| 基于蛋白互作网络识别非小细胞肺癌相关基因功能模块 |
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| 引用本文： | 李晴晴,王化琨,方羽艺,周影.基于蛋白互作网络识别非小细胞肺癌相关基因功能模块[J].基因组学与应用生物学,2019(7):3280-3285. |
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| 作者姓名： | 李晴晴 王化琨 方羽艺 周影 |
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| 作者单位： | 黑龙江大学数学科学学院 |
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| 基金项目： | 黑龙江省教育厅科学技术研究项目(12531496)资助 |
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| 摘 要： | 本研究对非小细胞肺癌(non-small cell lung carcinoma,NSCLC)基因表达数据进行差异表达分析,并与蛋白质相互作用网络(PPIN)数据进行整合,进一步利用Heinz搜索算法识别NSCLC相关的基因功能模块,并对模块中的基因进行功能(GO term)和通路(KEGG)富集分析,旨在探究肺癌发病分子机制。蛋白互作网络分析得到一个包含96个基因和117个相互作用的功能模块,以及8个对NSCLC的发生和发展起到关键作用候选基因标志物。富集分析结果表明,这些基因主要富集于基因转录催化及染色质调控等生物学过程,并在基础转录因子、黏着连接、细胞周期、Wnt信号通路及HTLV-Ⅰ感染等生物学通路中发挥重要作用。本研究对非小细胞肺癌相关的基因和生物学通路进行预测,可用于肺癌的早期诊断和早期治疗,以降低肺癌死亡率。
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| 关 键 词： | 非小细胞肺癌 蛋白互作网络 差异表达分析 Heinz算法 |
Identification of Non-small Cell Lung Cancer-related Gene Functional Module Based on Protein Interaction Network |
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| Li Qingqing,Wang Huakun,Fang Yuyi,Zhou Ying.Identification of Non-small Cell Lung Cancer-related Gene Functional Module Based on Protein Interaction Network[J].Genomics and Applied Biology,2019(7):3280-3285. |
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| Authors: | Li Qingqing Wang Huakun Fang Yuyi Zhou Ying |
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| Institution: | (College of Mathematical Sciences,Heilongjiang University,Harbin,150080) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Non-small-cell lung carcinoma Protein interaction network Differential expression analysis Heinz algorithm |
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