辛德毕斯病毒基因组结构与功能研究进展

辛德毕斯病毒(Sindbis virus, SINV)属于披膜病毒科(Togaviridea)甲病毒属(Alphavirus),为甲病毒属的代表株.1952年首次分离于埃及尼罗河三角洲辛德毕斯地区库蚊中,国际将首次分离的AR339株作为SINV的标准株.SINV可引起人类多种中毒反应包括发热、皮疹、关节炎甚至脑炎.SINV世界性分布,在很多地区流行,印度、南非、澳大利亚、俄罗斯等地区均从库蚊标本中分离到该病毒.     

我国分离的甲病毒YN87448毒株全部结构区基因核苷酸的序列测定及分析

ＹＮ８７４４８毒株１９８６年分离自云南傣族５２岁女发热病人的血液标本,曾用血清学方法鉴定为披膜病毒科甲病毒属。用我们创立的单引物差异ＲＴ－ＰＣＲ方法及简并引物ＴＲＴ－ＰＣＲ法均已证明：该病毒甲病毒属的辛德毕斯样病毒。本研究从甲病毒属的病毒基因序列的共同保守区,设计４对引物。     

云南省甲属披膜病毒的分离和鉴定

从采自云南省的6种蚊子和1份发热病人血清分离到披膜病毒11株,电镜检查该病毒为球形有囊膜颗粒,直径为56.10±1.38nm,病毒抵抗5-IdU,对酸、热、醚均敏感,在pH5.5～6.4间能凝集鹅血球,乳鼠皮下或脑内注射均能稳定致死,酶免疫法鉴定表明这11株病毒与甲属披膜病毒(MAY、RR、WEE、EEE)抗体有反应,尤与MAY反应最强,与我国分离的M1、M4病毒抗体也有反应,但空斑抑制中和试验显示,云南甲病毒和MAY病毒间没有交叉中和反应,在以上性状方面蚊体和人体分离的病毒间未见明显差异,对云南甲属病毒的分类学地位及我国甲属披膜病毒分布和意义进行了讨论。     

辛德毕斯病毒基因组结构与功能研究进展

辛德毕斯病毒(Sindbis virus, SINV)属于披膜病毒科(Togaviridea)甲病毒属(Alphavirus),为甲病毒属的代表株.1952年首次分离于埃及尼罗河三角洲辛德毕斯地区库蚊中,国际将首次分离的AR339株作为SINV的标准株.     

盖塔病毒研究进展

盖塔病毒(Getah virus,GETV)是披膜病毒科甲病毒属的虫媒病毒.GETV感染已在多种脊椎动物中发现,包括人类、猴子、鸟类、猪、马和其他哺乳动物.GETV感染可导致马出现发热、全身皮疹和腿水肿,仔猪关节炎和母猪生殖障碍等.目前GETV在世界范围内流行较为广泛,近年来逐步在猪群中暴发,导致部分猪场经济损失严重,同时在中国感染的宿主范围不断扩大,相继出现了第一例狐狸、猪、马、牛感染.本文对GETV的分子结构、致病机制、宿主范围、流行状况以及疫苗研究进展进行综述,以期为我国GETV的深入研究及防控工作提供一定思路.     

基孔肯雅病毒疫苗的研究进展

基孔肯雅热是由基孔肯雅病毒(Chikungunya virus,CHIKV)引起的一种急性传染病。基孔肯雅病毒属披膜病毒科甲病毒属。近年来,该病毒死灰复燃,在全球多处引发大规模疫情暴发,是重要的全球性公共卫生问题之一。目前尚无针对CHIKV的疫苗和有效抗病毒药物。疫苗一直是CHIKV研究的热点领域,目前已经取得了很大的进展,就基孔肯雅病毒疫苗的研究进展进行了综述。     

Coltivirus病毒属研究进展

Ｃｏｌｔｉｖｉｒｕｓ病毒属 (Ｃｏｌｔｉｖｉｒｕｓ ,Ｃｏｌｔｉ)为呼肠病毒科病毒 ,以科罗拉多蜱媒热病毒 (Ｃｏｌｏｒａｄｏｔｉｃｋｆｅｖｅｒｖｉｒｕｓ,ＣＴＦＶ)为代表株 ,该病毒原为环状病毒属成员 ,由于其对人有致病性 ,可引起人的发热和脑炎 ,病毒核心的衣壳表面结构     

