致病酵母菌基因组多态性及亲缘关系的研究

致病酵母是条件致病菌感染中最常见的菌群。其属间、种间及种内的分型具有重要的流行病学及临床意义。以随机扩增多态性(Randomly Amplified Polymorphism DNA markers,RAPD)的方法对48株临床上常见的酵母菌属间、种间及种内基因组型的多态性进行了研究,并以多种引物扩增带型的相似性系数的高低来评价酵母菌之间的亲缘关系。结果表明:RAPD带型可清楚的显示出假丝酵母(Candida)及相关酵母属间、种间及种内的差异,亲缘关系的研究表明假丝酵母属与隐球菌属(Cryptococcus)、丝孢酵母属(Trichosporon)的相似性系数为80％,除季也蒙假丝酵母(C. guilliermondii)外,假丝酵母属中不同种间的相似性系数为82％～87％,同种不同株间的相似性系数>90％。大多数属、种基因组分型的结果和形态学分类结果相符。     

不同渗透压调节剂对Candida krusei生理代谢的影响*

比较了氯化钠、氯化钾、甘露醇存在的高渗环境下克鲁氏假丝酵母(Candida kru-sei)的生理代谢。3种渗透压调节剂对C.krusei生理代谢影响有显著差异。与甘露醇相比,氯化钠和氯化钾对细胞生长的影响更为显著,而氯化钾对细胞的毒性则又小于氯化钠。细胞对糖的消耗速率依次为甘露醇>氯化钾>氯化钠。甘油和海藻糖是C.krusei在高渗环境下的主要相容性溶质。氯化钠和氯化钾对甘油合成的促进作用明显高于甘露醇。在0.6mol/L氯化钠、氯化钾、甘露醇存在时,细胞甘油浓     

脉冲电泳核型分析在酿酒酵母菌分类学研究中的应用

根据酵母属（ Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ Ｍｅｙｅｎ ｅｘ Ｒｅｅｓｓ） 分类学研究最新进展,核实并更新了保藏于中国普通微生物菌种保藏中心的该属菌株的种类归属。在形态和生理生化性状,包括对６ 种糖的发酵能力、对１８ 种碳源和３ 种氮源化合物的同化能力、在无维生素培养基中和３７ ℃下的生长情况、对放线菌素酮的抗性等常规分类学研究的基础上,对部分疑难菌株进行了脉冲电泳核型比较分析。酿酒酵母（ Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ） 、贝酵母（ Ｓ．Ｂａｙａｎｕｓ） 和巴氏酵母（ Ｓ．Ｐａｓｔｏｒｉａｎｕｓ） 三者与少孢酵母（ Ｓ．Ｅｘｉｇｕｕｓ） 在电泳核型上具有明显的差异,主要表现在前三者染色体ＤＮＡ 分子的大小范围均为２２５ ～２２００ ｋｂ ,而Ｓ．Ｅｘｉｇｕｕｓ 缺少小于３６５ ｋｂ 的染色体ＤＮＡ 分子。Ｓ．Ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ 的模式和权威菌株具有１２ ～１４ 条染色体ＤＮＡ 带;Ｓ．Ｂａｙａｎｕｓ 和Ｓ．Ｐａｓｔｏｒｉａｎｕｓ 的模式菌株均有１７ 条带,但在带型上存在一定差异。原归于Ｓ．Ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ 的株菌ＡＳ２－１００ 具有１６ 条带,与Ｓ．Ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ 区别明显而与Ｓ．…     

将一株原红霉素链霉菌转入拟无枝菌酸菌属的分类学研究

对保藏的红霉素链霉菌AS4.894、AS4.198的化学分类研究表明,它们的胞壁类型为IV/A型,不属于胞壁为Ⅱ型的链霉菌属。菌株AS4.198与已由Labeda(1987)转入糖多孢菌属(Saccharopolyspora),定名为Saccharopolyspora erythreus的菌株相似;菌株AS4.894虽然胞壁型与糖多孢菌相似,但磷酸类脂为PⅡ型,应转入拟无枝菌酸菌属(Amycolatopsis Lechevalier,1986)。通过与红霉素糖多孢菌(Saccharopolyspora erythreus)和白色拟无枝菌酸菌(Amycolatopsis alba,A83850~T)进行比较,菌株AS4.894的生长Ph范围广泛,耐盐和耐50℃高温,DNA G+C mol％高,区别于拟无枝菌酸菌属中的任何已知种,而建议命名为新种——红霉素拟无枝菌酸菌(Amycolatopsis erythreus comb.nov.)。     

