细菌性阴道病肠道菌群与阴道菌群16S rDNA测序分析

目的通过对细菌性阴道病(BV)患者肠道菌群及阴道菌群16S rDNA扩增子测序,分析其结构、多样性、相关性以及BV对肠道菌群的影响,为今后治疗BV提供新的思路。方法选取符合纳入标准的BV患者11例(BV组),健康者9例(C组),留存阴道分泌物及新鲜粪便进行16S rDNA基因检测分析。结果C组阴道菌群以乳杆菌属为主,BV与加德纳菌属、普雷沃菌属、Sneathia、窄食单胞菌属(Stenotrophomonas)、阿托波菌属、Shuttleworthia、巨型球菌属密切相关。BV组肠道、阴道菌群丰富度均高于C组。Alpha多样性分析中C组和BV组肠道菌群、阴道菌群的Shannon指数组间比较,χ²值为29.137, P=0.000<0.05,两组阴道菌群Shannon指数组间比较差异具有统计学意义(P<0.05),BV组高于C组。物种多样性曲线反映本研究样本测序数据量的合理性,表明BV组的肠道菌群多样性、丰富度均高于C组,主坐标分析表明C组肠道与阴道的菌群结构差距较大,BV组肠道与阴道的菌群结构有相似之处,且两组肠道菌群结构接近。BV组阴道菌群中厚壁菌门丰度较C组低,放线菌门、拟杆菌门较C组高;BV组肠道菌群中拟杆菌门丰度较C组低;C组肠道中拟杆菌门明显高于阴道,厚壁菌门明显低于阴道; BV组阴道菌群中放线菌门丰度高于C组,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论BV阴道菌群与肠道菌群具有相关性,BV可能引起肠道菌群结构比例和多样性的改变。     

唾液菌群特征分析对儿童龋齿复发的预测价值

目的探究唾液菌群特征对儿童龋齿复发的预测价值。方法收集2017年1月至2018年1月在中铁十七局集团有限公司中心医院诊断及治疗的龋齿患儿94例,在进行龋齿治疗后第4周搜集唾液样本,并根据12个月后的龋齿发生情况分为复发组及未复发组,对比两组微生物检测结果,并使用ROC曲线评估微生物指标对龋齿复发的预测效能。结果本研究随访结束时,龋齿复发23例(25.84%)。龋齿复发与未复发组的唾液微生物组成存在显著差异:复发组的变形链球菌(Streptococcus mutans)、内氏放线菌(Actinomyces naeslundii)、普雷沃氏菌属(Prevotella)、二氧化碳噬纤维菌属(Capnocytophaga)、普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)、放线菌属(Actinobacillus)的相对丰度显著高于未复发组(均P<0.05),未复发组在纤毛杆菌属(Leptotrichia)、奈瑟氏菌属(Neisseria)、链球菌属(Streptococcus)的相对丰度显著高于复发组(均P<0.05)。纤毛杆菌属、内氏放线菌、普雷沃氏菌属、变形链球菌载量预测龋齿复发的AUC值分别为0.753、0.715、0.680、0.940,其中变形链球菌的AUC值显著高于其他三种菌属(均P<0.05)。结论分析唾液菌群对儿童龋齿的复发具有一定的预测价值,其中变形链球菌的预测效能较好。     

