新分离的副粘病毒Tianjin株的全基因组序列分析

副粘病毒Tianjin株是一株对普通棉耳狨猴具有高致病性,并可能与人类下呼吸道感染密切相关的毒株.为了明确其基因结构、变异特点及种系进化地位,采用RT PCR、测序和拼接,获得了副粘病毒Tianjin株全基因组序列,与GenBank登录的副粘病毒科7个属和尚未分类的28株病毒及7株仙台病毒代表株,进行同源性比较及系统进化分析.结果表明,副粘病Tianjin株属于副粘病毒科、副粘病毒亚科、呼吸道病毒属,与仙台病毒关系最近.基因组全长及组成规律与仙台病毒相似,只是L基因末尾A15240C变异而使L蛋白增加了一个谷氨酸残基.副粘病毒Tianjin株存在440个独特的核苷酸变异位点,导致110个氨基酸残基的改变,系统进化上构成独立的分支.副粘病毒Tianjin株在基因组序列、宿主亲嗜性和致病性等方面与已知仙台病毒存在较大的差异,可能代表仙台病毒的一个新基因型.     

一株引起普通棉耳狨猴死亡病毒的分离与鉴定

1999年6月,天津医科大学动物中心饲养的珍贵灵长类实验动物--普通棉耳狨猴群体中暴发急性呼吸道传染病,病死率高达33%.在排除细菌感染的基础上,通过死亡狨猴肺组织匀浆接种鸡胚和MDCK细胞的分离培养,分离出一株具有高血凝效价的病毒株.经双份血清试验及动物接种试验,确认该病毒是本次疾病流行的病原体.又进一步通过与常见呼吸道病毒标准毒株及血清进行交叉血凝抑制试验、电镜观察、RT-PCR技术并结合生物信息学方法对该毒株进行鉴定,确认本次疾病流行的病原体是副流感1型病毒中的仙台病毒.     

一株引起普通棉耳狨猴死亡病毒的分离与鉴定

1999年6月,天津医科大学动物中心饲养的珍贵灵长类实验动物——普通棉耳狨猴群体中暴发急性呼吸道传染病,病死率高达33％。在排除细菌感染的基础上,通过死亡狨猴肺组织匀浆接种鸡胚和MDCK细胞的分离培养,分离出一株具有高血凝效价的病毒株。经双份血清试验及动物接种试验,确认该病毒是本次疾病流行的病原体。又进一步通过与常见呼吸道病毒标准毒株及血清进行交叉血凝抑制试验、电镜观察、RT—PCR技术并结合生物信息学方法对该毒株进行鉴定,确认本次疾病流行的病原体是副流感1型病毒中的仙台病毒。     

狨猴的常见疾病及死因的分析研究

本文对棉顶狨猴、普通狨猴和鞍背狨猴在实验室笼养条件下,进行了近８年狨猴的发病类型及致死原因的分析研究,结果表明引起狨猴死亡的常见疾病是：肺炎、痢疾、消耗性综合症、产后大出血等。并根据狨猴的疾病摸索了一套有效的防治方案,这对于狨猴的饲养与繁殖,保证科学实验用健康的狨猴群体具有重要的意义。     

人类甲型肝炎动物模型（狨猴）的研究

本文报道以不同剂量的不同HAV毒株,经静脉和胃肠道分别接种普通狨猴和白须狨猴后,其血清ALT、AsT和LDH活性均见升高。对酶活性比接种前增加,大于十3SD值的6只狨猴作肝活组织检查,见有与急性病毒肝炎相一致的组织病理变化。此外,用免疫电镜法检出狨猴粪便中HAV颗粒,狨猴接种HAV后36天,血清IgM类和总抗HAV抗体均阳转。上述结果提示,普通狨猴有可能作为研究甲型肝炎的理想动物模型。     

仙台病毒RT-PCR检测方法的建立及灰仓鼠中流行情况调查

目的建立仙台病毒（SV）RT-PCR检测方法,并对灰仓鼠仙台病毒感染情况进行调查。方法根据NCBI发表的SV（gi：9627219）基因组序列设计引物,建立RT-PCR方法,对方法的特异性和灵敏性进行验证,并用该方法检测60份灰仓鼠的肺脏样本。结果建立的SV RT-PCR方法显示有较好的敏感性和特异性：以仙台病毒为模板扩增产生197 bp的单一目的条带,经测序比对与NCBI数据库中SV相关序列的一致率为98%,而以猴副流感病毒（SV5）、犬瘟热病毒、小鼠肺炎病毒、呼肠孤病毒III型及腮腺炎病毒为对照无任何条带产生;能检出的SVcDNA最低浓度是96.8 ng/mL;用该方法检测60份灰仓鼠,SV的感染率为3.33%（2/60）。结论建立的SV RT-PCR方法可用于实验类啮齿动物动物SV的常规检测,自然条件下灰仓鼠感染SV的问题不容忽视。     

副粘病毒Tianjin株NP蛋白的表达及分析

1999年,本实验室从群体性暴发的急性呼吸道感染素致死的普通棉耳绒猴肺组织中分离到一株副粘病毒,命名为副粘病毒 Tianjin株.经研究发现该动物中心的工作人员都有此病毒抗体,且正常人群(献血员)抗体阳性率高达46%,急性呼吸道感染的患儿抗体阳性率为19.28%,提示此病原体与人类可能有密切的关系.     

