白色念球菌形态发生相关基因的克隆与鉴定

抽提白色念珠菌菌丝状态下的ｍＲＮＡ,制备ｃＤＮＡ文库。以白色念珠菌菌体和菌丝ｍＲＮＡ为模板合成探针,进行差别杂交筛选（ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ ｓｃｒｅｅｎｉｎｇ）。得到一个在菌体形态丰表达较强的克隆和６７个菌丝形态下表达较强的克隆。物理图谱分析和核苷酸序列分析表明菌体形态下表达的ＣＸ１ ｃＤＮＡ片段编码细胞色素Ｐ４５０Ｌ１Ａ１（羊毛甾醇１４ａ－脱甲基酶,ｌａｎｏａｔｅ     

47个早期人胚胎低丰度表达基因ESTs筛选及结果分析

构建高质量ｃＤＮＡ文库在基因克隆、ｍＲＮＡ差异展示、表达序列标签测序和基因定位等研究中具有十分重要的作用。为了从早期胚胎中分离人类新基因,构建了受精后３周龄的人ｃＤＮＡ文库,用标记的一链ｃＤＮＡ探针对该文库的６５０８个克隆子进行菌落原位杂交,得到１６７７个无任何杂交信号的低丰度表达克隆子,从中随机挑选了４７个进行５′端部分测序,将测序结果与三大基因库进行序列同源性比较,发现１８个克隆（３８．３％）     

从人早期胚胎中克隆组织型纤溶酶原激活因子基因cDNA

人在早期胚胎时ｔＰＡ基因表达,但ｍＲＮＡ丰度很低。以１７日龄人胚胎为材料,分离ｍＲＮＡ,以表达质粒ｐＳＰＯＲＴ１为载体,建立ｃＤＮＡ文库,重组子达到１．６×１０６个,能包含极低表达基因的ＣＤＮＡ。从人血白细胞基因组中扩增出一条１７５ｂｐ的ｔＰＡ外显子片段作探针,用地高辛标记进行菌落原位杂交,获得六个阳性菌落。提取阳性菌落质粒,经限制性内切酶Ｓａｌ　Ⅰ和ＥｃｏＲⅠ酶切分析鉴定,得到３个ｔＰＡｃＤＮＡ重组子。     

簇毛麦低拷贝cDNA序列的克隆和鉴定

从簇毛麦叶片中提取总ＲＮＡ,进一步分离ｍＲＮＡ。以ｍＲＮＡ为模板反转录合成ｃＤＮＡ,两端经Ｔ４ＤＮＡ多聚酶修平后加ＥｃｏＲ１接头分子,连接于质粒ｐＧＥＭ－７Ｚｆ（＋）的ＥｃｏＲ１克隆位点,转化大肠杆菌ＪＭ１０３菌株建立了ｃＤＮＡ文库。用ＰＣＲ扩增重组质粒的ｃＤＮＡ插入序列,用＾３２Ｐ标记后分别与ＨｉｎｄⅢ或ＸｂａⅠ酶切的小麦－黑麦附加系ＤＮＡ进行Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交。根据其杂交结果,目前已鉴定出４     

人颌下腺cDNA文库的构建

本研究从新鲜的人颌下腺组织中提取总ＲＮＡ,从中分离出带ｐｏｌｙ（Ａ）尾的信使ＲＮＡ［ｐｏｌｙ（Ａ）〕ｍＲＮＡ］,并合成带ＮｏｔＩ位点的双链ｃＤＮＡ后,接上ＥｏｃＲＩ接头定向插入λｇｔ１１表达载体,经体外包装后转染Ｙ１０９０宿主菌,遂构建成人颌下腺ｃＤＮＡ文库。该文库有４．１×１０５个噬菌体,重组率为１００％,可供寡核苷酸探针和单克隆抗体两种方法筛选目的基因。     

人胎肝唾液酸转移酶基因的克隆及测序

根据已克隆的唾液酸转移酶的保守区的序列,以人胎肝ｍＲＮＡ为模板扩增出１５０ｂｐ的片段并测序。其中一个片段（ｓ３８）与已克隆的唾液酸转移酶的活性中心有５７％～９７％的同源性。根据ｓ３８的序列合成寡核苷酸并标记后用作探针筛选人胎肝ｃＤＮＡ文库。从文库中分离了一个编码α２,３唾液酸转移酶的ｃＤＮＡ。该ｃＤＮＡ序列含一个编码３４０个氨基酸的开放读框,推导的氨基酸序列与人颌下腺Ｇａｌβ１,３ＧａｌＮＡｃα２,３唾液酸转移酶相同,与猪颌下腺α２,３唾液酸转移酶有８３２％的同源性。表明从人胎肝ｃＤＮＡ文库中分离的ｃＤＮＡ所编码的蛋白为Ｇａｌβ１,３ＧａｌＮＡｃα２,３唾液酸转移酶     