复方大黄灌肠液对尿毒症患者的作用

目的探讨复方大黄灌肠液对尿毒症患者肠道菌群、血清内毒素及炎症因子的影响。方法选取2019年6月至2020年4月我院收治的90例尿毒症患者为研究对象,入选患者随机分为常规组与观察组,各45例。所有患者均采用常规治疗(血液透析,降压、降糖、调节饮食,改善贫血),观察组患者在此基础上给予复方大黄灌肠液进行灌肠。对比治疗前后2组患者肠道菌群、血清内毒素及炎症因子水平变化,同时对比两组患者营养不良和多脏器功能障碍综合征(MODS)发生率。结果治疗前,两组患者肠道菌群OTUs数量、门水平和属水平相对丰度差异均无统计学意义(均P>0.05)。治疗后常规组患者肠道菌群OTUs数量、门水平和属水平相对丰度无明显改变(均P>0.05);而观察组患者肠道菌群OTUs数量、肠道厚壁菌门、放线菌门、双歧杆菌属、芽胞杆菌属、乳杆菌属、假单胞杆菌属相对丰度均升高,且观察组高于常规组(均P<0.05)。观察组患者治疗后肠道变形菌门、梭杆菌门、衣原体门、志贺菌属、埃希菌属、沙门菌属、梭杆菌属、衣原体属相对丰度均下降,且观察组低于常规组(均P<0.05)。LEfSe分析发现治疗后观察组患者肠道biomarker主要为互养菌目、理研菌科、普雷沃菌科、毛螺旋菌科,而对照组患者肠道biomarker主要为嗜胆菌属、耶尔森菌属、葡萄球菌属。治疗前两组患者血清内毒素、炎症因子水平对比差异无统计学意义(均P>0.05),治疗后两组患者血清内毒素、炎症因子水平均下降,且治疗后观察组血清内毒素、炎症因子水平均低于常规组(均P<0.05)。观察组患者营养不良(15.56% vs 35.56%)、MODS(4.44% vs 22.22%)发生率均低于常规组(均P<0.05)。结论复方大黄灌肠液可改善尿毒症患者肠道菌群,降低血清内毒素及炎症因子水平,减少患者营养不良和MODS发生率,值得临床推广。     

Lynch综合征患者肠道菌群特征及其与糖脂代谢水平的相关性

目的 探讨遗传性非息肉性结直肠癌（Lynch综合征）患者肠道菌群特点及其与糖脂代谢指标的相关性。方法 选取2011年9月至2021年9月我院收治的42例Lynch综合征患者作为Lynch组,并选取42例同期健康体检人群作为对照组。比较两组对象粪便菌群的丰度和多样性,应用Pearson相关性检验分析不同菌属拷贝数与糖脂代谢指标水平的相关性。结果 Lynch组患者肠道菌群Chao1指数、Ace指数、Shannon指数均高于对照组,Simpson指数低于对照组（均P<0.05）。Lynch组患者HbA1c、TC、TG、LDL-C、FPG、apo-B水平均高于对照组,HDL-C和apo-A1水平低于对照组（均P<0.05）。Lynch组患者粪便中以变形菌门、肠球菌属、埃希菌属、消化链球菌属、韦荣球菌属、不动杆菌属为主要优势菌。Lynch组患者TG水平与乳杆菌属拷贝数呈负相关,与埃希菌属和韦荣球菌属拷贝数呈正相关（均P<0.05）;HDL-C水平与乳杆菌属和布劳特菌属拷贝数呈正相关,与埃希菌属、韦荣球菌属、消化链球菌属拷贝数呈负相关（均P<0.05）;FPG水平与乳杆菌属...     

强直性脊柱炎患者咽部菌群变化

目的探讨强直性脊柱炎患者的咽部菌群变化。方法筛选入组7例强直性脊柱炎患者和7例健康者咽拭子样本,提取咽部DNA,扩增16SrRNA基因,在Illumina平台测序,对测序结果进行生物信息学分析。结果从ACE指数、Chao1指数、Shannon指数和Simpson指数综合来看强直性脊柱炎患者的咽部菌群Alpha多样性差异不大。Beta多样性分析显示两组研究对象咽部菌群样本可被区分。强直性脊柱炎患者咽部菌群组成和含量发生显著改变,主要变化包括:拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)显著降低。拟杆菌门中普雷沃杆菌属(Prevotella)相关的纲目科属水平都显著降低。放线菌门变化落实到属水平,放线菌属(Actinomyces)显著降低,丙酸杆菌属(Propionibacterium)和棒状杆菌属(Corynebacterium)显著增高。厚壁菌门(Firmicutes)中,芽胞杆菌纲(Bacilli)所属的与链球菌属(Streptococcus)相关的纲目科属水平显著增加,而梭状芽胞杆菌纲(Clostridia)包含的韦荣球菌属(Veillonella)、消化球菌属(Peptococcus)显著下降。此外,变形菌门中出现弧菌属(Vibrio)的增加和弯曲菌属(Campylobacter)的降低等变化。结论强直性脊柱炎患者(本次研究样本)的咽部菌群出现紊乱,以普雷沃杆菌属、放线菌属、韦荣球菌属、消化球菌属和弯曲菌属等显著降低,丙酸杆菌属、棒状杆菌属、链球菌属和弧菌属等显著增加为主要特征。     

