胡萝卜体细胞遗传

引言 自从卡尔逊(Carson)报导了植物从组织培养分离突变体及产生体细胞杂种以后,人们对建立植物体细胞遗传系统方面具有浓厚的兴趣。在过去十年,已经在几个植物种获得了生化突变种,以及种间和属间的体细胞杂种。本章综述了胡萝卜体细胞遗传学的现状,同时强调使之作为对遗传学研究的一个合适的体细胞系统的那些属性。     

内蒙古西部地区土壤放线菌的多样性分析

为明确内蒙古西部地区放线菌的多样性,为未来该地区放线菌资源的开发利用及生态系统的稳定性提供一定的理论基础。本研究从内蒙古西部地区采集土壤样品,提取土壤样品的总DNA,通过巢式PCR扩增放线菌16S rRNA基因片段,利用DGGE (denaturing gradinent gel electrophoresis)技术进行分析,切胶回收,再利用不带GC夹子的引物进行扩增,将PCR产物送往公司测序后对16S rRNA基因序列进行比对,分析内蒙古西部地区放线菌的多样性及其与土壤理化性质之间的相关性。对内蒙古西部地区放线菌多样性分析发现,内蒙古西部地区土壤放线菌的多样性较为丰富,丰富度指数处于10～28之间,其中,棕钙土的丰富度最高,栗褐土的最低;同一地区相同类型土壤中草地的放线菌数量比耕地丰富。放线菌的多样性与有效磷的含量呈显著正相关。经过16S rRNA基因序列比对共得到了7个属的放线菌,包括Saccharopolyspora (糖多孢菌属)、Thermomonospora (高温单孢菌属)、Streptomyces (链霉菌属)、Iamiaceae (酸微菌属)、Corynebacterium (棒杆菌属)、Timonella、Pseudonocardia (假诺卡氏菌属)。通过研究得出内蒙古西部地区的放线菌资源较为丰富,作为应用于抗细菌、抗真菌和抗肿瘤的新型药物中的重要微生物资源,具有进一步研究的价值,继而推动内蒙古西部地区放线菌资源的开发与利用。     

microRNAs和体细胞重编程

体细胞重编程与microRNAs(miRNAs)均为近年来研究的热点问题。到目前为止,能成功诱导体细胞形成多能性干细胞的体细胞重编程方法有核移植(nuclear transfer,NT)和外源因子诱导形成多能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSc)两种,这两种方法让人们看到了体细胞重编程在细胞治疗方面具有诱人的应用前景。miRNAs是真核生物中存在的一类长度为22nt左右起调控作用的内源性非编码RNA,它在转录后水平调节靶基因的表达,是细胞内基因表达的基本调控机制之一。近年的研究结果表明,miRNAs在干细胞干性维持和分化过程中具有重要的调节作用,从miRNAs角度研究体细胞重编程机理将对体细胞重编程的应用具有重要意义。     

宁夏白芨滩自然保护区苦豆子内生放线菌多样性及其分布

【目的】探索宁夏干旱荒漠区苦豆子内生放线菌的多样性及区系组成,为苦豆子内生放线菌的合理开发和利用提供理论依据。【方法】从宁夏白芨滩自然保护区不同植被和土壤类型的6个样区采集健康苦豆子样品30份,采用组织匀浆法从苦豆子植株的根部、茎部、叶部和种子中分离内生放线菌,根据培养性状、菌落、孢子等的形态特征和16S rRNA基因序列分析对分离菌株进行鉴定;根据苦豆子内生放线菌的相对频率、物种多样性指数、丰富度指数和相似性系数分析其区系组成特点。【结果】从30份苦豆子样品中,共分离得到内生放线菌111株,这些菌株分属于链霉菌属(Streptomyces)、拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)、普劳斯氏菌属(Prauserella)、Actinophytocola、微杆菌属(Microbacterium)、束丝放线菌属(Actinosynnema)、嗜热油菌属(Thermoleophilum)、糖霉菌属(Glycomyces)和糖丝菌属(Saccharothrix) 9个属,其中链霉菌属(Streptomyces)和拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)为优势属。苦豆子内生放线菌的分布具有一定的组织特异性,根和种子中的内生放线菌数量高于茎和叶。植被类型中,沙生植被草原(样区Ⅳ)分离的苦豆子内生放线菌物种多样性指数最高,而荒漠草原(样区Ⅴ)最低。荒漠草原(样区Ⅴ)和林地(样区Ⅵ)内生放线菌群落有密切的相似性。【结论】苦豆子体内含有丰富的内生放线菌资源,其内生放线菌具有很高的宿主特异性,而且其分布受生境影响。     

