欧洲分子生物学组织（EMBO）课程通知

欧洲分子生物学(European Molecular Biology Organization, EMBO)于2004年9月13~26日在中国武汉举办关于蛋白质组学和人类疾病的课程。合办单位有中国科学院武汉病毒研究所和华中科技大学同济医学院。课程包括理论部分(第一周)和实验室操作部分(第二周)。理论部分包括:人类重要病毒性疾病,蛋白质网络和蛋白质功能研究。实验部分包括蛋白质组学技术,显微观察与操作以及DNA和蛋白质芯片。学习班理论课程公开,实验操作课程仅限20名学员。详细信息请参阅网站:http://hennig-online.net/ wolfgang/EMBOcourseWuhan.html和http://www-db.e…     

生物信息学数据库调查分析及其利用研究

从生物信息学数据库利用的角度调查分析生物信息学数据库的现状,为我国科研人员利用网上生物信息学数据库以及生物信息中心的开发提供科学依据和参考价值。研究采用网上调查的方法,对法国生物信息中心Infobiogen建立维护的生物信息学数据库目录DBcat中收录的511个数据库进行调查统计,分析其类型分布、国家分布、更新频率和获取方式;在此基础上。进一步利用欧洲分子生物学信息网(EMBnet)中30个成员国节点对生物信息学数据库利用现状进行统计分析。     

科学出版社生命科学编辑部新书推介

精编分子生物学实验指南(第四版)(译) Frederick Ausubel 等著马学军、舒跃龙、颜子颖、王海林等译2005年1月出版,ISBN 7-03-014725-1/Q.1532,定价:130元被誉为分子生物学“红宝书”的《精编分子生物学实验指南》(Short Protocols in Molecular Biology) 是知名度很高、不断更新的《最新分子生物学实验方法汇编》(Current Protocols in Molecular Biology) 系列的精简版本,其囊括了《汇编》中所有基本方法及其…     

分子生物学西文期刊介绍

为帮助读者了解国际有关分子生物学研究方面的学术期刊,笔者以国际学术出版社编辑出版的国际性期刊《分子生物学杂志》(Journal of Molecular Biology)1988年最近第203卷为例,对该卷四期共100篇论文的计3,563篇引用文献进行统计分析,其中引用期刊244种共3,181次,图书239种共382次。平均每篇论文的引文有36篇,其中有31篇来自期刊。截取被引用     

分子生物学的发展

分子生物学(Molecular Biology)是一门现代生物学,一门带动整个生命科学的前沿学科,是生物化学与遗传学、微生物学、细胞学、生物物理学等学科相结合的基础上发展起来的崭新学科。“分子生物学”一词最早于1945年William Astbury首先在Harvey Lecture上应用的,由于它能从分子水平了解各种生命现象的根本原因,一开始就将研究对象主要集中于生物大分子——核酸(DNA和RNA)的研究,并已经成为现代生命科学的“共同语言”。     

科学出版社生命科学编辑部新书推介

生物信息学方法指南 S.米塞诺,S.A.克拉维茨 著 欧阳红生 等译 2005年3月出版 7-03-014465-1／Q 1498 定价：58．00 计算机在管理生物学日益增长的海量数据方面起到了不可估量的作用,并推进了现代生物学的快速发展。本书详细介绍了一些重要生物学软件和数据库的使用,同时提供了一些实用的技巧和最新研究进展。全书分为五部分,包括序列分析软件包、分子生物学软件、网络信息资源、计算机和分子生物学的关系、生物信息学教学与最新文献跟踪。     

信息交流

《中国生物化学与分子生物学报》第5届编辑委员会名单The Fifth Editorial Board of Chinese Journal of Biochemistryand Molecular Biology顾问(Advisors)郑集ZHENGJi张昌颖ZHANGChang-Ying邹承鲁ZOUCheng-Lu(Chen-lu TSOU)主编(Editor-in-Chief)贾弘JIA Hong-Ti副主编(Ass     

分子生物学新书简介

(一)《分子和亚细胞生物进展》(Progress in Molecular and Sabcellular Biology)丛书于1969年出版第一本书,1988年出版了第10本,从第1本至第10本均有馆藏,是一套信息量比较齐全的分子生物学研究丛书。该书作者是P. Jeantear, Y. Kuchino W. E. G. Mlter和P. L. Paine。由Springer—Verlag出版     