降解三硝基甲苯的酵母和类酵母菌的研究

从受三硝基甲苯（TNT）严重污染的土壤和废水中分离筛选到17株可降解TNT的酵母菌和白地霉。其中6株为克鲁斯假丝酵母（Candidakrusei）,4株为橡树假丝酵母（C.quercitrusa）,一株为无名假丝酵母（C.famata）,一株为伯杰汉逊酵母（Hansenulabeijerinckii）,一株为亚膜汉逊酵母（H.subpelliculosa）,4株为白地霉（Geotrichumcandidum）。对其中6株菌进行了降解TNT的条件实验,发现降解TNT的适宜pH为7,温度为37～40℃。在含75～80mg／LTNT的培养基中,40h内能降解TNT56～74mg／L,去除率达71％～93％。在培养基中加入0．01％～0．05％的葡萄糖作碳源,或加入0.01％～0．1％的酵母膏对6株菌降解TNT的能力略有促进作用。加入铵盐作为氮源则明显抑制这些菌对TNT的降解。     

纤维素酶水解糠醛渣生产酵母II．糠醛渣酶解液培养酵母

从82株不同种属酵母中选得3株酵母,它们能较好地利用纤维素酶水解糠醛渣所产生的糖液。其菌名和编号是假丝酵母(Candida sp.)As 2．121,热带假丝酵母(Candida tropicalis)培养基糖浓度以1．5％或2．0%较好,这与原始酶解液的糖浓度及其中糠醛等有毒物质有关。最好将原始酶解液稀释一倍以上使用。另外补加相当于含糖量7．5％的(NH4),SO4,5％的KH2PO4和2．5％的尿素。起始pH以5较好。三株菌的最适生长温度略有差异, AS2.121为28—32℃,AS 2.637为2 8—37℃,AS 2.1180为30—35℃,但最适生长温度范围均较广,在 生产上较易控制。在250毫升三角瓶中装培养基50毫升,接种酵母后在旋转摇床(170转／AS 2.121 菌株之菌体产率高且稳定,常达50％;AS 2．637菌株较耐高温,菌体产率亦可高达50％左右;AS 2．1180菌株在摇瓶培养条件下菌体产率较低,为40—45％,且较不稳定,可能和培养基pH值的控制有关。     

固囊酵母的一个新种

从中国保定槐茂甜面酱中分离到一株酵母。经鉴定,这株酵母菌属于固囊酵母属(Citeromyces),并为该属中的一个新种,命名为保定团囊酵母(Citeromyces baodingensis zhangsp.Nov.)。保定团囊酵母与固囊酵母生理生化特性有显著区别,保定固囊酵母(Citeromycesbaodingensis)不发酵蔗糖、棉子糖,同化半乳糖和纤维二糖,不同化海藻糖和棉子糖,G+C含量为48.5mol％。     

代谢木糖和葡萄糖的重组酿酒酵母的构建*

为使酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)YS58代谢木糖产乙醇,采用PCR方法克隆得到树干毕赤酵母(Pichia stipitis)木糖醇脱氢酶基因xyl2,并将该基因和克隆得到的休哈塔假丝酵母(Candida shehatae)缺终止子的木糖还原酶基因xyt1一起连接到酵母表达载体pYES2的强启动子GAL下,得到融合表达载体pYES2-P12。通过醋酸锂转化的方法将pY- ES2-P12转入S．Cerevisiae YS5     

表型相似的热带假丝酵母和麦芽糖假丝酵母在脉冲电泳核型上的差异

热带假丝酵母Ｃａｎｄｉｄａ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ （Ｃａｓｔｅｌｌａｎｉ ）Ｂｅｒｋｈｏｕｔ和麦芽糖假丝酵母Ｃ． ｍａｌｔｏｓａＫｏｍａｇａｔａ, Ｎａｋａｓｅ ＆ Ｋａｔｓｕｙａ是两种可利用烃类作为碳和能量来源的酵母菌,前者还是一种条件致病菌,可引起系统感染。这两种假丝酵母菌在形态和生理生化性状上非常相似,用常规分类方法不易准确地鉴别。本研究对Ｃ． Ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ和Ｃ ｍａｌｔｏｓａ的模式菌株以及中国普通微生物菌种保藏中心（ＣＧＭＣＣ）保藏的归于这两个种名下的其它菌株进行了脉冲电泳核型比较分析。发现这两个表型相似的种具有明显不同的染色体ＤＮＡ分子带型,而同一种内的不同菌株却具有相同或相似的分子核型。Ｃ．Ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ的特异染色体ＤＮＡ分子带谱为２条８．５—１．２ Ｍｂ的带, ４条２．３－３．４ Ｍｂ的带。 Ｃ ｍａｌｔｏｓａ的特异带谱为： ３～４条分子量在１．１－１．３Ｍｂ范围内的带, １条约为２．２Ｍｂ的带以及２－３条大小为３．２－３．５Ｍｂ的带。 Ｃ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ与Ｃ ｍａｌｔｏｓａ在染色体ＤＮＡ分子带型上的差异与二者在可溶性淀粉的同化能力和４０℃下的生长能力上的差异具有明显的相关性…     

