黄瓜IQD/SUN基因家族全基因组鉴定及分析 |
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作者姓名: | 葛倩 王祥飞 李豪 任仲海 王丽娜 |
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作者单位: | 山东农业大学园艺科学与工程学院,泰安,271018;山东农业大学园艺科学与工程学院,泰安,271018;山东农业大学园艺科学与工程学院,泰安,271018;山东农业大学园艺科学与工程学院,泰安,271018;山东农业大学园艺科学与工程学院,泰安,271018 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;国家自然科学基金;山东省农业良种工程项目;山东省重点研发计划;山东省双一流专项建设基金项目 |
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摘 要: | 黄瓜果型是非常重要的外观商品性状,CsSUN是调控黄瓜果型的关键基因。为了明确SUN基因家族在黄瓜中的潜在功能,本研究对其成员进行了全基因组鉴定,分析了黄瓜SUN基因家族成员及其编码蛋白的结构,比较了黄瓜、拟南芥和番茄SUN基因家族的进化关系,并明确了黄瓜SUN基因家族在染色体上的分布和组织表达特异性。结果表明:黄瓜SUN基因家族包含28个成员,编码的蛋白均含有IQD结构域,其核心基序为IQ基序(IQxxxRGxxxR)。黄瓜SUN基因家族成员在果实和根中表达的数量较多,在茎和卷须中表达的较少。本研究为深入研究SUN基因家族各成员在黄瓜中的作用提供了一定的理论依据。
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关 键 词: | 黄瓜 SUN 生物信息学 基因表达 |
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