| 应用iTRAQ定量蛋白质组学研究海分枝杆菌mkl的基因功能 |
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| 引用本文： | 施旭骏,赵超,牛辰,高谦. 应用iTRAQ定量蛋白质组学研究海分枝杆菌mkl的基因功能[J]. 微生物学报, 2016, 56(9): 1496-1503 |
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| 作者姓名： | 施旭骏 赵超 牛辰 高谦 |
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| 作者单位： | 复旦大学基础医学院, 教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室, 上海 200032,复旦大学基础医学院, 教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室, 上海 200032,复旦大学基础医学院, 教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室, 上海 200032,复旦大学基础医学院, 教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室, 上海 200032 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（81271790，81201256） |
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| 摘 要： | 【目的】通过分离海分枝杆菌野生株和mkl突变株的全菌蛋白,并进行差异蛋白质组分析,以期为探索分枝杆菌重要毒力基因mkl的功能提供新思路。【方法】以海分枝杆菌野生株和mkl突变株为研究材料,提取全菌蛋白,i TRAQ试剂标记后进行质谱鉴定和定量分析,并利用Uni Prot数据库对差异蛋白进行生物信息学分析。【结果】共鉴定出在野生株和mkl突变株中差异表达蛋白566个,其中在突变株中上调表达蛋白232个(比值≥1.4),下调表达蛋白334个(比值≤0.7)。生物信息学预测这些蛋白主要参与细菌脂质代谢、细胞壁和细胞进程、中间代谢、呼吸作用等生物学功能。其中Des A3下调最显著,其功能为脂肪酸去饱和酶,与油酸合成相关,进一步验证发现mkl突变株在不含油酸的固体培养基中生长受限,提示mkl可能在油酸的生物合成通路中发挥功能。【结论】通过i TRAQ分析了海分枝杆菌mkl突变株和野生株的差异表达蛋白谱,发现可能影响分枝杆菌油酸、脂质等合成代谢通路,为进一步研究mkl基因在分枝杆菌致病中发挥作用的相关机制奠定了基础。
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| 关 键 词： | 分枝杆菌 定量蛋白质组学 iTRAQ mkl基因 |
| 收稿时间： | 2015-12-14 |
| 修稿时间： | 2016-01-17 |
Quantitative proteomic analysis of mkl gene function in Mycobacterium marinum using iTRAQ |
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| Xujun Shi,Chao Zhao,Chen Niu and Qian Gao. Quantitative proteomic analysis of mkl gene function in Mycobacterium marinum using iTRAQ[J]. Acta microbiologica Sinica, 2016, 56(9): 1496-1503 |
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| Authors: | Xujun Shi Chao Zhao Chen Niu Qian Gao |
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| Affiliation: | MOE & MOH Key Laboratory of Medical Molecular Virology, School of Basic Medical Sciences, Fudan University, Shanghai 200032, China,MOE & MOH Key Laboratory of Medical Molecular Virology, School of Basic Medical Sciences, Fudan University, Shanghai 200032, China,MOE & MOH Key Laboratory of Medical Molecular Virology, School of Basic Medical Sciences, Fudan University, Shanghai 200032, China and MOE & MOH Key Laboratory of Medical Molecular Virology, School of Basic Medical Sciences, Fudan University, Shanghai 200032, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Mycobacterium quantitative proteomics iTRAQ mkl gene |
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