深海鱼油治疗阿尔茨海默病大鼠的作用及对其肠道菌群的影响

目的研究深海鱼油对阿尔茨海默病(AD)大鼠的治疗作用及其对大鼠肠道菌群的影响。方法从60只SD大鼠中随机选择50只建模并随机分为5组,其余为假手术组。石杉碱甲组灌胃石杉碱甲注射液20 μg/kg,深海鱼油高、中、低剂量组分别灌胃0.21 g/kg、0.42 g/kg、0.84 g/kg深海鱼油,假手术组和模型组大鼠灌胃等体积生理盐水,大鼠给药体积按照1 mL/kg。结果第2、3、4、5 d大鼠逃避潜伏期,Aβ40、Aβ42含量,拟杆菌门、瘤胃菌科、拟杆菌科、普雷沃氏菌科、拟杆菌属、螺杆菌属、普雷沃氏菌属、链球菌属水平,模型组高于假手术组(P<0.05),石杉碱甲组和深海鱼油高、中、低剂量组均低于模型组(P<0.05);大鼠跨越平台次数,厚壁菌门、变形菌门、乳杆菌科、毛螺菌科、韦荣球菌科、乳杆菌属、瘤胃球菌属、毛螺菌属、肠球菌属、韦荣球菌属水平,模型组低于假手术组(P<0.05),石杉碱甲组和深海鱼油高、中、低剂量组均高于模型组(P<0.05)。模型组神经组织显著改变,石杉碱甲组和深海鱼油高、中、低剂量组均出现好转。结论深海鱼油可改善AD模型大鼠学习能力和记忆能力、减轻大鼠海马组织病变,改善大鼠肠道菌群。     

乳杆菌属细菌对宫颈上皮内瘤变患者阴道菌群的影响

目的分析乳杆菌属细菌对宫颈上皮内瘤变(CIN)患者阴道菌群的影响,为该类患者的治疗提供参考。方法选择2019年1月至2020年1月我院收治的CIN患者137例,根据组织学病理结果分为CIN Ⅰ组(84例)和CIN Ⅱ、Ⅲ组(53例)。选择同期100例宫颈检查正常者为对照组。比较各组对象阴道菌群数量。根据患者阴道内乳杆菌数量将患者分为高数量组和低数量组,比较2组患者阴道菌群数量。结果CIN Ⅰ组患者阴道厚壁菌门数量低于CIN Ⅱ、Ⅲ组和对照组,而放线菌门数量高于CIN Ⅱ、Ⅲ组和对照组(均P<0.05)。CIN Ⅱ、Ⅲ组患者阴道乳杆菌属数量高于CIN Ⅰ组和对照组(均P<0.05)。CIN Ⅰ组患者阴道加德纳菌属、奇异菌属数量高于CIN Ⅱ、Ⅲ组和对照组(均P<0.05)。对照组对象阴道菌群Chao、ACE指数均低于CIN Ⅰ组和CIN Ⅱ、Ⅲ组(均P<0.05),同时CIN Ⅱ、Ⅲ组患者阴道菌群Chao、ACE指数均低于CIN Ⅰ组(均P<0.05)。高数量组患者阴道加德纳菌属、奇异菌属占比均低于低数量组(均P<0.05)。结论阴道中乳杆菌属数量的改变易影响阴道菌群,使其抗感染能力下降,增加女性CIN的风险。     