掷孢菌科的研究II．中国叶表掷孢酵母的初步分类及掷孢酵母属的种类

作者多年来从我国禾本科等植物叶表分离了大量掷孢酵母,本文重点报道70株掷孢酵母与类酵母的初步分类,共分为三属,即掷孢酵母属(Sporobolomyces),布勤掷孢酵母属(Bul-lera)与腥掷孢菌属(Tilletiopsis);其中掷孢酵母属占75％。至于53株掷孢酵母,共分为三种,即攻红掷孢酣母(Sporobolomyces roseus)、赭色掷孢酵母(Sporobolomyces salmonicolor)、Sporobolomyces shibatanus);经统计,后者最为常见,占此属的84％。这些种在我国尚未见报道,作为新记录。     

Variation in the electrophoretic karyotype analysed by the assignment of DNA probes in Candida albicans

By using pulsed-field gel electrophoresis, we have separated the entire chromosome bands and examined the electrophoretic karyotypes of 27 strains of Candida albicans. The electrophoretic karyotype varied widely among these strains. Their chromosomal DNAs were resolved into 7-12 bands ranging in size from 0.42 to 3.0 Mb. Most of the separated chromosomal bands were assigned by eight cloned C. albicans DNA probes. These results suggest that the haploid number of C. albicans chromosomes is eight. Each of the probes hybridized specifically to one or two bands of similar size in most strains. With the exception of the MGL1 probe, when two bands were detected by one probe, the size of one of them was very conserved whilst the other was of fairly variable size. The sizes of the chromosome bands assigned by the MGL1 probe were much more variable. As C. albicans is considered to be a diploid organism, it is inferred that the karyotype polymorphism between strains is mainly derived from wide size heterogeneity in one of the homologous chromosomes. Furthermore, we have confirmed species-specific and strain-specific variation in medically important Candida species (C. stellatoidea, C. tropicalis, C. parapsilosis, C. krusei, C. guilliermondii, C. kefyr and C. glabrata). Electrophoretic karyotype analysis is thus useful for species assignation. The TUB2 probe, encoding C. albicans beta-tubulin, hybridized to the chromosomal DNA of all the Candida species examined, but four C. albicans probes exhibited cross-species hybridization with C. stellatoidea only. The karyotype of C. stellatoidea seems to be within the range of the intraspecies variation observed in C. albicans.     

假丝酵母同源性的研究

用分光光度法测定了4株郎比可假丝酵母(Candida lambica)间的DNA-DNA同源性,结果:2.1182与LP012的同源性为90.4%,表明它们是同种的;2.1182与DX22为77.5%,DX22与LP012为76.8%,表明它们虽是同种,但产生了一些分化:LP006与LP012为63.2%,表明它们之间产生了较大的分化,接近种的范围,仍可认为是同种的。     

四种假丝酵母与其有性型的分子核型比较*

用脉冲电泳对四种假丝酵母及各自的有性型,包括Candida guilliermondii—Pichia guilliermondii, Candida krusei—Issatchenkia orientalis, Candida naganishii—Debaryomyces nepalensis和Candida valida—Pichia membranaefaciens,进行了分子核型比较分析, 发现每对无性型-有性型酵母菌均具有相同或相似的染色体DNA分子带型, 而各对之间却具有显著差异,显示了脉冲电泳核型分析在寻找及确证酵母菌无性型-无性型关联中的应用价值。     

Genetic diversity of the Pichia membranifaciens strains revealed from rRNA gene sequencing and electrophoretic karyotyping, and the proposal of Candida californica comb. nov

The genetic diversity of the types or authentic strains of 20 facultative synonyms of Pichia membranifaciens (E.C. Hansen) E.C. Hansen was revealed on the basis of large-subunit (26S) rDNA D1/D2 domain and internal transcribed spacer region sequencing and electrophoretic karyotyping. At least five separate species were recognized among the strains studied. Fourteen strains were confirmed to belong to P. membranifaciens. Strain CBS 241, an authentic strain of Zygosaccharomyces chevalieri Guilliermond var. fermentati Saito, should be assigned to Pichia manshurica Santa María. Strain CBS 243, an authentic strain of Zygopichia chiantigiana Castelli, is conspecific with CBS 2287, the type strain of Pichia fluxuum (Phaff & Knapp) Kreger-van Rij. Strain CBS 1367, the type of Zygosaccharomyces bisporus Anderson, belongs to Pichia kluyveri Bedford var. kluyveri. Strain CBS 989, the type of Cryptococcus californicus Anderson & Skinner, represents a distinct species, for which a new combination, Candida californica comb. nov., is proposed. The taxonomic status of strains CBS 189, the type of Pichia calliphorae Kl?cker, and CBS 214, the type of Pichia derossii Castelli, remain to be studied further. Their D1/D2 sequences and chromosomal DNA banding patterns were similar to those of P. membranifaciens, but their internal transcribed spacer sequences differed significantly.     

