挖掘数据

不管数据来源何处,像贝叶斯建模之类的统计数据挖掘方法都能够有效的从中提取出药物安全性信息。     

高原鼢鼠挖掘取食活动的能量代价及其最佳挖掘取食行为

高原鼢鼠(Myospalax baileyi)是青藏高原典型的地下鼠,它主要挖掘取食杂类草之地下根茎,在挖掘过程中形成取食洞道。本文根据此特点,建立了挖掘取食过程中能量代价(E_(?))与取食道结构参数(土丘间距S、侧道长L、取食道半径b及洞道深度D)之间以及取食获能E_(fg)与S和b之间的两个函数关系。分别以挖掘效率极大和取食效率极大为优化目标,导出同样的结果,即相同的最佳土丘间距S_(opt)。通过实验观测,计算出在矮嵩草(Kobresiahumilis)草甸生境条件下,最佳土丘间距S_(opt)=127.4厘米,与野外实测土丘间距(126.30±47.85厘米)无显著差异(t=0.312,P>0.50),表明高原鼢鼠的挖掘及取食行为符合最佳化原则。     

怎样挖掘和保护化石

化石是岩石或沙土中保存下来的古代生物的遗体或遗迹。动物骨骼在地层中被地下水的矿物质填充替换,如果没受到地壳运动的挤压、断裂等外力影响,其形状可保持不变,而骨质却被石化,形成了化石。一、化石的意义这些埋藏在地层中的化石,有着重大的科学价值。生物从低级到高级、从简单到复杂的演变,以及古猿演变成人,化石就是重要的证据。从地球形成以来,地壳活动,海陆变迁,从来没有停止过。今日的世界屋脊在几千万年前还是汪洋大海,因为在海拔五、六千公尺的高山上,找到了海中生活的螺蚌类、鱼龙等化石;黄河以北广大地区曾发现过很多大象的化石,而今日我国只有云南西双版纳才有大象生活着,所以化石是研究古地理、古气候的有     

挖掘深海新酶基因资源

深海热液口,是幽深寒冷海床上的一口口巨型"压力锅"。它们温度高(200~400摄氏度),压力大(水深1000~3000米),"锅"里的水为富含氢气、甲烷、硫化氢及各种金属离子的酸溶液(pH为2~3)。理论上,如果把地球上常见的动物扔到这些压力锅里,恐怕不一会就成一锅酥烂的肉汤了,尽管这锅肉汤的味道可能不怎么值得期待。     

微生物农药资源挖掘技术研究进展

微生物农药因其环境相容性受到了广泛重视。作为微生物农药研究开发的最早的环节,微生物农药资源的挖掘显得尤为重要。本文从基于生物活性、农药活性化合物及功能基因三个方面对微生物农药资源的快速挖掘技术进行了综述。针对不同的微生物农药产品开发目标,将以上技术进行整合,可实现微生物农药资源的快速挖掘,为微生物农药产业的发展提供丰富的资源,为微生物农药产业的发展提供支撑。     

DNA序列频繁近似模式挖掘

本文在引入近似度等概念的基础上,构造了频繁近似模式,并证明了相关性质,同时提出了相应的频繁近似模式的挖掘算法(SFAP)算法。实验结果表明该算法能有效挖掘DNA序列中的频繁近似模式,DNA序列中频繁近似模式的挖掘为生物学的相关实验提供基础。     

耐药结核分枝杆菌基因组信息挖掘

<正>由于结核分枝杆菌的耐药性问题,使结核病这个古老的传染病死灰复燃,并成为全球性的严重公关问题。从1998年首个结核分枝杆菌(H37Rv)全基因组完成图的获得[1],到近年来采用新一代测序技术对多个菌株进行高通量的基因组测序与分析,对结核分枝杆菌进化及耐药机制的认识不断深入。关于结核分枝杆菌菌株的基因组比较分析有多篇报道,包括对中国12个省来源的161株结核分枝杆菌     

