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利用杉木的F1代群体构建遗传连锁图谱
引用本文:童春发,施季森. 利用杉木的F1代群体构建遗传连锁图谱[J]. 遗传学报, 2004, 31(10): 1149-1156
作者姓名:童春发  施季森
作者单位:南京林业大学林木遗传和基因工程实验室,南京,210037
基金项目:国家重点基础研究规划“973”项目 (编号 :TG19990 160 0 4),江苏省基础研究计划项目 (编号 :BK2 0 0 3 0 98)资助~~
摘    要:对于杉木 1∶1分离的分子标记位点 ,提出了一种新的构建遗传连锁图谱的策略。通过二点连锁分析 ,任意两个位点的连锁相和重组率可以得到推断和估计。对于一个连锁群中的最优排序 ,采用隐马尔可夫链模型的方法进行多位点的连锁分析。该作图方法比通常林木上所用的“拟测交”作图方法更有效。采用该作图策略 ,利用句容0号无性系 (♀ )×柔叶杉 (♂ )的F1代群体的AFLP分子标记数据重建了句容 0号无性系和柔叶杉的遗传连锁图谱。在句容 0号无性系的连锁图谱中 ,有 10 1个标记分布在 11个连锁群上 ,图谱的总长度为 2 2 82 6cM ,平均图距为 2 2 6cM ,单个连锁群上最多含有 17个标记 ,最少含有 5个标记 ;在柔叶杉的连锁图谱中 ,有 94个标记分布在 11个连锁群上 ,图谱的总长度为 2 5 6 5 8cM ,平均图距为 2 7 3cM ,单个连锁群上最多含有 16个标记 ,最少含有 4个标记。构建的句容 0号无性系和柔叶杉的遗传连锁图谱比原有的图谱分别增加了 2 6个标记和 2 8个标记 ,双亲的图谱共增加了 5 4个AFLP标记 ,使图谱上的分子标记总数达到 195个 ,双亲遗传图谱的跨度均超过了 2 0 0 0cM ,基本上达到了杉木基因组的长度 ,图谱的覆盖率接近于 10 0 %。利用新的作图方法可以较大提高分子标记在图谱上的分辨率 ,得到可认为是

关 键 词:杉木 遗传连锁图谱 F1代群体 连锁相 隐马尔可夫链模型

Constructing Genetic Linkage Maps in Chinese Fir Using F1 Progeny
Abstract:
Keywords:Chinese fir  genetic linkage maps  F_1 progeny  linkage phase  hidden Markov chain model
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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