种E分别与欧洲种A. gallica 和A. ostoyae交配,用AP—PCR技术分析了中国五个生物种及欧洲2个种的代表菌株的系统发育关系。根据系统聚类分析的结果,将其分为4个群：生物种B与A．Gallia, A与C,D与E,A. ostoyae 单独为一群。这与交配试验及RAPD图谱直观分析的结果一致,最小支撑树也支持将中国生物种B鉴定为A．Gallica。证明RAPD是研究蜜环菌生物种的进化关系的有用手段。     

Changes in Microbial Plankton Assemblages Induced by Mesoscale Oceanographic Features in the Northern Gulf of Mexico

Mesoscale circulation generated by the Loop Current in the Northern Gulf of Mexico (NGOM) delivers growth-limiting nutrients to the microbial plankton of the euphotic zone. Consequences of physicochemically driven community shifts on higher order consumers and subsequent impacts on the biological carbon pump remain poorly understood. This study evaluates microbial plankton <10 μm abundance and community structure across both cyclonic and anti-cyclonic circulation features in the NGOM using flow cytometry (SYBR Green I and autofluorescence parameters). Non-parametric multivariate hierarchical cluster analyses indicated that significant spatial variability in community structure exists such that stations that clustered together were defined as having a specific ‘microbial signature’ (i.e. statistically homogeneous community structure profiles based on relative abundance of microbial groups). Salinity and a combination of sea surface height anomaly and sea surface temperature were determined by distance based linear modeling to be abiotic predictor variables significantly correlated to changes in microbial signatures. Correlations between increased microbial abundance and availability of nitrogen suggest nitrogen-limitation of microbial plankton in this open ocean area. Regions of combined coastal water entrainment and mesoscale convergence corresponded to increased heterotrophic prokaryote abundance relative to autotrophic plankton. The results provide an initial assessment of how mesoscale circulation potentially influences microbial plankton abundance and community structure in the NGOM.     

中国栽培糙皮侧耳品种体细胞不亲和性实验与RAPD分析结果的比较

对收集的糙皮侧耳Pleurotus ostreatus19个栽培菌株在贫营养的半PDA培养基中配对进行拮抗线实验,考察其相互间体细胞不亲和性。结果表明,此19个菌株间出现拮抗线的比率是100%,形成的拮抗线类型可分为菌丝集结型(A型)、隔离带型(B型)和暗线型(D型)三类,出现的比例分别是24.9%、23.7%和51.4%。显微观察暗线型拮抗线区域有菌丝自融形成的溶菌沟,另2种拮抗线中没有菌丝自溶。以拮抗线类型分别作为变量进行NTSYS-PC聚类分析,从相似性系数0.48处截断可将其分为3大类,第一类包括802和黑平王等9个菌株;第二类包括苏引6号和江都71等6个菌株;第三类包括夏王40和早秋高丰等4个菌株。应用13条随机引物扩增此19株糙皮侧耳菌株总DNA,共扩增出917条不同分子量的DNA条带。RAPD聚类分析表明,这些菌株的遗传相似性高达85%以上。从相似性系数0.86处截断,也可将这些菌株分为3大类,第一类包括了802和黑平王等17个菌株;第二类仅包括推广一号和夏王40两个菌株;第三类只有831一个菌株。两种方法的聚类分析结果没有相关性。因此,拮抗反应可以作为评价糙皮侧耳栽培菌株之间遗传多样性的方法之一,但与基因组DNA指纹多样性分析结果并不完全吻合,更不能代替分子指纹分析。     

Genetic diversity of the easternmost fragmented mediterranean <Emphasis Type="Italic">Pinus halepensis</Emphasis> Mill. populations

The genetic structure of fragmented Aleppo pine (Pinus halepensis Mill.) populations in Jordan was investigated using RAPD markers. The level of within-population polymorphism was low, while differentiation among populations was large, suggesting a low level of gene flow. Population differentiation and genetic distance between populations were not related to geographical distance. Clustering based on multivariate discriminant analysis showed that geographically distant populations clustered together with a high clustering accuracy and strong relationship to rainfall. Results supported that the current population configuration is the result of fragmentation of a once larger and contiguous population due to Holocene conditions exacerbated by increased human disturbance of forest ecosystems. Implications for conservation strategies are discussed.