Coltivirus病毒属研究进展

Coltivirus病毒属(Coltivirus,Colti)为呼肠病毒科病毒,以科罗拉多蜱媒热病毒(Colorado tick fever virus,CTFV)为代表株,该病毒原为环状病毒属成员,由于其对人有致病性,可引起人的发热和脑炎,病毒核心的衣壳表面结构不同于典型的环状病毒,尤其是病毒基因组为12个双链RNA节段而不是环状病毒的10个节段,核酸分子量27×106,远比环状病毒(18×106)大,故单列一属.目前全世界已在美洲、亚洲和欧洲等地分离到数十株Colti病毒(主要病毒株的分离年代和地区见表1).     

云南省两株环状病毒的分离和鉴定

从云南省采集的中华(?)蚊和棕头库蚊中,分离到两株对3周鼠致死的病毒。血清学鉴定表明,该病毒与披膜病毒科(甲病毒属)、黄病毒科、布尼亚病毒科病毒的免疫腹水,以及呼肠孤病毒科环状病毒(M14)的免疫腹水均不发生反应。电镜观察病毒为球形,具双层壳体的颗粒,直径为70.35±3.07nm,毒粒常常和颗粒状包涵体及管状结构相连;核衣壳具有环状病毒特有的20面体对称结构,直径为56.06±2.42nm。在负染标本中能观察到直径为38.36±2.42nm的核心颗粒。该病毒对乙醚相对抵抗,对酸,热敏感。聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,病毒基因组由10条RNA片段组成,分子量在0.3～2.5×10~6道尔顿之间,病毒基因组RNA带形分布(3-3-3-1)类似环状病毒,但与已知环状病毒RNA带形分布都有不同。     

辛德毕斯病毒载体的研究进展

辛德毕斯病毒（Sindbis virus,SIN）属于披膜病毒科（Togaviridae）甲病毒属（Alphavirus）,全世界各大洲均有分布,是由吸血的蚊虫等传播的虫媒病毒,可引起“辛德毕斯综合热”,表现为发热、倦怠、头痛、关节痛和皮疹等,可自愈。无论从病毒形态、结构、病毒复制和翻译等功能辛德毕斯病毒均集中体现了动物病毒的特征,使其成为研究动物病毒基本规律的模型病毒,因此对该病毒的研究成为热点。 　　自1983年Brenard Moss首次将痘苗病毒改造为痘苗病毒载体以来［1］,病毒载体的研究一直是病毒学中一个十分活跃的领域。早期的人们主要把精力集中在DNA病毒载体上,如痘苗病毒、腺病毒、疱疹病毒等［1］。     

云南辛德毕斯病毒的生物学性状研究

本文对云南首次分离到的Sindbis病毒进行了滤过试验,耐酸耐醚试验、致细胞病变、动物敏感性试验、血压 凝特性、空斑和毒力等试验研究,结果符合披膜病毒科的病毒特性。交 因抑试验和免疫荧光试验,以及空斑减小中和试验进一步证实为甲病毒属的Sindbis病毒,其空斑纯化株的生物学特性也与原株相符,纯化株的制备为该株病毒分子生物学研究的准确性和一致性提供了条件。云南Sindbis病毒的首次分离具有重要的流行病学意义,其生物学特性研究结果对我省该病的诊断和防治具有重要的指导意义。     

云南辛德毕斯病毒的生物学性状研究

本文对云南首次分离到的Sindbis病毒进行了滤过试验、耐酸耐醚试验、致细胞病变、动物敏感性试验、血凝特性、空斑和毒力等试验研究,结果符合披膜病毒科的病毒特性。交叉血抑试验和免疫荧光试验,以及空斑减少中和试验进一步证实为甲病毒属的Sindbis病毒。其空斑纯化株的生物学特性也与原株相符,纯化株的制备为该株病毒分子生物学研究的准确性和一致性提供了条件。云南Sindbis病毒的首次分离具有重要的流行病学意义,其生物学特性研究结果对我省该病的诊断和防治具有重要的指导意义。     