喂养方式对西安地区0～2个月婴儿肠道菌群的影响

目的 探讨母乳和混合喂养方式对西安地区婴儿肠道菌群的影响。方法 收集24例0～2月龄西安地区健康婴儿粪便样本,根据婴儿的喂养方式,将样本分为母乳喂养组（17例）和以奶粉为主的混合喂养组（7例）。利用16S rRNA基因测序技术对不同喂养方式的婴儿肠道菌群进行测序,比较不同喂养方式对婴儿肠道菌群多样性和菌群差异的影响。结果 母乳喂养组婴儿粪便样本Ace指数和Chao1指数显著高于混合喂养组（t=4.886, P<0.05; t=6.855, P<0.05）, Shannon指数显著低于混合喂养组（t=2.126,P<0.05）。门水平上,2组样本均以放线菌门、厚壁菌门、变形菌门和拟杆菌门为主,但比例存在差异。相比混合喂养组,母乳喂养组婴儿粪便样本放线菌门和拟杆菌门丰度显著升高（U=6,P<0.05;U=0,P<0.05）,厚壁菌门和变形菌门丰度显著降低（U=24,P<0.05;U=16,P<0.05）。属水平上,母乳喂养组婴儿粪便样本双歧杆菌相对丰度（72.04%）显著升高,同时发现罗氏菌属和葡萄球菌属相对丰度也高于混合喂养组（U=17,P<...     

不同脑卒中风险中老年人群肠道菌群的差异

目的研究不同脑卒中风险中老年人群肠道菌群的差异,为后续研究提供参考。方法选取2017年2月至2019年2月来我院接受检查的中老年脑卒中风险者126例,根据不同卒中风险程度分为低危组(48例)、中危组(45例)、高危组(33例);同时进行认知功能筛查,选出轻度认知功能障碍患者35例为轻度障碍组,剩余91例认知功能正常者设为照组。采集所有受试者粪便并提取细菌DNA,分析肠道菌群构成情况;同时比较不同卒中风险者肠道短链脂肪酸水平并分析肠道菌群与认知功能的关系。结果低危组患者肠道菌群主要由瘤胃球菌科、柔嫩梭菌属、毛螺旋菌科、罗氏菌属及丁酸弧菌属构成。中危组患者肠道菌群主要由韦荣球菌科、埃希菌属及乳杆菌科构成。高危组患者肠道菌群主要由韦荣球菌科、肠杆菌科构成。低危组患者肠道瘤胃球菌科、毛螺旋菌科、普雷沃菌科丰富度显著高于中危组,肠杆菌科、韦荣球菌科、梭菌属及链球菌科丰富度显著低于中危组及高危组(均P0.05)。低危组患者肠道丁酸水平显著高于中危组和高危组(均P0.05)。轻度认知功能障碍患者肠道氨基酸球菌科、肠杆菌科、梭杆菌科丰富度显著高于对照组,而乳杆菌科、瘤胃菌科、毛螺菌科及普雷沃菌科丰富度显著低于对照组(均P0.05)。结论不同脑卒中风险及不同认知功能障碍中老年人肠道菌群存在显著差异。     

纯母乳喂养功能性便秘婴儿的肠道菌群与母乳菌群CSCD

目的利用高通量测序分析纯母乳喂养的功能性便秘(functional constipation,FC)婴儿的肠道菌群和母乳菌群特点,探讨两类菌群与该类婴儿FC发生发展的相关性。方法以6月龄以下纯母乳喂养的婴儿为研究对象,收集19例FC婴儿(病例组)与6例健康婴儿(对照组)的粪便样本及母乳样本,提取菌群的基因组DNA,扩增16S rRNA基因的V3-V4片段,通过Illumina MiSeq平台进行测序,并对测序结果进行生物信息学分析。结果6月龄以下纯母乳喂养的FC婴儿中,病例组肠道菌群的物种丰富度较对照组显著增加(t=2.279,P<0.05),母乳菌群的分布均匀度较对照组显著降低(t=2.874,P<0.05)。肠道菌群在属水平上,病例组放线菌属的丰度显著高于对照组(Z=2.673,P<0.05),而葡萄球菌属(Z=2.617,P<0.05)、罗斯菌属(Z=2.155,P<0.05)及梭菌属(Z=2.011,P<0.05)的丰度均显著低于对照组。母乳菌群在门水平上,病例组变形菌门的丰度显著低于对照组(Z=2.800,P<0.01),在属水平上,病例组的罗尔斯通菌属(Z=2.354,P<0.05)、罗伊杆菌属(Z=2.484,P<0.05)、不动杆菌属(Z=3.055,P<0.05)及伯克霍尔德菌属(Z=2.611,P<0.05)的丰度均显著低于对照组。随访病例组婴儿,大部分(13例/19例)患儿在6月龄~8月龄时排便频次增加至1~2次/d,且其身高体质量均位于中位数正负两个标准差之间。结论6月龄以下纯母乳喂养FC婴儿的肠道菌群及母乳菌群的物种多样性、组成及丰度与健康对照人群相比均存在显著差异。大部分纯母乳喂养的FC婴儿的便秘症状可自行缓解,临床应避免过度检查及干预。     