建立放线菌门的证据*

放线菌是细菌域中的一个重要类群,其分类地位一直受到人们的关注。《伯杰氏细菌系统学手册》第二版,把放线菌从厚壁菌门中的一个纲提升为放线菌门。目前的研究发现,在细胞色素C氧化酶1亚基(Cox1)、CTP合成酶以及谷氨酰tRNA合成酶(GluRS) 3个蛋白中存在着放线菌特异的插入或缺失序列,可以将放线菌与其它细菌区分开,为放线菌门的建立提供了新的有力证据。简述了国内外的研究信息,并提出了自己的一些观点,供国内学者参考。     

诱导性多潜能干细胞在分化上具有局限性

<正>诱导性多潜能干细胞(iPSCs)的出现,使得科学家正在实现从病人自身细胞诱导生成各种成体细胞的梦想.然而,来自麻省总医院再生医学中心以及哈佛干细胞研究所的研究表明,iPSCs来源于成体细胞,并具有许多胚胎干细胞(ES)的特性,但它仍有很大局限性:在iPSCs细胞中有一簇重要的基因发生了失活,使得     

盐碱环境放线菌多样性研究

放线菌因产生多种多样的生物活性物质而受到重视。但极端环境放线菌的研究甚少。采用DGGE、纯培养法,重点研究了新疆、青海及埃及的重盐碱环境的放线菌分布情况,种类组成,生物学特性。发现了1个新科,8个新属及30多个新种。从嗜(耐)盐碱放线菌筛选到许多带有PKS基因的菌株。认为极端环境放线菌是生物活性物质的重要来源;改进分离程序,分离未知放线菌,是放线菌多样性研究及开发利用的前提之一;并对极端环境放线菌研究作了论述。     

2株海洋来源产浅蓝霉素A的异壁放线菌的分离和鉴定

利用抗菌及卤虫致死活性模型,从中国南海海底沉积物来源的微生物中筛选到2株放线菌SCSIO WJ01和SCSIO ZJ63,其发酵产物具有较强活性,经16S rRNA基因序列分析这2株放线菌均为异壁放线菌Actinoalloteichus sp.。HPLC-DAD分析显示2株放线菌能产生同一个主要的次级代谢产物,通过正相硅胶柱色谱、反相中压柱色谱、半制备高效液相色谱等手段,从SCSIO WJ01的发酵产物中分离获得了该化合物,运用ESI-MS、1H及13C NMR波谱分析鉴定为浅蓝霉素A(Caerulomycin A)。此外,还从SCSIO WJ01的发酵产物中分离鉴定了浅蓝霉素D。     

自溶高温放线菌的生物学特性及16S,rDNA序列分析研究

从云南各地土样及温泉水样中分离到多株高温放线菌。对其中的自溶高温放线菌的形态,生理生化特性、细胞化学组分、同功酶谱及16S rDNA序列进行了研究,结果表明它们与非自溶放线菌在上述各方面存在着明显差异分别属于高温放线菌属（Thermoactinomyces)和链霉菌属（Streptomyces)。同时发现培养基成分、温度、空气湿度对菌体自溶均有显著影响,特别是水分对链霉菌的自溶起着关键作用。     

放线菌萜类化合物生物合成研究进展

萜类化合物(Terpenoids)是自然界中化学结构最为丰富的一类化合物。近年来,从放线菌中分离到了一系列结构新颖的萜类化合物。通过直接克隆或基因组采掘(Genome mining)的方法,它们的生物合成基因簇被相继分离和鉴定,从而推动了放线菌中萜类化合物生物合成途径及关键酶的分子作用机理的研究。文章主要综述了近5年放线菌萜类化合物生物合成研究进展。     