辛德毕斯病毒YN87448株与宿主细胞凋亡的研究

为了了解云南辛德毕斯病毒在BHK2 1细胞上的生长特性 ,并观察该病毒在BHK2 1细胞、3d龄和 2周龄小白鼠中是否有凋亡反应出现。在接种后不同时间取样 ,检测病毒的滴度 ,电镜检测凋亡细胞 ,检测细胞的DNA阶梯。一步生长曲线结果表明病毒在出现CPE之前就有大量繁殖。秋水仙素对该病毒的成熟释放没有抑制作用。该病毒对BHK2 1、小白鼠均可产生细胞凋亡     

Interaction of E2 Glycoprotein with Heparan Sulfate Is Crucial for Cellular Infection of Sindbis Virus

Cell culture-adapted strains of Sindbis virus (SINV) initially attach to cells by the ability to interact with heparan sulfate (HS) through selective mutation for positively charged amino acid (aa) scattered in E2 glycoprotein (W. B. Klimstra, K. D. Ryman, and R. E. Johnston, J. Virol. 72: 7357–7366, 1998). Here we have further confirmed that interaction of E2 protein with HS is crucial for cellular infection of SINV based on the reverse genetic system of XJ-160 virus, a Sindbis-like virus (SINLV). Both SINV YN87448 and SINLV XJ-160 displayed similar infectivity on BHK-21, Vero, or C6/36 cells, but XJ-160 failed to infect mouse embryonic fibroblast (MEF) cells. The molecular mechanisms underlying the selective infectivity of XJ-160 were approached by substituting the E1, E2, or both genes of XJ-160 with that of YN87448, and the chimeric virus was denominated as XJ-160/E1, XJ-160/E2, or XJ-160/E1E2, respectively. In contrast to the parental XJ-160, all chimeric viruses became infectious to wild-type MEF cells (MEF-wt). While MEF-Ext ^−/− cells, producing shortened HS chains, were resistant not only to XJ-160, but also to YN87448 as well as the chimeric viruses, indicating that the inability of XJ-160 to infect MEF-wt cells likely due to its incompetent discrimination of cellular HS. Treatment with heparin or HS-degrading enzyme resulted in a substantial decrease in plaque formation by YN87448, XJ-160/E2, and XJ-160/E1E2, but had marginal effect on XJ-160 and XJ-160/E1, suggesting that E2 glycoprotein from YN87448 plays a more important role than does E1 in mediating cellular HS-related cell infection. In addition, the peptide containing 145–150 aa from E2 gene of YN87448 specifically bound to heparin, while the corresponding peptide from the E2 gene of XJ-160 essentially showed no binding to heparin. As a new dataset, these results clearly confirm an essential role of E2 glycoprotein, especially the domain of 145–150 aa, in SINV cellular infection through the interaction with HS.     

赤羽病病毒核蛋白基因克隆和序列分析

参考GeneBank发表的赤羽病病毒(Akabane virus,AKAV)的核蛋白基因(SmRNA)序列,设计合成一对引物,从分离自牛体的AKAVBHK21细胞培养物巾提取总RNA,对．AKAV核蛋白基因进行RT-PCR扩增,产物经琼脂糖电泳分析,呈现一条约696bp的条带,同收纯化后,将其克隆至pMD18-T质粒载体中,然后进行核苷酸序列分析。与GenBank中报道的多株AKAV编码核衣壳蛋白(N)的SmRNA基因比较后发现,与其它株的核苷酸的同源性为94．2％～98．3％,推导的氨荜酸的同源性为97．6％～100％,证实为AKV的N基冈。为生产AKAV特异性核蛋白抗原、免疫血清学诊断试剂的制备和分子生物学研究打下了坚实基础。     