蝶兰胚珠发育基因的表达及序列分析

对从蝶兰（Ｐｈａｌａｅｎｏｐｓｉｓｓｐ．）成熟胚珠的ｃＤＮＡ文库中获得的ｃＤＮＡ克隆Ｏ１３８的时空表达特性和序列进行了分析。Ｎｏｒｔｈｅｒｎ分子杂交结果显示出该基因的ｍＲＮＡ在成熟胚珠和根中大量积累,但在大孢子母细胞时期的胚珠和子房组织中积累水平很低。ＤＮＡ序列分析表明,该基因含一个编码２８４个氨基酸,分子量为３０ｋＤ蛋白的开放阅读框架。Ｏ１３８是一个与成熟胚珠发育相关的基因。     

热休克后表达受抑基因的分子克隆及其表达特性

以人成骨肉瘤细胞株ＨＯＳ－８６０３为热休克模型,在利用ＤＤｍＲＮＡ方法筛选和克隆了一个热休克后表达受抑基因的ｃＤＮＡ片段的基础上,以该片段为探针,筛选ＨＯＳ－８６０３细胞的ｃＤＮＡ文库,获得该基因的全长ｃＤＮＡ克隆（ＨＳＳＧ－１）;ＤＮＡ序列测定表明该ｃＤＮＡ全长１４５６ｂｐ,编码２７６个氨基酸,经计算机辅助分析,该ｃＤＮＡ序列尚未被报道。经ＲＮＡ斑点杂交证实,该基因的表达于多种组织细胞之中,并且     

喉癌差异表达cDNA序列的分离与初步鉴定

分离和克隆人喉癌中新的相关基因将有助于提示喉癌的易感性与癌变机制。运用ｍＲＮＡ差异显示法对２例成人喉癌组织及配对癌旁正常组织的基因表达进行研究,分离到３５个差异显示片段;用反向Ｎｏｒｔｈｅｒｎ点杂交筛选到６个差异片段,经克隆、测序和匹配分析,得１２条不同ｃＤＮＡ序列,其中４条为新基因序列,另外８条与已知基因高度同源。将１２条ｃＤＮＡ序列固定在膜上,用来自喉癌和配对正常组织的总ｃＤＮＡ探针与其杂交和     

重组人apoE基因表达活性和转基因小鼠研究

人ａｐｏＥ基因组ＤＮＡ,去除其自身妄动仓,代之以小鼠金属硫蛋白启动子,重组质粒经脂质体介异转入小鼠ＮＩＨ／３Ｔ３细胞后,以人ａｐｏＥ基因组ＤＮＡ／ＥｃｏＲⅠ片段为探针检测ｍＲＮＡ表达,可见ａｐｏＥ ｍＲＮＡ杂交信号很强,经重金属诱导后杂交信息更强,表明ＭＴ启动子功能良好,ｐＭＥ表达正常。     

猕猴桃果实成熟进程中木葡萄聚糖内糖基转移酶mRNA水平的变化

以中华猕猴桃（Ａｃｔｉｎｉｄｉａ ｃｈｉｎｅｎｓｉｓ Ｐｌａｎｃｈ．）果实为试材,木葡聚糖内糖基转移酶（ＸＥＴ）ｃＤＮＡ为探针,研究果实成熟进程中ＸＥＴＮ ｍＲＮＡ的变化规律,探讨ＸＥＴ在果实后熟软化过程的作用。结果表明,２０℃下外源乙烯处理可促进ＸＥＴｍＲＮＡ的积累,且这种效应因乙烯处理时间的加长而加强,进而加速了是实软件;０℃处理可抑制ＸＥＴ ｍＲＮＡ的增加,延缓果实软化,但当果实转入２０℃后     

拟南芥AtJ3基因的克隆和分析

克隆并分析了拟南芥（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓｔｈａｌｉａｎａ（Ｌ．）Ｈｅｙｎｈ．）ＡｔＪ３的ｃＤＮＡ核苷酸序列,并证明其翻译产物与Ｅ．ｃｏｌｉ的ＤｎａＪ蛋白高度同源。ＡｔＪ３蛋白分子中具有全部这类蛋白的典型特征包括Ｊ结构域（ｄｏｍａｉｎ）、Ｇ或ＧＦ结构域、富含半胱氨酸的锌指结构域,Ｃ末端的ＣＡＱＱ是一个蛋白法尼基化信号。用ＡｔＪ３的ｃＤＮＡ序列末端非翻译区作探针,从拟南芥基因组文库中分离获得ＡｔＪ３基因。基因序列分析表明该基因是由被５个内含子分隔的６个外显子组成。根据Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交分析,ＡｔＪ３基因为单拷贝基因。Ｎｏｒｔｈｅｒｎ分析结果表明,ＡｔＪ３在子叶、叶、根、花及长角果中都表达。３５℃的热激能增加叶中ＡｔＪ３的ｍＲＮＡ表达     