EMBOSS软件包序列分析程序应用实例

本文介绍欧洲分子生物学开放软件包EMBOSS序列分析程序应用实例。第1节简单介绍EMBOSS软件包的概况和基本用法。第2节介绍格式转换、序列提取、序列变换和序列显示等常用序列处理程序。第3节介绍序列比对程序,包括双序列比对、多序列比对和点阵图程序。第4节介绍常用核酸序列分析程序,可用于核苷酸组分统计、开放读码框分析、CpG岛识别、密码子使用统计和重复序列寻找等。第5节介绍常用蛋白质序列分析程序,包括氨基酸组分统计、序列特征位点识别、二级结构分析等。文中结合教学实例,选择部分常用程序,给出具体运行方式,并扼要说明分析结果的生物学意义。文末对程序运行过程中需要注意的地方加以讨论,并用表格列出部分常用程序的名称和用途,以便读者查阅。     

负笈英伦剑桥分子生物学实验室

改革开放以来，国家派出了大量留学生到国外学习。近年来，自费出国读研究生和大学的年轻人更是与日俱增。现在留学已经是很平常的事。不过我下面要说的是20世纪60年代中期我在英国剑桥医学研究委员会分子生物学实验室（Medical Research Council Laboratory of Molecular Biology，简称MRCLMB）进修的一段不寻常经历，因为那是一个比较特殊的年代，那个实验室又是举世闻名、独一无二的。     

生物信息学及其在环境微生物研究中的应用

生物信息学的快速发展,推动了微生物信息学的建立。模式微生物基因组学的研究,极大地丰富了生物信息学的内容。微生物结构基因组学和功能基因组学研究试图揭示基因结构与功能的内在联系,绘制出基因调控网络图。基因组功能注释是功能基因组学研究的主要目的。基因芯片技术的运用,成为环境微生物生态研究和功能酶基因定位的有力工具。生物信息学为环境微生物的研究和发展提供了一个崭新的信息平台和技术手段。介绍了一些相关数据库和专业网站。     

生物信息技术发展态势分析

随着计算机科学和互联网技术的进步,生物信息学得到了长足的发展。综述了国际生物信息技术的发展态势,分析了生物信息技术研发和应用的热点和重点,并且在概述国内生物信息发展状况的基础上,提出发展我国生物信息技术的建议。     

生物信息学

即将到来的21世纪,人类将全面进入生命科学时代和信息时代。生物信息学(Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ)正成为当今备受关注的新型产业的支撑点。生物信息学是以生物大分子(ＤＮＡ和蛋白质)为分析对象,运用数理方法对其进行分析,来理解生物大分子的生物学意义。从国外近年研究进展来看,它已成为崭新的生物工程、医药产业和高科技农业的巨大推动力。有科学家预言,现今的生物科学在信息学的结合和推动下,将会发生一场革....     

农业生物信息数据库发展现状及应用

农业生物信息数据库是农业科学研究者的基础工具,利用数据库中的大量信息,便于进行农业生物的改良与保护。本文介绍了农业生物信息数据库的发展状况及其应用,并讨论了目前农业生物信息数据库存在的问题。     

表达序列标签(EST)在基因组学研究中的应用

表达序列标签 (expressedsequencetags)是一种快捷、高效的揭示基因组信息的方法。本文对EST的产生、概念、技术原理及其在基因组研究中的广泛应用作一详细的介绍     

Open discovery: An integrated live Linux platform of Bioinformatics tools

Historically, live linux distributions for Bioinformatics have paved way for portability of Bioinformatics workbench in a platform independent manner. Moreover, most of the existing live Linux distributions limit their usage to sequence analysis and basic molecular visualization programs and are devoid of data persistence. Hence, open discovery ‐ a live linux distribution has been developed with the capability to perform complex tasks like molecular modeling, docking and molecular dynamics in a swift manner. Furthermore, it is also equipped with complete sequence analysis environment and is capable of running windows executable programs in Linux environment. Open discovery portrays the advanced customizable configuration of fedora, with data persistency accessible via USB drive or DVD.     

OMSSAGUI: An open-source user interface component to configure and run the OMSSA search engine

We here present a user-friendly and extremely lightweight tool that can serve as a stand-alone front-end for the Open MS Search Algorithm (OMSSA) search engine, or that can directly be used as part of an informatics processing pipeline for MS driven proteomics. The OMSSA graphical user interface (OMSSAGUI) tool is written in Java, and is supported on Windows, Linux, and OSX platforms. It is an open source under the Apache 2 license and can be downloaded from http://code.google.com/p/mass-spec-gui/.