体细胞克隆猪的研究进展

哺乳动物克隆不仅可以保护濒危动物 ,而且与干细胞工程技术相结合能应用于克隆性治疗 ,是目前生物技术领域研究的热点之一 ,具有重大的科学意义和应用价值。由于体细胞克隆猪在人类器官移植方面具有巨大的应用潜力 ,已成为当今体细胞克隆研究的热点。从 2 0 0 0年开始 ,在不同国家相继诞生了体细胞克隆猪及转基因猪 ,但是其成功效率很低 ( 1 %～ 2 % )。主要综述了影响体细胞克隆猪的几个因素 ,涉及胞质受体、供核细胞、显微操作、激活以及重组胚移植     

大香格里拉土壤放线菌组成分析及生物活性测定

【目的】探究大香格里拉地区的土壤放线菌组成及其抑菌和酶活性,为放线菌新药物先导化合物和高活性酶的筛选提供资源。【方法】从大香格里拉地区不同海拔高度采集220份土样,用4种培养基,分别进行了常温放线菌和低温放线菌的分离。从常温放线菌中选择25株代表菌株进行了初步分类鉴定。采用琼脂扩散法,检测了其对4株细菌和7株农作物致病真菌的抑菌活性;利用特异性引物扩增法,筛选了其聚酮合酶(PKSⅠ、PKSⅡ)基因、非核糖体多肽合成酶(NRPS)基因和多烯类化合物合成酶(CYP)基因。同时,检测了低温菌的多种酶活性。【结果】25株常温代表菌的系统发育分析显示它们分属于放线菌目的6个亚目、12个科、15个属。其中14株菌的NRPS及11株的CYP基因筛选呈阳性。低温条件下分离到的111株放线菌,88%属于耐冷菌,12%是嗜冷菌,它们中的大部分能利用明胶、纤维素,甲壳素等。【结论】研究结果显示,大香格里拉森林土壤蕴涵着种类和活性丰富的放线菌,为放线菌资源的开发利用和保护提供了新依据。     

川滇四区森林土壤纯培养放线菌多样性及生物活性

【目的】为了从放线菌发现新的药物先导化合物,研究了川滇4个地区的放线菌多样性及其生物活性。【方法】采集250份土样,用4种培养基分离放线菌;从中选择98株代表菌进行了初步分类鉴定;采用琼脂扩散法,检测了169株放线菌对4种细菌和7种真菌的抑菌活性;利用特异性引物扩增法,测定了它们产生的聚酮合酶(PKSI、PKSⅡ)基因、非核糖体多肽合成酶(NRPS)基因和多烯类化合物合成酶(CYP)基因。【结果】黄荆老林的放线菌有13个属,峨眉山、青城山仅5个属,九寨沟9个属,西双版纳达20个属;不同地区的放线菌具有抗菌活性的菌株平均约占10%;有27%-36%的菌株产生PKSI、II、NRPS、CPY化合物合成基因。【结论】在采集样品的地区中,人类干扰越少,放线菌的多样性越高。分离放线菌时,使用"极端"条件,虽然分离到的放线菌数量可能不多,但获得未知菌的比例较大。添加抑制剂可减少革兰氏阴性细菌和真菌,有利于分离放线菌。     

类诺卡氏属放线菌的研究进展

Prauser H.最初于1976年从土壤中分离到17株诺卡氏形态放线菌,综合形态、生理生化特性和部分化学分类特征的研究结果,提议建立了一个新属——类诺卡氏属(Nocardioides),并以新种白色类诺卡氏菌(N.albus)为典型种。之后,随着分离、纯培养和分类方法的发展,越来越多的新成员从各种不同环境中分离得到。尽管这些菌来源广泛,形态和生理生化等特征各异,但他们拥有共同的属的特征。过去的50年中,随着放线菌研究的发展,该属中部分成员历经了分类地位的变迁和修订。到目前为止,该属共收纳了56个有效描述种。类诺卡氏属(Nocardioides)放线菌在农业、工业、化工业等方面也曾有应用研究报道。本文就类诺卡氏属放线菌的建立依据,属的特征,属内种的分布和变更以及它们在工农业上的应用研究前景及进展进行了综述。     