高原鼢鼠挖掘活动的观察

本文通过自制高原鼢鼠挖掘行为观察箱,以直接观察法和摄录像系统观察了在模拟不同土壤坚实度条件下,高原鼢鼠的挖掘行为、掘土速度、掘土持续时间以及在每一掘土回合内的掘土量。结果表明,高原鼢鼠的掘洞活动主要由掘土、扒土、踢土、推土、以及拱土组成;掘土速度和掘土持续时间与土壤坚实度有关;在相同土壤条件下,虽然雄、雌鼢鼠的掘土速度相似,但雄性鼢鼠在每回合内的掘土量明显地高与雌鼠。     

挖掘隐性实验 培养科学思维

实验教学是促进学生生物学学科素养提升的重要支撑,在日常教学过程中应当注重实验的开设。以浙科版高中《生物》为例,通过自设演示实验、自制实验装置、将实验生活化、整合教材实验等多种方式介绍4则隐性实验,以培养学生的科学思维。     

挖掘多方资源搞好生物教学

本文从六个方面论述了深化课程改革、提高教学效益的方式。     

乳腺癌基因芯片实验数据分析与挖掘

目的 对公共数据库上下载得到的乳腺癌基因芯片试验结果进行数据分析,找出在正常组织与癌组织中呈现差异表达的基因,并寻找差异表达基因的相关基因.方法 综合运用显著性分析（SAM）、顶级评分基因对（TSP）、关联规则挖掘等方法,对数据进行处理.结果 筛选出若干呈现差异表达的基因,并且寻找了其中一部分基因的可能高度相关的基因.结论 筛选出的基因及其相关基因可用于为进一步的研究提供候选基因.     

高原Fen挖掘活动的观察

本文通过自制高原Ｆｅｎ鼠挖掘行为观察箱,以直接观察法和摄录像系统观察在模拟不同土壤坚实度条件下,高原Ｆｅｎ鼠的挖掘行为、掘土速度,掘土持续时间以及在每一掘土回合内的掘土量,结果表明,高原Ｆｅｎ鼠的掘洞活动主要由掘土、扒土、踢土、推土,以拱土组成;掘土速度和掘土持续时间与土壤坚实度有关;在相同土壤条件下,虽然雄,雌Ｆｅｎ鼠的掘土速度相似,但雄性Ｆｅｎ鼠在每回合内的掘土量明显地高于雌鼠。     

挖掘概念卡通蕴含的教学思想

概念卡通把教学主题寓于卡通画中,通过卡通人物的对话让科学概念与学生的前概念产生认知冲突,从而激发学生思考、讨论和探究。概念卡通所蕴含的教学思想主要有有意义学习理论、支架式教学理论、PBL教学模式、概念转变模式、动态生成式教学。     

三种啮齿类动物前肢挖掘效率分析

以甘肃鼢鼠(Myospalax cansus)、棕色田鼠(Lasiopodomys mandarinus)和小鼠(Mus musculus)为对象,对其尺骨、桡骨和肱三头肌结构进行了比较,并通过力学模型,对这三种生活类型鼠类前肢的挖掘效率进行分析。结果显示,甘肃鼢鼠肘关节位置大幅度前移,尺骨鹰嘴特化突出,形成更加省力的骨学杠杆基础,其中甘肃鼢鼠的鹰嘴尺骨比例达0.40;棕色田鼠和小鼠的鹰嘴尺骨比例分别约为0.19和0.18。此外,甘肃鼢鼠提供挖掘动力的肱三头肌近体端长头覆盖整个肩胛骨下缘,外侧头和内侧头覆盖桡神经沟到肱骨肘关节髁附近区域,远体端扁腱附着于尺骨鹰嘴,整块肌肉非常发达,棕色田鼠和小鼠均无此特化现象。说明甘肃鼢鼠前肢结构更加适应地下掘土生活,其挖掘效率远大于棕色田鼠和小鼠。     

转录组分析挖掘油菜耐旱基因

本研究选用耐旱性好的甘蓝型油菜品系YAU200908为材料,通过对干旱胁迫下根和叶的转录组进行分析,发现干旱胁迫下根中和叶中差异表达Unigene分别为9 419个和13 230个,其中上调表达的略多于下调表达的。并对差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)进行COG、GO等功能分类和生物信息学分析,挖掘出20个unigene参与了YAU200908抗旱反应,它们分别是转录因子4个、渗透调节4个、蒸腾作用调节4个、活性氧清除2个及ABA水平调控6个。本研究对油菜耐旱分子机制的解析及耐旱品种选育提供了一定的依据。     

