| 小鼠耳芥PEBP基因家族全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 李永光,金玉环,郭力,艾昊,李瑞宁,黄先忠.小鼠耳芥PEBP基因家族全基因组鉴定及表达分析[J].遗传,2022(1):80-94. |
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| 作者姓名： | 李永光 金玉环 郭力 艾昊 李瑞宁 黄先忠 |
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| 作者单位： | 石河子大学生命科学学院;安徽科技学院农学院;石河子大学生命科学学院植物基因组学实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(编号:U1303302);石河子大学国际科技合作项目(编号:GJHZ201806);安徽科技学院学科带头人引进人才启动经费项目(编号:NXYJ202001)资助。 |
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| 摘 要： | PEBP (phosphatidylethanolamine-binding protein)家族包含保守的磷脂酰乙醇胺结合蛋白结构域，其中FT和TFL1蛋白构成植物成花素–反成花素系统调控植物的开花时间和株型结构被广泛关注。小鼠耳芥(Arabidopsis pumila)是早春短命植物，生长在古尔班通古特沙漠南缘荒漠地带，对环境具有较好的适应性。本研究对小鼠耳芥PEBP基因家族进行全基因组鉴定，发现其基因组包含11个PEBP基因(1个MFT、2个FT、2个TSF、2个TFL1、2个CEN和2个BFT)，均由4个外显子与3个内含子组成。共线性分析表明，小鼠耳芥与拟南芥(A. thaliana)、琴叶拟南芥(A. lyrata) PEBP基因间存在11对共线性关系，PEBP家族在小鼠耳芥基因组中发生了明显的扩张，并且ApPEBP基因复制类型为全基因组复制/片段复制。组织表达分析发现ApMFT在种子中高表达，ApFT和ApBFT主要在花和果荚中表达，ApTFL1在茎尖中高表达，但ApCEN在根中高表达。进一步分析了6个ApPEBP基因在4种非生物胁迫下的表达特征，发现在10%PEG6000...
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| 关 键 词： | 短命植物 小鼠耳芥 开花转变 PEBP 逆境 |
Genome-wide identification and expression analysis of the PEBP genes in Arabidopsis pumila |
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| Li Yongguang,Jin Yuhuan,Guo Li,Ai Hao,Li Ruining,Huang Xianzhong.Genome-wide identification and expression analysis of the PEBP genes in Arabidopsis pumila[J].Hereditas,2022(1):80-94. |
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| Authors: | Li Yongguang Jin Yuhuan Guo Li Ai Hao Li Ruining Huang Xianzhong |
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| Institution: | (College of Life Sciences,Shihezi University,Shihezi 832003,China;College of Agriculture,Anhui Science and Technology University,Fengyang 233100,China;Plant Genomics Laboratory,College of Life Sciences,Shihezi University,Shihezi 832003,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | ephemeral plant Arabidopsis pumila flowering transition PEBP adversity |
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