川楝内生放线菌的分离及多样性研究

【目的】分离四川省各个地区川楝内生放线菌并研究其物种多样性。【方法】应用7种选择性分离培养基分离样品根、茎、叶、树皮和果实中的内生放线菌,采用16SrRNA基因RFLP分析代表菌株多样性。【结果】研究共获得403株内生放线菌。不同地点、不同植株部位、不同培养基分离得到的内生放线菌数目均有差异。广元采集的样品分离得到的数目最多,为86株;最少的是绵阳,仅有12株。从植物表皮中分离到148株放线菌,占获得菌株总数的36.7%;而从果中分离到31株,仅占获得菌株总数的7.6%;虽然从根部分离到的数量也很少,但是其出菌率却是最高的。5号和3号培养基的分离效果最为理想。16S rRNA基因RFLP分析结果显示所有供试菌株在68%的相似性上聚在一起,在84%的相似水平上分成了10个遗传类型。代表菌株的16SrRNA基因序列测定及系统发育分析结果表明:分离得到的放线菌包括4个属,分别是链霉菌属(Streptomyces)、北里孢菌属(Kitasatospora)、节杆菌属(Arthrobacter)、克里布所菌属(Kribbella)。其中,链霉菌是优势类群,占代表菌株数目的比例高达91%,而稀有放线菌的比例只有9%。【结论】研究发现的川楝内生放线菌主要属于链霉菌属(Streptomyces)、北里孢菌属(Kitasatospora)、节杆菌属(Arthrobacter)、克里布所菌属(Kribbella)。     

具有多重酶活性的澳大利亚厚皮海绵共附生放线菌的研究

从我国南海澳大利亚厚皮海绵分离得到23株放线菌,并对其蛋白酶、琼胶酶、纤维素酶、几丁质酶和酯酶活性进行了筛选,同时基于16S rDNA序列信息对放线菌进行了分子鉴定。研究发现23株放线菌全部具有较强的生物酶活性,其中21株放线菌具有至少3种以上的酶活性,17株具有除酯酶活性以外的4种酶活性。通过序列比对与系统发育分析证实12株放线菌属于链霉菌属(Streptomyces)。这些分离自海绵具有多重生物酶活性的放线菌具有较大的潜在应用价值。     

对《放线菌分类基础》一书中某些观点的看法

《放线菌分类基础》(阮继生编著,科学出版社,1977年)一书出版后,经各地放线菌分类工作者以及各大专院校有关专业师生阅读后,发现许多问题,笔者对该书所存在的主要问题提出不同的看法,供读者参考。(一) 放线菌分类观点的问题1.关于放线菌的亲缘关系:作者在该书16、17和79页中都论述了放线菌的亲缘关系,认为游动放线菌     

松杉类植物体细胞胚发育机理的研究进展

植物体细胞胚胎发生不仅可作为其繁育的重要手段,而且也是研究胚胎发育过程的一种重要模式系统.体细胞胚在形态和生理上的成熟,直接影响到植株的萌发和再生频率.本文综述了近年来国内外有关裸子植物中几种松杉类植物体细胞胚发育过程的研究报道,其中主要涉及培养基成分和脱落酸(ABA)对体细胞胚发育的影响,以及体细胞胚发育在细胞学、细胞程序性死亡、相关基因和蛋白质组学等方面的研究进展,并进一步讨论了松杉类植物体细胞胚的发育机理,以及体细胞胚在遗传转化系统中的作用.     

罗布泊盐湖可培养放线菌多样性及PKS Ⅱ功能基因筛选

目的:挖掘新疆罗布泊盐湖可培养放线菌的资源和探索该环境放线菌产生Ⅱ型聚酮合成酶(PKS)基因的潜能。方法:从新疆罗布泊盐湖采集到10份样品,采用不同盐浓度的9种选择性培养基分离放线菌,并通过PCR技术扩增其16S r DNA序列、聚酮合成酶(PKS)基因分子筛选,测序后进行系统发育分析和BLAST比较研究。结果:试验结果共得42株放线菌,包括6个属,链霉菌属(Streptomyces)和拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)的类群最多,糖霉菌属(Glycomyces)、放线多孢菌属(Actinopolyspora)、微球菌(Micrococcus)和栖白蚁菌属(Isoptericola)的菌株相对较少。研究获得新的放线菌分类单元,其16S r DNA基因序列与已知菌株的序列相似性低于97%。42株放线菌中共有29株产生PKSⅡ基因,主要是链霉菌属和拟诺卡氏菌属。结论:研究结果表明罗布泊盐湖放线菌具有丰富的资源多样性和较强合成抗生素的潜在能力。