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粪便样本不同保存方式对肠道菌群测序结果的影响
引用本文:范馨月,陈璐萍,朱金滔,律娜,朱宝利. 粪便样本不同保存方式对肠道菌群测序结果的影响[J]. 微生物学报, 2022, 62(2): 520-532
作者姓名:范馨月  陈璐萍  朱金滔  律娜  朱宝利
作者单位:中国科学院微生物研究所, 中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室, 北京 100101;中国科学院大学存济医学院, 北京 100049;中国科学院微生物研究所, 中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室, 北京 100101;中国科学院大学存济医学院, 北京 100049;病原微生物耐药与耐药基因组学北京市重点实验室, 北京 100101;西南医科大学基础医学院, 四川 泸州 646000
基金项目:国家重点研发计划(2018YFC1603803,2018YFC2000505);国家自然科学基金(81991534)
摘    要:[目的]本文探究了3种室温保存剂和-80℃C冷冻保存对粪便样本中菌群结构的影响,为大规模、标准化的采样提供参考.[方法]本研究采集了5名健康志愿者的新鲜粪便作为测试样本,采用4种不同的保存方式保存:DETs室温保存、GITC室温保存、RNAlater室温保存和-80℃冷冻保存,在保存0、1、3、7、14、28 d后,采...

关 键 词:粪便样本  室温保存  肠道菌群  保存剂  高通量测序
收稿时间:2021-06-02
修稿时间:2021-08-23

Effects of different preservation methods for fecal samples on the sequencing results of gut microbiota
FAN Xinyue,CHEN Luping,ZHU Jintao,LYU N,ZHU Baoli. Effects of different preservation methods for fecal samples on the sequencing results of gut microbiota[J]. Acta microbiologica Sinica, 2022, 62(2): 520-532
Authors:FAN Xinyue  CHEN Luping  ZHU Jintao  LYU N  ZHU Baoli
Affiliation:CAS Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Immunology, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China; CAS Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Immunology, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;Beijing Key Laboratory of Antimicrobial Resistance and Pathogen Genomics, Beijing 100101, China;School of Basic Medical Sciences, Southwest Medical University, Luzhou 646000, Sichuan, China
Abstract:
Keywords:fecal sample  room-temperature preservation  gut microbiota  stabilizer  high-throughput sequencing
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