| 盘基网柄菌早衰蛋白结构与功能生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 薛楠,郭倩楠,刘坚,徐存拴,薛德明.盘基网柄菌早衰蛋白结构与功能生物信息学分析[J].基因组学与应用生物学,2019,38(6):2567-2573. |
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| 作者姓名： | 薛楠 郭倩楠 刘坚 徐存拴 薛德明 |
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| 作者单位： | 河南师范大学附属中学,新乡,453007;河南师范大学生命科学学院,新乡,453007;河南师范大学生命科学学院,新乡,453007;贝勒医学院分子细胞生物系,休斯顿,77030;河南师范大学生命科学学院,新乡,453007;河南赛诺特生物技术有限公司,郑州,450001 |
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| 基金项目： | 河南省国际科技合作项目;河南省基础与前沿技术研究计划 |
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| 摘 要： | 早衰蛋白(presenilin, PS)是γ分泌酶的组成成分,其突变可造成阿尔兹海默病(Alzheimer disease,AD)的形成。因PS所造成AD的发病机理较复杂,因而我们想探究一下模式生物盘基网柄菌(Dictyostelium discoideum)是否能够作为研究早衰蛋白的模型。从NCBI网站中得到盘基网柄菌早衰蛋白DdPsenA和DdPsenB氨基酸序列,随后利用ProtScale、ProtParam理化性分析工具、保守结构域、TMHMM2跨膜区分析网站、进化树软件MEGA6.0、二级结构PredictProtein以及三级结构SWISS-Model服务器对上述蛋白进行生物信息学分析。DdPsenA的氨基酸长度为622,是亲水性蛋白,其相对分子质量为69 502.79,等电点为4.53。DdPsenB的氨基酸长度为473,属于疏水性蛋白,其相对分子质量为52 558.74,等电点为4.49,与DdPsenA同属于Peptidase_A22B超家族。跨膜分析出DdPsenA和DdPsenB均有8个跨膜区。DdPsenA与人类presenilin-2序列相似性为67%,Dd PsenB与人类presenilin-1序列相似性分别为60%。盘基网柄菌可以作为研究早衰蛋白功能和作用机制的模型。
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| 关 键 词： | 早衰蛋白 盘基网柄菌 生物信息学分析 |
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