Presence and distribution of fungi and bacteria in the reproductive tract of healthy stallions

A saprophytic bacterial flora is present on the penis and the distal part of the urethra of stallions. Little is known about the fungal flora of their reproductive tract. As micro organisms play an important role in mares fertility, the aim of the study was to describe the distribution of fungi and bacteria in the normal genital apparatus of stallions. The microbic flora of the reproductive tract of 11 healthy, fertile stallions was evaluated, collecting samples from 5 different locations: urethral fossa, penis/internal lamina of the prepuce, urethra pre- and post-ejaculation, and semen. For fungal examination samples were taken on 3 different occasions (N = 165), while for bacteriologic examination samples were taken on one occasion only (N = 55). There was a statistical difference in the presence of filamentous fungi between urethral fossa or penis/prepuce (45.4%) and urethra pre- or postejaculation or semen (15.1%, 6.0%, and 0.0%, respectively). Yeasts were isolated in 9.1% of the samples, never in semen. The most represented mycelial fungi were Penicillium spp., Aspergillus spp., Scopulariopsis spp., Trichosporon spp. and Mucoracee. The proportion of samples showing a total bacterial count ≥10 000 colony forming units (CFU) was higher for urethral fossa than for urethra pre- or postejaculation or for semen. Some bacterial growth was always observed in all locations, including the ejaculate. Differences between sampling locations were observed also for Staphylococci, both coagulase positive and negative. Salmonella enterica Abortus equi and sulphite reducing clostridia and other pathogens (including Klebsiella spp. and Pseudomonas spp.) were never isolated. Escherichia coli and coliforms always showed a low or absent flora. These data add information to the literature.     

中国石炭纪和二叠纪植物群

本文总结了和讨论了中国石炭纪和二叠纪植物群分布特征,在对植物群成分分析的基础上,认为中国早石炭世（杜内期、维宪期和纳缪尔A期）分布一个全球一致性的植物群,即拟鳞木植物群Lepidodendropsis flora。中国的晚石炭世（纳缪尔B-C期、维期发期和斯蒂分期）和二叠纪植物群为华夏植物群。本文还对北方华夏植物群亚区和南方华夏植物群亚区植物群进行了对比,并论述了这两个植物群在组成成分上的差异。     

广东肇庆石灰岩植物区系的基本特征

肇庆石灰岩共有维管植物９１科２２６属３０３种。经过对种子植物、蕨类植物地理成分分析和与邻近植物区系比较,表明肇庆石灰岩植物区系服从植物地理分带规律,以热带－亚热带分布成分为主体,表现出明显的南亚热带南缘植物区系性质;同时显示出岩溶基质特点;与紧邻的土山植物区系具有完全迥异的表征科。区系区划上属于华南植物区,位于粤中亚区与粤西－桂中亚区的汇合点     