蛋白质相互作用信息的文本挖掘研究进展

蛋白质相互作用是生命活动中一种极其重要的生物分子关系, 对此领域的研究不仅具有理论意义, 还具有较强的应用价值. 近年来, 随着研究的深入, 各种蛋白质相互作用的生物医学文献激增, 挖掘其中的蛋白质相互作用关系成为人们面临的一大挑战. 当前, 已提出了多种文本挖掘方法, 对分散于生物医学文献中的蛋白质相互作用信息进行结构化或半结构化处理. 对这些工作进行分析, 总结出基于生物文本挖掘蛋白质相互作用信息的一般流程, 从蛋白质命名实体的识别、蛋白质相互作用关系的提取和蛋白质相互作用注释信息的提取3个子任务进行阐述, 同时介绍了生物文本挖掘领域的评测会议和一些挖掘蛋白质相互作用相关信息的工具. 最后, 对该领域存在的一些重要问题进行分析, 并预测了未来可能的发展方向, 以期对该领域相关研究提供一定的参考.     

真菌次生代谢产物挖掘策略研究进展

真菌是最具生物多样性的类群之一,也是一系列小分子活性化合物的重要来源.近年来,发现新结构、新活性的次生代谢产物超过50%来源于真菌.因此深度挖掘真菌中天然活性化合物,既是研究热点,也将为药物研发提供必要的基础,并具有重要的科学意义.基于基因组测序技术及信息生物学的发展,结合传统方法,深入了解近几年挖掘真菌次生代谢产物的策略,了解相关真菌次生代谢的生物合成及调控机制,可以为新活性、新骨架化合物的发现以及隐性次级代谢物的激活提供理论基础.最终可以精准研究或多种策略结合,对目标菌株开展深入系统地研究.     

设施化专用香菇种质资源挖掘

以香菇L808菌株基因组序列为参照,开发了300份插入/缺失(InDel)标记。通过5个菌株的初筛,选出均匀分布于基因组的82份多态标记对42份香菇种质资源进行遗传背景分析。同时在设施化栽培条件下考察了种质资源的生育期、菌棒转色、菌棒硬度、现蕾期和产量等表型。结果表明：供试香菇种质资源的遗传多样性丰富,栽培菌株与野生菌株的遗传距离较远,遗传相似性系数平均值为0.51。群体结构分析将种质资源分为6个亚群,与基于遗传距离的系统聚类结果较为一致。亚群间菌株具有较远的亲缘关系,遗传分化指数平均值为0.290,适合用于杂交育种。表型结果显示,设施化栽培条件下的种质资源农艺性状分化程度高,亚群间菌株的生育期、现蕾期和产量均有显著差异。种质资源多样性分析结果为香菇杂交育种工作奠定了基础。     

早产相关基因的挖掘与特征分析

早产(preterm birth, PTB)指胎儿在完成37周妊娠前出生,是新生儿死亡的主要原因,与多种新生儿疾病和成年发生的慢性病相关。据双生子和家系研究报道,遗传因素约占早产风险的15%～35%,然而早产的分子流行病学机制目前尚不明确。本研究通过挖掘文献数据库和疾病数据库中与早产相关的文献,并结合两重过滤的方法,筛选出355个与早产相关基因。富集分析发现早产相关基因主要分子功能包括:受体配体活性、细胞因子受体结合、细胞因子活性和生长因子活性等;主要通路包括KEGG中富集的糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、Chagas病和IL-17信号通路和TNF信号通路等,以及Reactome中富集的多个与免疫相关的通路。早产相关基因与基因组其他基因相比较,转录本数量有差异(α=0.1, P=0.06),但在GC含量和基因长度上没有明显差异。本研究结果提示早产基因大多集中在免疫相关通路,具备与免疫过程密切相关的分子功能,为早产的遗传机制研究提供了重要资源。     

努力挖掘生物教学中的美育因素

爱美是人的本性.在中学生物教学中,抓住学生对美的追求的心理倾向,并努力挖掘生物学知识中的美育因素,通过有目的、有组织的审美教育,使学生在对生机美的感受中,在精神愉悦的心理状态下,强化兴趣,深化知识,发展智能,陶冶情操,这是生物教学中的较高境界.