拟青霉属虫生真菌核型的脉冲电泳分析

利用钳位均匀电场脉冲电泳系统,从电泳的时间、角度、电压、转换时间间隔等方面优化电泳参数,确定了适宜拟青霉属内4种虫生真菌染色体DNA电泳的最佳条件。根据电泳及软件分析结果,估算出斜链拟青霉和环链拟青霉的染色体数目和染色体组型大小,即核型(karyotype)特征。通过进行拟青霉属内4种7株虫生真菌染色体DNA核型相关的比较和分析,表明拟青霉菌种间染色体数目差异较小,核型差异较大;相同菌种不同菌株间的染色体数、核型大小并不完全相同,存在不同程度的差异;且菌株间核型大小差异程度明显小于菌种间的差异程度。     

酿酒酵母染色体DNA样品制备和CHEF分析

等高锁状均匀电场（contolllsclampedhomogeneouselectncfield,CHED电泳技术与分子杂交、酵母人工染色体（yeastartificialchromosome,YAC）等分子生物学技术的有机结合,推动了真菌电泳核型、染色体作图和染色体DNA长度多型性（chromosomalDNAlellgthpolymorphism,CLP...     

酿酒酵母A364a第Ⅴ号染色体基因库的构建及ARS的克隆

利用脉冲梯度电泳(PFGE)分离酿酒酵母A364aV号染色体DNA,克隆在酵母的整合型载体YIp5中,得到染色体专一的基因库。从该基因库克隆的16类ARS,接近估计的酵母Ⅴ号染色体复制子数目,基本覆盖Ⅴ号染色体。同源性分析发现酵母Ⅴ号染色体的绝大部分ARS之间不具同源性或存在极低的同源性。     

德巴利汉逊酵母的两个变种及其相关种的脉冲电泳核型比较分析

摘要:用CHEF(钳位均匀电场)脉冲电泳系统分析了德巴利汉逊酵母的两个变种及两个相关种的脉冲电泳核型。对每个分类群的染色体条数,染色体DNA的分子量大小范围及整个基因组大小作出了估算,结果如下:Debaryomyces hansenii(Zopf) Lodder et Kreger-van Rij var. hansenii具有6-7条染色体,分子量范围为1.2-2.6(个别3.5)Mb,整个基因组大小为I 0.6-14.9Mb;D. hansenii var. fabryi (Ota) Nakase et Suzuki具有7条染色体,分子量范围为0.7-2.4M b,整个基因组大小为12.0-12.7Mb;D. nepalensis Goto et Sugiyama具有6-8条染色体,分子量范围为(个别0.2)1.1-2.7Mb,整个基因组大小为10.6-11.0Mb;Candida saitoana Nakase et Suzuki具有10-11条染色体,分子量范围为0.6-3.6Mb,整个基因组大小为18.1-18.9Mb.本研究表明C. saitoana与上述德巴利酵母属的三个分类群在脉冲电泳核型上具有明显差异,而后三者之间在染色体DNA带型上却没有发现有价值的区别之处.     

用垂直凝胶脉冲电泳分离染色体DNA

脉冲电场凝胶电泳(PFGE)是近几年发展起来的一种分离高分子DNA片段(50—10000kb)的有效方法。包括正交场,六边形场,反向场和垂直胶脉冲电泳。本文改进了垂直胶脉冲电场(TAFE)的条件,使酵母DCo4染色体电泳核型从11条带提高到14条。利用TAFE鉴定了蛋白酶消化法和TLS法制备的人基因A,其分子长度主要分布在200—450kb。     

基因库构建

922472 从人21染色体构建并鉴定酵母人工染色体部分文库[英]/Bellis,M.…∥DNA Cell Biol.-1991,10(4).-301～310[译自DBA,1992,11(1),92-00024] 构建酵母人工染色体(YAC)的一般方法是:琼脂糖制备DNA、EcoRI部分酶切、脉冲电场凝胶电泳(PFGE)对片段大小的筛选、反向电场电洗脱(field-inversion electroelution)、连接、用PFGE选择大小并消除未连接载体、洗脱、转化酿酒酵母、铺板于ura~-、trp~-培养基上、复印到尼尤膜上、筛选人源克隆。以体细胞杂交系WA-17(人源部分只有21染色体)在质粒pYAC4中     

脉冲电泳用于确定念珠菌染色体数目和大小的研究

念珠菌(Candida),特别是白念珠菌是临床上最常见的机会致病真菌。欲了解它们的生物学本质及致病的分子机制,首先应清楚其基因组的基本结构。用脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)技术分离了8种念珠菌共187株的染色体DNA,获得各种菌染色体数目和大小的数据。这些数据为深入研究致病酵母的分子生物学特征打下基础,同时也可作为种间基因型分类的可靠依据。     

小麦蓝矮植原体染色体DNA的分离

[目的]分离小麦蓝矮(WBD)植原体染色体DNA,并建立WBD植原体染色体分离纯化体系.[方法]采用差速离心和脉冲电泳(PFGE)方法富集纯化WBD植原体染色体DNA,并通过PCR和Southern blot进行检测验证,实时荧光定量PCR方法对分离纯化效果进行定量检测.[结果]脉冲电泳凝胶中出现一条大小约为650 kb的条带,经PCR检测和Southern blot分析表明该条带为WBD植原体的染色体DNA.实时荧光定量PCR检测结果表明采用差速离心与脉冲电泳结合的方法可以将WBD植原体基因组的相对拷贝数提高436.5倍.[结论]采用差速离心与脉冲电泳法结合可以有效地从感染WBD长春花中分离到纯的WBD植原体染色体DNA,WBD植原体染色体DNA大小约为650 kb.     

四种假丝酵母与其有性型的分子核型比较

用脉冲电泳对四种假丝酵母及各自的有性型,包括Candida guilliermondii-pichia guilliermondii,Candida krusei-Issatchenkia orientalis,Candida naganishii-Debaryomyces nepalensis和Candida valida-Picha membranaefaciens,进行了分子核型比较分析,发现每对无性型－有性型酵母菌均具有相同或相似的染色体DNA分子带型,而各对之间却具有显著差异,显示了脉冲电泳核型分析在寻找及确证酵母菌无性型－无性型关联中的应用价值。     

四种假丝酵母与其有性型的分子核型比较*

用脉冲电泳对四种假丝酵母及各自的有性型,包括Candida guilliermondii—Pichia guilliermondii, Candida krusei—Issatchenkia orientalis, Candida naganishii—Debaryomyces nepalensis和Candida valida—Pichia membranaefaciens,进行了分子核型比较分析, 发现每对无性型-有性型酵母菌均具有相同或相似的染色体DNA分子带型, 而各对之间却具有显著差异,显示了脉冲电泳核型分析在寻找及确证酵母菌无性型-无性型关联中的应用价值。