| 金霉素生物合成基因簇中调控基因ctcB的功能 |
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| 引用本文： | 刘佳,朱涛,王鹏飞,孔令新,王松梅,刘运添,谢昌贤,邓子新,由德林. 金霉素生物合成基因簇中调控基因ctcB的功能[J]. 微生物学报, 2016, 56(9): 1486-1495 |
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| 作者姓名： | 刘佳 朱涛 王鹏飞 孔令新 王松梅 刘运添 谢昌贤 邓子新 由德林 |
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| 作者单位： | 上海交通大学生命科学技术学院, 微生物代谢国家重点实验室, 上海 200240,上海交通大学生命科学技术学院, 微生物代谢国家重点实验室, 上海 200240,金河生物科技股份有限公司, 内蒙古 呼和浩特 010200,上海交通大学生命科学技术学院, 微生物代谢国家重点实验室, 上海 200240,上海交通大学生命科学技术学院, 微生物代谢国家重点实验室, 上海 200240,金河生物科技股份有限公司, 内蒙古 呼和浩特 010200,金河生物科技股份有限公司, 内蒙古 呼和浩特 010200,上海交通大学生命科学技术学院, 微生物代谢国家重点实验室, 上海 200240,上海交通大学生命科学技术学院, 微生物代谢国家重点实验室, 上海 200240;金河生物科技股份有限公司, 内蒙古 呼和浩特 010200 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31470183，31400029）；国家“973计划”（2012CB721004） |
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| 摘 要： | 【目的】研究金霉素产生菌中SARP家族转录调控基因ctc B的作用。【方法】利用大肠杆菌、链霉菌的属间接合转移和同源重组双交换的方法,构建ctc B基因缺失突变株。通过c DNA在相邻同转录方向的基因间隔进行PCR验证,确定金霉素生物合成基因簇中的转录单元。利用荧光定量RT-PCR方法进行突变株金霉素生物合成基因簇的转录水平检测。随后,生物信息学预测分析了金霉素生物合成基因簇内Ctc B与DNA的结合位点。【结果】获得了ctc B基因缺失的双交换突变株。发酵结果显示,该突变株失去产生金霉素与四环素的能力。金霉素生物合成基因簇内有6个共转录单元,其中4个共转录单元在ctc B基因缺失突变株中转录水平明显下降。软件分析预测到一致性较高的Ctc B结合重复序列。【结论】ctc B正调控金霉素生物合成结构基因ctc G-D、ctc H-K、ctc N-P、ctc W-T 4个转录单元和ctc Q,为进一步研究ctc B调控机制奠定了基础。
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| 关 键 词： | 金霉素 SARP家族转录调控基因 基因敲除 生物合成 |
| 收稿时间： | 2015-12-14 |
| 修稿时间： | 2016-01-13 |
Function of Streptomyces antibiotic regulatory proteins family transcriptional regulator ctcB in the biosynthetic cluster of chlortetracycline |
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| Jia Liu,Tao Zhu,Pengfei Wang,Lingxin Kong,Songmei Wang,Yuntian Liu,Changxian Xie,Zixin Deng and Delin You. Function of Streptomyces antibiotic regulatory proteins family transcriptional regulator ctcB in the biosynthetic cluster of chlortetracycline[J]. Acta microbiologica Sinica, 2016, 56(9): 1486-1495 |
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| Authors: | Jia Liu Tao Zhu Pengfei Wang Lingxin Kong Songmei Wang Yuntian Liu Changxian Xie Zixin Deng Delin You |
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| Affiliation: | State Key Laboratory of Microbial Metabolism, School of Life Sciences & Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China,State Key Laboratory of Microbial Metabolism, School of Life Sciences & Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China,Jinhe Biotechnology Co., Ltd., Hohhot 010200, Inner Mongolia Autonomous Region, China,State Key Laboratory of Microbial Metabolism, School of Life Sciences & Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China,State Key Laboratory of Microbial Metabolism, School of Life Sciences & Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China,Jinhe Biotechnology Co., Ltd., Hohhot 010200, Inner Mongolia Autonomous Region, China,Jinhe Biotechnology Co., Ltd., Hohhot 010200, Inner Mongolia Autonomous Region, China,State Key Laboratory of Microbial Metabolism, School of Life Sciences & Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China and State Key Laboratory of Microbial Metabolism, School of Life Sciences & Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China;Jinhe Biotechnology Co., Ltd., Hohhot 010200, Inner Mongolia Autonomous Region, China |
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