蝶兰胚珠的cDNA文库构建及其特异基因表达的研究

以蝶兰（Ｐｈａｌａｅｎｏｐｓｉｓ＂Ｍｔ．Ｋａａｌａ”ｃｖＳＭ９１０８）为材料,分别提取大孢子母细胞时期胚珠和成熟胚珠的ＰｏｌｙＡＲＮＡ,反转录成ｃＤＮＡ,构建起两个ｃＤＮＡ文库。克隆筛选采用差异杂交法。从上述两个ｃＤＮＡ,对其在植物体不同器官和不同发育时期的胚珠内的表达进行了分析。结果表明该两个ｃＤＮＡ均为胚珠特异,并且分别在胚珠发育的特定时期表明。推测该两个ｃＤＮＡ的表达受胚珠内部的不同因子调控     

β—半乳糖苷酶基因在猕猴桃果实成熟过程的表达

从成熟中华猕猴桃果实中克隆以了一个β－半乳糖苷酶基因ｃＤＮＡ片段,其长度为７４７ｂｐ,有一由２４９个氨基酸组成的开放阅读框架它与苹果、 芦笋、绿药椰菜、番匣中β－半乳糖苷酶基因ｃＤＮＡ相应区段的的核同源性为７６．３％～７０．３％,氨基酸同源性为６９．１％～７２．７％,用该片段为探针进行Ｎｏｒｔｈｅｒｎ分析表明,果实采收时,β－半乳糖苷酶ｍＲＮＡ水平最高,随后呈下降变化,同时β－半乳糖苷酶ｍＲＮＡ水     

地高辛标记反意RNA探针检测脑组织切片生长抑素mRNA

本实验采用含大鼠生长抑素基因的ｐＳＰ６５ｃＤＮＡ质位通过转化至噬菌体内大量扩增,经提取,纯化后,用限制性内切酶进行酶切使质枝线性化,并将其作为模板,用地高辛（ＤｉｇｏｘｉｇｅｎｉｎＤｉｇ）作为标记物,体外转录合成生长抑素反意ＲＮＡ（ｃＲＮＡ）探针。实验动物选用ｗｉｓｔａｒ新生大鼠。冰冻切片,端、间脑切片经杂交前用Ｄｉｇ－ＵＴＰ标记的ｃＲＮＡ探针杂交,杂交后用抗Ｄｉｇ－碱性磷酸酶复合物进行酶联免疫反应。Ｘ－磷酸盐－ＮＢＴ显色。结果显示新生大鼠脑内生长抑素ｍＲＮＡ神经元着紫蓝色。杂交反应物集中于核周的胞浆及短小的突起内。胞核不着色。胞体轮廓清晰,周围背底浅淡。结果表明Ｄｉｇ标记ｃＲＮＡ探针不仅具备非同位素标记探针的优点而且能快速和准确检测组织细胞内ｍＲＮＡ的表达。     

用差异显示法从人胎脑基因文库分离一个编码序列

人１８周、２２周胎儿脑、肝肾组织总ｍ ＲＮＡ 用ＤＤＲＴ－ＰＣＲ显示出差异的条带,回收胎脑和肝肾特异性表达的４８７条电泳条带．其中某些条带用３种组织的ｃＤＮＡ 探针作点杂交,筛选只对胎儿脑总呈阳性的ＤＮＡ 片段．以其中某一条带ＤＮＡ 为探针,从胎儿脑ｃＤＮＡ 文库筛选阳性克隆,得到ＧＣ５８．经Ｎｏｒｔｈｅｒｎ 杂交和ＤＮＡ 测序,表明它是人脑表达的序列,与数据库中ＫＩＡＡ０５１５有同源性,并编码一个有２７４个氨基酸的蛋白质,该蛋白质序列尚未见报道．探讨了ＤＤＲＴ－ＰＣＲ的条件和假阳性问题．     

树Qu载脂蛋白CI cDNA序列及其组织表达

分离提取树Ｑｕ肝组织ｍＲＮＡ,经皮为模板,反转录构建了ＴＳ肝组织ｃＤＮＡ文库。利用制备的兔抗ＴＳ载脂蛋白ＣＩ多抗血清为探针筛选该文库,获得两个阳性克隆。测序及序列分析表明：两个克隆均为ＴＳａｐｏｉＣＩｃＤＮＡ基因。大的克隆由３８０个核苷酸要成,包括２１ｂｐ,９５ｂｐ组成的５’和３‘非编码区,２６４ｂｐ组成的一个完整开放阅读框架,编码８８个氨基酸的ａｐｏＣＩ前体,含２６个氨基酸构成的信号肽和６２肽的     