中国分离巴泰病毒基因组全编码区序列测定和分析

采用RT-PCR和TAIL-PCR方法,首次对我国分离的巴泰病毒(YN92-4株)基因组的全编码区进行序列测定和分析。结果显示,YN92-4株病毒基因组由S、M、L三个片段组成,长度分别为947、4 371、6 860个核苷酸。其中,S片段基因编码由234个氨基酸残基组成的核衣壳蛋白和由102个氨基酸残基组成的非结构蛋白,M片段基因编码由1 435个氨基酸残基组成的前体蛋白,L片段基因编码由2 239个氨基酸残基组成的RNA聚合酶。与国外其它地区的巴泰病毒分离株进行基因组全编码区序列比较后发现,YN92-4株与日本牛血清分离株(ON-7/B/01株)在S、M片段核苷酸(氨基酸)的同源性最高,分别为97.7%(100%)和95.7%(98%);由于本研究首次开展对巴泰病毒L基因片段核苷酸序列的研究,因此国际基因库尚无可参考的序列信息,本研究比较了我国分离的巴泰病毒与同一血清组的代表病毒Bunyamwera病毒L片段的核苷酸和氨基酸序列同源性,分别为73.5%和81.6%。系统进化分析显示,YN92-4株基因组与其它巴泰病毒分离株在各自分支下形成独立分支。本研究提示我国分离的巴泰病毒YN92-4株未发生基因重配(...     

套式RT-PCR检测猪繁殖和呼吸综合征病毒的研究

参照ATCC VR-2332株及LV株保守区段设计了3条引物,以此建立了检测猪繁殖和呼吸综合征病毒的套式RT-PCR方法。利用其分别对ATCC VR-2332株、LV株及B13株进行套式RT-PCR,结果从3个不同地区分离的毒株中均能特异性的扩增出相应的片段,大小分别约为430bp(预期片段为430bp)、410bp(预期片段为413bp)及410bp(预期片段为413bP),而3个非PRRSV的病毒(猪瘟病毒、细小病毒及伪狂犬病毒)均未扩增出相应的片段。其敏感性可达到10^-2TCI     

Sindbis virus mutations which coordinately affect glycoprotein processing, penetration, and virulence in mice

Rapid penetration of baby hamster kidney cells was used as a selective pressure for the isolation of pathogenesis mutants of the S.A.AR86 strain of Sindbis virus. Unlike most Sindbis virus strains, S.A.AR86 is virulent in adult as well as neonatal mice. Two classes of mutants were defined. One class was attenuated in adult mice inoculated intracerebrally as well as in neonatal mice inoculated either intracerebrally or subcutaneously. Sequence analysis of the glycoprotein genes of the parent virus and three such mutant strains revealed a single point mutation which resulted in an amino acid change at position 1 in the E2 glycoprotein. The change from a serine in S.A.AR86 to an asparagine in the mutants created a new site for N-linked glycosylation which appeared to be utilized. This mutation did not retard release of infectious particles; however, mutant virions contained the E2 precursor protein (PE2) rather than the E2 glycoprotein itself. The mutants also lost the ability to bind two E2-specific monoclonal antibodies, R6 and R13. A second class of mutants was attenuated in neonatal mice upon subcutaneous inoculation but remained virulent in adults and in neonates when inoculated intracerebrally. Sequence analysis of three such strains revealed the substitution of an arginine residue for a serine at position 114 in the E2 glycoprotein. Reactivity with monoclonal antibodies R6 and R13 was reduced, yet members of this mutant class were more susceptible than S.A.AR86 to neutralization by these antibodies.     

一株辛德毕斯病毒的基因组序列测定及分析

目的：对引进的一株辛德毕斯病毒的基因组序列进行测定,阐明其与已报道毒株序列的关系。方法：对辛德毕斯病毒基因组编码区进行分段RT-PCR扩增,对非编码区采用RACE法进行扩增,将扩增产物直接进行测序,应用DNAStar软件将测序结果拼接得到基因组序列,采用MEGA3.1软件对9株辛德毕斯病毒基因组序列进行系统进化发生树的构建。结果与结论：此株辛德毕斯病毒基因组共11663nt,编码3745个氨基酸残基,其中5＇端的2/3基因组编码4种非结构蛋白NSp1、NSp2、NSp3和NSp4,3＇端的1/3基因组编码5种结构蛋白E1、E2、E3、6K和C;结构基因和非结构基因之间有48nt的连接区为非翻译区;病毒基因组5＇末端和3＇末端分别有59、318nt的非编码区;序列同源性分析结果表明,此株病毒与S.A.AR86株的同源性最高,两者核苷酸序列的同源性为99.7%,氨基酸序列的同源性为99.6%,而与本室保存的另一辛德毕斯病毒MEI株的遗传进化关系稍远,系统进化发生树处于不同分支上。