蛋白质二级结构预测方法的评价

目前评价蛋白质二级结构预测方法主要考虑预测准确率,并没有充分考虑方法自身参数对方法的影响。本文提出一种新型评价方法,将内在评价与外在评价相结合评价预测方法的优劣。以基于混合并行遗传算法的蛋白质二级结构预测方法为例,通过内在评价,合理选取内在参数——切片长度和组内类别数,有效提高预测准确率,同时,通过外在评价,与其他基于随机算法的蛋白质二级结构预测算法比较和与CASP所提供的结论比较,说明了方法的有效性与正确性,以此验证内在评价和外在评价的客观性、公正性和全面性。     

美国科学家培育成功世界上第一只转基因猴

美国俄勒冈保健科学大学的科学家宣布 :他们培育出一只体内含有绿色荧光蛋白的猴子 ,这是人类第一次培育成功转基因灵长类动物。科学家预测 ,这一成果将加快人类对癌症、老年痴呆症等疾病的研究工作。这只转基因猴取名“安迪” ,从外表看来 ,与其他猴子没有什么两样 ,所不同的是“安迪”体内含有一种从海蜇体内分离出来的“绿色荧光蛋白基因”。因为含有这种基因的细胞会呈现绿色 ,所以这种“绿色荧光蛋白基因”被用来作标记基因 ,只需用一种特殊的显微镜就可以观察到“绿色荧光蛋白”的存在。“安迪”的培育大体如下 :首先用一种携带“绿色…     

基因频率题解法

基因频率的计算在现行教材生物进化中既是重点又是难点,并在遗传学中经常用到,“用数学方法讨论基因频率的变化”已写进新的《生物课程标准》中。可以预测,此类题目将会越来越多,难度也会越来越大。为了适应生命科学发展和教育教学改革的形势, 笔者总结和归纳了基因频率的几种主要题型的解题思路与计算方法,现汇集如下,供广大读者参考。     

基因突变及其表达

基因突变亦称为“点突变”,因为从细胞水平来看,基因是染色体上的一“点”;从分子水平看,基因突变是     

复杂疾病基因鉴定的计算生物学方法

过去20多年复杂疾病易感基因鉴定的主要方法是连锁分析和关联研究。因为连锁分析确定的数量性状位点通常很宽, 加之对区域内大部分基因的功能以及基因功能和疾病之间联系的认识十分有限, 所以从数量性状位点到基因的识别是一个挑战。近年来发展了一些利用公共数据库的信息预测疾病易感基因的计算生物学方法。文章简要介绍了DGP、GeneSeeker、Prioritizer、PROSPECTR and SUSPECTS及Endeavor 5种计算生物学方法的基本原理, 以2型糖尿病/肥胖和骨质疏松症易感基因的预测为例说明它们的应用方法, 并讨论了这些方法的局限及应用前景。     

浅论资本市场与生物、医药产业发展的相互作用

文章通过用中国传统的五行来比喻对产业有重大影响的“政产学研资”五元素（以下简称为“五元素分析”）,重点探讨了生物与医药产业发展（以下合称为“两大产业”）与资本市场结合的内外部条件及其相互影响。另外,针对瑞士罗氏公司（Roche）收购美国基因泰克公司（Genentech）的实际案例,分析了上述两大产业通过资本运作合作的模式,并预测了未来趋势。     

生物节律和生物钟

从众多的生物节律现象可看出,动物、植物的生理机能和生活习性好象受体内某种内在的时钟控制,这种神秘的时钟称为“生物钟”,即生物感知时间的能力。而生物节律实际上是由生物钟控制的,是生物钟的外在表现。生物节律和生物钟的研究经历了3个主要阶段:50年代及以前的生物节律现象的描述阶段;60年代的模型建造阶段;70年代以来利用生物化学和分子     

RNAi技术研究进展

近年来的研究表明,一些小的双链RNA可以高效、特异地阻断体内特定基因表达,促使mRNA降解,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型,称为RNA干扰(RNAinterference,RNAi,也译作RNA干预或者干涉)。研究表明它也是体内抵御外在感染的一种重要保护机制。由于可以作为一种简单、有效的代替基因敲除的遗传工具,可以毫不夸张地说,RNAi正在功能基因组学领域掀起一场真正的革命,并将彻底改变这个领域的研究步伐,为此被SCIENCE评为2002年最重要的科研成果之一。     

高级中学开设“达尔文主义基础”新课程的意义

一、新中国的中学课程为什么要撤消“高中生物学”这个旧的课程呢? 我们知道,现在世界上有两种生物学:旧的生物学和新的生物学。旧的生物学就是反动的孟德尔、魏斯曼、摩尔根主义的生物学。它主张生物体是由“种质”和“体质”组成的。所谓“种质”是一种永生不灭的物质,不受体质和外界环境的影响。所谓“种质”根据旧的生物学说来,就是生殖细胞里的染色体。旧的生物学认为染色体是唯一的遗传物质,包办一切的遗传工作。旧的生物学更进一步假定所谓“基因”是染色体中的主要物质,一切遗传工作都依靠基因。基因是什么呢?基因是孟德尔、魏斯曼、摩尔根主义者所假设出来的物质微粒,以为它是一有生     

人的性染色质及应用

染色质是细胞间期核内能被碱性染料染色的物质,它和染色体是同一物质在细胞周期不同阶段的存在形式。染色质主要有两种类型：在细胞分裂期凝缩而在间期松散（成为弥散状）的称为常染色质;在所有时期一直凝缩着的称为异染色质。实际上异染色质又可分为两类,一类是在各种细胞中都处于凝缩状态,最晚进行复制的异染色质,这类异染色质不含有结构基因,没有什么“功能”,称之结构异染色质;另一类则是在有些细胞或在一定的发育时期和生理条件下才表现为凝缩状态的异染色质,这类异染色质虽含有结构基因,但从生理上讲绝大多数基因是失活的,…