北京鸭载脂蛋白AⅠ cDNA的克隆及其组织表达

分离提取北京鸭肝组织ｍＲＮＡ,以此为模板,反转录构建了鸭肝组织ｃＤＮＡ文库．利用制备的兔抗鸭载脂蛋白ＡⅠ（ａｐｏＡⅠ）多抗血清为探针筛选该文库,获得１０个阳性克隆．测序及序列分析表明：克隆得到了完整的鸭ａｐｏＡⅠｃＤＮＡ序列,它由１０５０个核苷酸构成,包括１８ｂｐ、２４０ｂｐ组成的５′和３′非翻译区,７９２ｂｐ组成的一个完整开放阅读框架,编码２６４个氨基酸的鸭ａｐｏＡⅠ前体,含１８个氨基酸构成的信号肽、６个氨基酸的原肽片段和２４０肽的成熟蛋白．推译出的成熟肽与鸭ａｐｏＡⅠ氨基酸的直接测序结果完全一致．该新基因已被ＧｅｎＢａｎｋ接受．Ｎｏｒｔｈｅｒｎｂｌｏｔ显示鸭ａｐｏＡⅠｍＲＮＡ不仅主要在肝和小肠组织表达;而且不同于人和哺乳动物,亦可少量在脑、肾、肌肉组织分布．结果为进一步研究不易感动脉粥样硬化动物北京鸭ａｐｏＡⅠ基因组结构、功能奠定了基础．     

植物发育基因克隆技术的新进展

过去２０年,人们已经分离到了相当数量的与发育相关的基因。这主要借助于蛋白质产物的分离纯化,然后根据其氨基酸结构推算其相应的核苷酸序列,并据此合成寡核苷酸探针,最终从ｃＤＮＡ文库或基因组文库中筛选出目的基因。而未知其编码产物的发育基因的分离克隆则是非常困难的工作,以前广泛应用的主要方法有ＤＮＡ标签法（ＤＮＡｔａｇｇｉｎｇ）［１,２,３］,作图克隆法（ｍａｐ－ｂａｓｅｄｃｌｏｎｉｎｇ）［４］,差别筛选法（ｄｉｆｅｒｅｎｔｉａｌｓｃｒｅｅｎｉｎｇ）［５］和扣除杂交法（ｓｕｂｔｒａｃｔｉｖｅｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ）［６,７,８］。这些方法虽然都取得了一定的成功,但由于各自的缺陷性,而限制了它们更加广泛的应用。近年来在ＰＣＲ技术的基础上,人们已经建立了若干种分离克隆植物发育基因的新方法。１９９２年,ＬｉａｎｇＰ和ＰａｒｄｅｅＡ［９］首次提出并运用了ｍＲＮＡ差别显示技术（ｍＲＮＡｄｉｆ－ｆｅｒｅｎｔｉａｌｄｉｓｐｌａｙｒｅｖｅｒｓｅｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ－ＰＣＲ,ＤＤＲＴ－ＰＣＲ）来进行基因的分离。实践表明,ｍＲＮＡ差别显示技术在分离、鉴定差别表达的新基因方面与以前的各种技术相比有其独特的优越性,但同时它也存在着重复性较差等缺点。因此,最近研究工作者又在其基础上,发展了诸如代表性差式分析（ｒｅｐｒｅｓｅｎｔａｔｉｏｎａｌｄｉｆｅｒｅｎｃｅａｎａｌｙｓｉｓ,ＲＤＡ）［１０,１１］和抑制性扣除（或减去）杂交（ｓｕｐｐｒｅｓｓｉｏｎｓｕｂｔｒａｃｔｉｖｅｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ,ＳＳＨ）［１２］等一些更新的方法。下面就此作一简要概述。     

一种简易RNA甲醛—琼脂糖凝胶变性电泳

构建ｃＤＮＡ文库 ,进行Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交分析以及ＲＴ ＰＣＲ等分子生物学研究 ,都需要纯度高、完整性好的ＲＮＡ。鉴定ＲＮＡ的完整性通常需要进行甲醛 琼脂糖凝胶电泳。然而 ,传统的甲醛 琼脂糖凝胶电泳操作步骤繁杂[1 ] ,本文提出一种改进的甲醛 琼脂糖凝胶电泳 ,不仅简化了操作 ,而且效果很好。我们以向日葵总ＲＮＡ和ｍＲＮＡ甲醛 琼脂糖凝胶电泳为例 ,对这一方法进行介绍。1　材料与方法1.1　总ＲＮＡ的提取及ｍＲＮＡ的分离取向日葵花蕾 1ｇ ,按照改进的异硫氰酸胍法提取向日葵总ＲＮＡ[2 ] 。利用磁珠法分离ｍＲＮＡ[3] 。…