| 辣椒脉斑驳病毒文昌分离物基因组测序及分析 |
| |
| 引用本文： | 龚殿,王健华,吴育鹏,张雨良,王洪星,孙玉娟,刘志昕.辣椒脉斑驳病毒文昌分离物基因组测序及分析[J].基因组学与应用生物学,2011,30(5). |
| |
| 作者姓名： | 龚殿 王健华 吴育鹏 张雨良 王洪星 孙玉娟 刘志昕 |
| |
| 作者单位： | 1. 海南大学环境与植物保护学院,海口,570228;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海口,571101
2. 中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海口,571101 |
| |
| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务专项，海南大学"211工程"建设项目 |
| |
| 摘 要： | 辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV)近年来严重危害海南黄灯笼辣椒的产量,开展针对该病毒的研究以求达到对其有效防控迫在眉睫.本研究分7段克隆了ChiVMV文昌分离物(ChiVMV Wenchang isolate,ChiVMV-WC)的基因组.分段克隆的测序结果通过拼接,共获得ChiVMV-WC基因组9 717个核苷酸(nt)序列(GenBank登录号:GQ981316).在核苷酸序列的第164位~第9 270位存在一个大的开放阅读框(ORF),编码一个多聚蛋白(分子量为350.44 kD).近年来被证实的马铃薯Y病毒科的一个新的ORF (pretty interesting potyviridae ORF,PIPO)存在于ChiVMV-WC基因组核苷酸序列的第2 892位~第3 110位,编码一个由72个氨基酸聚合而成的多肽(分子量为8.26 kD).ChiVMV-WC与ChiVMV其它分离物的基因组核苷酸序列比较发现该病毒存在着较高的变异率.本研究通过与同属内病毒的同源性分析以及系统进化树分析,确定了ChiVMV-WC在生物进化史上的地位.
|
| 关 键 词： | 辣椒脉斑驳病毒 马铃薯Y病毒属 基因组 系统进化树 黄灯笼 |
The Sequencing and Analysis of the Genome of ChiVMV Wenchang Isolate (ChiVMV-WC) |
| |
| Gong Dian,Wang Jianhua,Wu Yupeng,Zhang Yuliang,Wang Hongxing,Sun Yujuan,Liu Zhixin.The Sequencing and Analysis of the Genome of ChiVMV Wenchang Isolate (ChiVMV-WC)[J].Genomics and Applied Biology,2011,30(5). |
| |
| Authors: | Gong Dian Wang Jianhua Wu Yupeng Zhang Yuliang Wang Hongxing Sun Yujuan Liu Zhixin |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