实时聚合酶链反应方法检测人偏肺病毒的比较研究

人偏肺病毒(the human metapneumovims,hMPV)是2001年首次从荷兰儿童的鼻咽部吸出物中分离出来的,为一种负链RNA病毒,初步被归属于副粘病毒科偏肺病毒属。hMPV和流感病毒、副流感病毒、腺病毒、鼻病毒、冠状病毒、人呼吸道合胞病毒(hRSV)一样可导致儿童、成人及免疫功能受损患者的急性呼吸道感染(ARTI)。在儿童病原体不明的ARTI中,hMPV占1．5％-10％。但是,该病毒在     

基于高通量测序技术测定普通棉耳狨猴粪便微生物多样性

目的应用高通量测序技术分析普通棉耳狨猴粪便菌群的结构与组成,为进一步开发利用新型实验动物奠定基础。方法采集4只成年雄性普通棉耳狨猴粪便,用细菌16SrRNA通用引物扩增V3~V4区,采用IlluminaMiSeq测序平台对普通棉耳狨猴粪便微生物进行研究。结果共测序获得315511条有效序列与596个OTU。普通棉耳狨猴粪便中的细菌共鉴定出9个门、14个纲、26个目、50个科、82个属和64个种和226个OTU。其中,1)优势门是拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes),平均含量分别为54.52%和25.39%2)丰度最高的纲为拟杆菌纲(Bacteroidia)和厌氧菌纲(Negativicutes),平均含量为54.5%和17%。3)乳杆菌目(Lactobacillales)和拟杆菌目(Bacteroidales)的丰度最高,为50.01%和20.52%。4)普雷沃菌科(Prevotellaceae)和双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)所占丰度最高,平均含量分别为43.14%和11.33%。5)双歧杆菌属(Bifidobacterium)和拟杆菌属(Bacteroides)的丰度较高,平均含量分别为11.33%11.12%。6)有益菌群双歧杆菌属丰度较高,但在所检测样本中都含有。7)丰度最高的前10个种,归类为7个科、5个纲。这10个种占到33.16%,其他53种总和仅占到0.74%,其他未鉴定出菌种,且相对丰度还较高,需要进一步研究。8)PICRUSt功能预测分析:氨基酸转运等代谢功能和蛋白质翻译、折叠遗传信息处理功能丰度较高。结论应用高通量测序技术,较全面的检测了普通棉耳狨猴粪便菌群,普通棉耳狨猴粪便细菌组成具有丰富的多样性,其中还有许多未被分类鉴定且相对丰度较高的细菌,需要进一步研究。     

精制甲型肝炎灭活疫苗的狨猴保护实验

目的　检测精制甲型肝炎 (甲肝 )灭活疫苗的保护效果。方法　甲型肝炎病毒 (YN5株 )经Vero细胞培养制成精制甲肝灭活疫苗 ,采用普通狨猴进行疫苗的免疫原性和保护性研究。结果　 7只狨猴均有特异性抗体产生 ,无血清酶活性升高和肝组织学病理改变 ,接种疫苗的狨猴能抵抗甲肝病毒强毒 (Han ZD)株的攻击。但是 ,对照组狨猴均出现血清酶异常升高和肝组织学病理改变。结论　甲肝灭活疫苗 (YN5株 )具有良好的免疫原性和保护效果。     

封面图片介绍

正H7N9型禽流感病毒(avian influenza A),属正粘病毒科甲型流感病毒属,其内部基因来自于H9N2禽流感病毒,是一种新型重配病毒。长江三角和珠江三角是人感染H7N9禽流感的高发地区,通常在冬春季节高发流行。主要经由呼吸道传播,也可通过密切接触感染的禽类分泌物或排泄物等被感染,直接接触病毒也可被感染。人感染H7N9禽流感潜伏期一般为7天以内,普通患者表现为流感样症状,如发热、咳嗽,可伴有头痛、     

PHA对EBV抗原和DNA合成诱导物的作用的分析

在人类疱疥病毒属中,Epstein-Barr病毒(EB病毒)与寄主细胞的相互关系是相当独特的。一方面这种病毒的寄主细胞范围十分狭窄,迄今只发现人和狨猴的B淋巴细胞能接受感染,另方面病毒基因组的复制和表达,例如病毒衣壳抗原(VCA)和早期抗原(EA)的合成等都受到寄主细胞的严格地控制,即使在生产性细胞如PaHR-1中VCA~ 细胞率也只在1—5%的范围。为此,不少作者曾报道了以各种诱导因子单独或协同地作用于携带EB病毒基因组的细     

