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基于SSR标记的新疆野杏群体遗传多样性及遗传结构
引用本文:包文泉,乌云塔娜,王 淋,赵 罕,杜红岩.基于SSR标记的新疆野杏群体遗传多样性及遗传结构[J].西北植物学报,2016,36(9):1757-1763.
作者姓名:包文泉  乌云塔娜  王 淋  赵 罕  杜红岩
作者单位:(1 国家林业局泡桐研究开发中心,郑州450003;2 中国林业科学研究院经济林研究开发中心,郑州450003)
基金项目:国家十二五课题支撑(2013BAD14B02)
摘    要:利用27对SSR分子标记对新疆4个野杏群体遗传多样性和遗传结构进行分析,评价新疆野杏遗传多样性水平和分化程度,为新疆野杏合理保护与利用提供科学依据。结果显示:(1)27对SSR引物共检测到431个等位基因(Na),各位点平均等位基因数(Na)和多态性信息含量(PIC)分别为15.96和0.84;物种水平上Shannons信息指数(I)和期望杂合度(He)分别为2.21和0.78。(2)群体水平上等位基因数(Na)、有效等位基因(Ne)、Shannons信息指数(I)、期望杂合度(He)和观察杂合度(Ho)分别为10.98、5.85、1.92、0.79和0.55;其中新源县野杏群体遗传多样性最丰富,巩留县群体遗传多样性最低。(3)基于F统计量分析的遗传分化系数(Fst)为0.05,基因流(Nm)为5.26;分子方差分析显示新疆野杏群体大部分遗传变异来自群体内(95.4%),群体间的遗传变异仅占4.6%。(4)新疆野杏群体遗传距离为0.06~0.49,平均为0.24;遗传相似度为0.61~0.94,平均为0.80;遗传相似度的聚类分析和遗传距离的主坐标分析结果一致,均将供试4个群体划分为两组;Mantel检测显示,新疆野杏群体遗传距离与地理距离无显著相关(r=0.332,P=0.16)。研究表明,新疆野杏资源具有丰富的遗传多样性,群体遗传分化程度较低,群体间遗传距离较小,这与新疆野杏群体的大小和悠久的演化历史以及群体间频繁的基因交流相关。

关 键 词:野杏  SSR  遗传多样性  遗传结构

Genetic Diversity and Population Structure of Wild Apricot in Xinjiang Revealed by SSR Markers
BAO Wenquan,WUYUN Tan,WANG Lin,ZHAO Han,DU Hongyan.Genetic Diversity and Population Structure of Wild Apricot in Xinjiang Revealed by SSR Markers[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2016,36(9):1757-1763.
Authors:BAO Wenquan  WUYUN Tan  WANG Lin  ZHAO Han  DU Hongyan
Abstract:
Keywords:wild apricot  SSR  genetic diversity  genetic structure
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