| 肠球菌CRISPR-Cas系统基因结构的分析及其与耐药基因的关系 |
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| 引用本文： | 兰蕾,郑旭,迟媛媛,王雪婷,王梦园,朱元祺,闫志勇. 肠球菌CRISPR-Cas系统基因结构的分析及其与耐药基因的关系[J]. 微生物学杂志, 2022, 0(2): 58-64 |
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| 作者姓名： | 兰蕾 郑旭 迟媛媛 王雪婷 王梦园 朱元祺 闫志勇 |
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| 作者单位： | 青岛大学 医学部，山东 青岛 266071;青岛大学 附属青岛市立医院，山东 青岛 266001;青岛大学 附属青岛妇女儿童医院，山东 青岛 266034;青岛大学 附属医院，山东 青岛 266071 |
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| 基金项目： | 山东省优秀中青年科学家科研奖励项目（BS2011SW0005） |
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| 摘 要： | CRISPR-Cas系统是一种细菌的适应性免疫系统，参与特异性防御不同类型的可移动遗传元件，如质粒、噬菌体、转座子等的入侵。旨在分析肠球菌（Enterococcus）基因组中该系统的基因结构，并探讨其与细菌耐药基因之间的关系。NCBI数据库中下载10种肠球菌的全基因组信息，利用软件对CRISPR-Cas系统的分布、cas1基因、重复序列、间隔序列等进行比对分析；查找耐药相关基因，分析其与CRISPR-Cas系统之间的关系。235株肠球菌中含完整CRISPR-cas系统的有35株（14.9%），含确定CRISPR阵列196个和cas基因簇46个。肠球菌基因组中CRISPR系统主要为II-A型（80.4%），其次是II-C型（15.2%），cas1基因序列的系统发育分析结果与CRISPR-cas系统的分型基本一致。肠球菌CRISPR-Cas系统的分布在不同菌种之间差异较大；CRISPR-Cas系统可能阻碍肠球菌某些耐药基因的水平转移。
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| 关 键 词： | 肠球菌属；基因结构；CRISPR-Cas系统；耐药基因；免疫防御 |
Analysis of Genetic Structure of Enterococcus CRISPR-Cas System and Its Relationship with Drug Resistance Gene |
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| LAN Lei,ZHENG Xu,CHI Yuan-yuan,WANG Xue-ting,WANG Meng-yuan,ZHU Yuan-qi,YAN Zhi-yong. Analysis of Genetic Structure of Enterococcus CRISPR-Cas System and Its Relationship with Drug Resistance Gene[J]. Journal of Microbiology, 2022, 0(2): 58-64 |
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| Authors: | LAN Lei ZHENG Xu CHI Yuan-yuan WANG Xue-ting WANG Meng-yuan ZHU Yuan-qi YAN Zhi-yong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Enterococcus gene structure CRISPR-Cas system drug resistance gene immune defense |
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