具有不同碳源利用方式的酿酒酵母菌株的脉冲电泳核型分析

根据酵母属（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ　ＭｅｙｅｎｅｘＲｅｅｓｓ）分类学研究的最新进展,对保藏于中国普通微生物菌种保藏中心的酿酒酵母（Ｓ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅＭｅｙｅｎｅｘＨａｎｓｅｎ）菌株进行了系统的分类学研究。在表型性状,包括形态、对６种糖类化合物的发酵反应、对１８种碳源和３种氨源化合物的同化反应、在无维生素培养基中和在３５℃及３７℃下的生长情况、对放线菌素酮的抗性等研究的基础上,主要以发酵反应的异同为主将所研究的４０株酿酒酵母菌分成了４组。其中两组２６株与该种的最新标准描述相符,而另两组１４株在蔗糖的发酵和同化及麦芽糖的同华能力上与标准描述不符。进一步的脉冲电泳核型比较分析表明,在生理生化性状上可以清楚分开的４个组,在脉冲电泳核型上却没有相应的区别。典型的酿酒酵母菌株有１２－１５条染色体ＤＮＡ带,大小范围为２２５－２,２００Ｋｂ。在个别生理生化性状上与酿酒酵母的标准描述不符的两组菌,却具有与典型酿酒酵母菌株相同的脉冲电泳核型,证实它们应属于这个种。而菌株ＡＳ２．１４２１虽然其表型性状与酿酒酵母的标准描述完全相符,却具有与典型酿酒酵母菌株差异明显的脉冲电泳核型。该株菌染色体ＤＮＡ分子的大小范围与酿酒酵母?     

105种人类染色体新核型的细胞遗传学报道

为了探讨异常染色体的遗传效应, 采用细胞培养、G显带及C显带的方法, 根据人类遗传学国际命名体制(ISCN 2009)对染色体核型命名, 对2009年1月至2012年7月就诊广西壮族自治区妇幼保健院检出的新核型进行细胞遗传学及临床分析。在受检者中检出105种人类染色体新核型, 经检索国内外文献未见报道。其中易位86例, 倒位10例, 衍生染色体6例, 重复染色体1例, 等臂染色体1例, 部分重复和缺失1例。结果显示, 染色体异常是导致流产、不孕不育、先天畸形、智力低下、闭经等疾病的重要原因。     

Electrophoretic karyotypes and chromosome numbers in Candida species

The electrophoretic karyotypes of five Candida albicans isolates and of five other Candida species have been determined, using orthogonal field alternating gel electrophoresis (OFAGE). None of the C. albicans isolates had the same electrophoretic karyotype. By comparing all five strains, we arrived at a chromosome number of nine to ten, but since the organism is diploid, we cannot distinguish genetically different chromosomes from homologues which resolve. We determined minimal chromosome numbers of 9 for Candida stellatoidea, 10 for C. glabrata and 6 for C. guilliermondii.     

海南热带雨林腐木上两个无性型子囊菌酵母新种

用含木糖为唯一碳源和含葡萄糖及7.6%乙醇的两种富集培养基对采自海南热带雨林腐木样品中的酵母菌进行了分离培养。对分离出的酵母菌株进行的分子分类学研究表明,其中两株酵母菌X2WZ07-4和G2WZ06-1代表两个无性型子囊菌酵母新种。大亚基(26S)rRNA基因D1/D2域序列分析显示,与X2WZ07-4和G2WZ06-1亲缘关系最近的已知种分别为Candida cylindracea和C.llanquihuensis。在D1/D2域,X2WZ07-4与C.cylindracea模式菌株的碱基序列差异为2.5%;G2WZ06-1与C.llanquihuensis模式菌株的序列差异为3.9%,均远大于酵母菌种间在此区域的序列差异(～1%)。这两个新种分别被命名为拟柱形假丝酵母Candida pseudocylindracea sp.nov.(模式菌株:X2WZ07-4T=AS2.3788T=CBS10854T)和五指山假丝酵母Candida wuzhishanensis sp.nov.(模式菌株:G2WZ06-1T=AS2.3784T=CBS10850T)。