慢性湿疹患者皮损、鼻粘膜需氧微生物群的定位、定量研究

本文首次应用定位、定量方法对23例小腿部慢性湿疹患者皮损、邻近皮肤及鼻孔的菌群,从微生态学的角度进行探讨,并将结果同24例正常人小腿皮肤及鼻孔的菌群做了比较。其结果表明:金黄色葡萄球菌为皮损及邻近皮肤的主要菌种,并且其分离率及密度有按正常皮肤、邻近皮肤、皮损依次增高现象;类白喉杆菌的数量在皮损部位明显低于正常皮肤与邻近皮肤;表皮葡萄球菌分离率皮损及邻近皮肤均明显降低。本组结果同正常对照组相比其皮肤微生物群菌谱虽无不同,但其数量的变异是显著的,这对探讨湿疹的病因及用生态制剂等调整皮肤菌群使其恢复微生态平衡达到防治目的有所裨益。     

小肠内容物菌群及膜菌群的研究

作者借助小肠镜及结肠镜于正常国人空肠及回肠中取材,共检测了３０例的肠内容物菌群及膜菌群,对１０种有代表性的需氧及厌氧菌进行了定性及定量分析,并对各菌株均作了生化鉴定,其结果显示空肠梭菌、回肠梭菌、乳杆菌及双歧杆菌的肠内容物菌群与膜菌群有显著差异。３０例空肠内容及粘膜组织中均未培养出肠球菌。大肠杆菌在空肠的腔菌群及膜菌群有１６／３０,１０／３０例,类杆菌有１２／３０和１０／３０例生长,并讨论了上述结果的意义。     

Further connections between the benthic marine algal floras of the northern Arabian Sea and Japan

Identifications made on some recent collections of benthic marine algae from the Sultanate of Oman, northern Arabian Sea, have revealed several new records for this region. A total of eight species, representing five species of Rhodophyceae, two species of Phaeophyceae, and a single species each of Chlorophyceae, are newly reported for Oman. Of particular interest is the fact that these species represent new records for the Indian Ocean, some of which had previously been known from Japan and environs.     

口腔及肠道菌群与冠心病关系的研究进展

冠心病是由多种病理因素引起的复杂疾病,严重威胁人类健康,其机制尚未完全阐明。近年来,研究表明冠心病与口腔和肠道菌群密切相关。菌群失调导致的炎症反应、氧化应激反应、脂质代谢失调和氧化三甲胺累积是参与冠心病发生的主要风险因素。此外,口腔菌群与肠道菌群相关,参与冠心病的发生与发展。中医治疗疾病的优势在于辨证论治,而证型的判断缺乏客观标准。多项研究应用口腔菌群或肠道菌群分析了疾病的中医证型。本文系统地阐述了口腔菌群和肠道菌群在冠心病发病机制中的作用,阐述了不同中医证型冠心病菌群分析的研究进展,为临床开展此类研究提供参考。     

苗儿山植物区系的初步研究

<正> 苗儿山自然保护区是我国亚热带天然林保存较好、并有一定代表性的林区之一。它的植物区系成分复杂,植物种类繁多,古老孑遗植物丰富。研究其植物区系的组成和特点,对进一步研究广西乃至我国的植物区系,及开发利用保护区内的植物资源,使之更好为我国社会主义建设服务,均有一定的意义。     

Lignocellulose degradation by microorganisms from termite hills and termite guts: A survey on the present state of art

Abstract: In several aspects termites are a fascinating group of insects having attracted the interest of many researchers. They exhibit a complex social behavior and caste differentiation occurring elsewhere only among the hymenoptera. In an enlarged part of the hindgut, the paunch, termites have established a unique symbiotic association with prokaryotic and eukaryotic microorganisms. A similar flora is also found in wood-eating roaches of the genus Cryptocercus . The study of symbiosis between termites and their intestinal microbes is of general interest, because due to this symbiotic interaction termites can feed on complex biopolymers such as wood. Flagellates and bacteria occur in the gut of lower termites, while higher termites possess only bacteria. In particular spirochetes are abundant in the termite gut. Apart from spirochetes and other more common bacteria, actinomycetes, yeasts and fungi have also been isolated from different species of termites. This review summarizes the distinct role of the intestinal flora in degradation of wood components such as cellulose, hemicellulose and lignin.