抗流感病毒药物研究进展

流感病毒属于正粘病毒科流感病毒属,根据病毒核蛋白分A、B和C三型。A型流感病毒能感染多种动物包括家禽、马、猪和人,B型和C型则主要感染人。当前致死率最高的高致病性禽流感H5N1病毒和2009年暴发的H1N1甲型流感病毒均为A     

抗流感病毒药物研究进展

流感病毒属于正粘病毒科流感病毒属,根据病毒核蛋白分A、B和C三型。A型流感病毒能感染多种动物包括家禽、马、猪和人,B型和C型则主要感染人。当前致死率最高的高致病性禽流感H5N1病毒和2009年暴发的H1N1甲型流感病毒均为A     

野生白须狨猴的体内寄生虫

本文介绍了对我所引进的野生白须狨猴体内寄生虫检查初步结果,在14只白须狨猴静脉血液涂片检查中,均发现有微丝蚴;经对死亡6只白须披猴的尸检,发现感染最严重的是线虫,其次是蛇舌形虫、棘头虫。同时对寄生虫直接导致狨猴死亡的可能性和防治方法作了初步探讨。     

介绍一种灵长目实验动物——狨猴

狨猴属灵长目(Primates),狨科(Callithriadac),约有30个种及许多具有生育力的杂交种。最早在西方国家作为玩赏兽饲养,至60年代初才开始小群繁殖,以估计其用于生物学、医学研究的可能性。60年代后期便被广泛用于科学研究。目前以普通狨猴(Callithrix jaccus)繁殖情况最佳,用量也最多(见图1)。 成年狨猴体重300—500克,性情温顺,容易饲养,繁殖力高,一年可生二胎,一胎可产仔2—3只,怀孕期平均142天,流产率和死产率各仅1％左右,14—16周断乳,生育力无季节性差     

副粘病毒Tianjin株NP、P、M及L蛋白的生物信息学分析

为了进一步明确副粘病毒Tianjin株的来源和种系进化地位,探讨其高致病性的机制.对Tianjin株NP、P、M及L蛋白进行了生物信息学分析.进化树显示:Tianjin株属于副粘病毒亚科呼吸道病毒属,且很可能为仙台病毒新的基因型.相似性比较表明,P蛋白变异最大.相似性仅为78.7%～91.9%;L蛋白相似性最高,为96.0%～98.0%.序列比对显示:NP蛋白氨基酸序列中存在15个独特的变异位点,P蛋白存在29个,M蛋白存在6个,L蛋白存在29个.这些独特变异位点的存在很可能是导致Tianjin株在宿主来源和致病特点等方面与已知仙台病毒株具有较大差异的原因.     

生物技术在新城疫疫苗研究上的应用

新城疫病毒(NDV)是副粘病毒科、副粘病毒属的原型病毒,亦称副粘病毒1型(APMV-1),属于不分节段的负极性单股基因组RNA病毒。它所引起的传染病——人兽共患新城疫(ND)至今仍是对世界养禽业危害和威胁最严重的病毒病之一。NDV是一种高度接触传染性病原,在小鸡、火鸡、鸽、鹤、鹌鹑和数种鸟群中能引起100％发病死亡。为此,国内外学者一直对ND防治研究给予高度重视。现代生物     

引进的棉顶狨猴群简介

棉顶狨猴(Cotton-top tamarin;Saguinus oedipus oedipus:以下简称棉狨)产于南美哥伦比亚,是珍稀濒危(犭胥)狨猴的一种。狨猴体型小,易于实验室笼养,是肿瘤、心血管病、肝炎、计划生育等研究中较为理想的模型动物。近年来,建立实验室狨猴繁殖群已在国内外引起重视。1988年7月,本所从英国引进6只(3雌3雄)育龄棉狨,计划由此建立实验室繁殖群落。经半年余适应性饲养管理,目前个个健康活泼,3只雌猴均有妊娠迹象。现将基本情况报告于后。     

套式RT—PCR方法检测临床样品中的猪流感病毒

猪流感是由猪流感病毒(Swine influenza vi rus, SIV)引起的一种呼吸道传染病,具有发病率高、死亡率低的特点,罹患流感的怀孕母猪还有并发流产的危险。猪流感已给我国养猪业带来严重危害。SIV属于正粘病毒科 A 型流感病毒属[1]。A型流感病毒可感染多种动物,一般认为,水禽是流感病毒的自然宿主和基因库,猪则是人流感病毒株与禽流感病毒株的中间宿主和混合器[1],通过基因重配产生抗原转移而导致新流感病毒株的出现。研究病毒两种受体[2],因此所有A型流感病毒都能感染猪,猪在流感病毒的生态分布中占有重要地位。目前猪流感的主要流行血…