| 体外装配核小体过程组蛋白浓度依赖的动力学模型 |
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| 引用本文： | 张凤慧,郭明欣,赵宏宇,蔡禄.体外装配核小体过程组蛋白浓度依赖的动力学模型[J].基因组学与应用生物学,2019,38(7):2996-3001. |
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| 作者姓名： | 张凤慧 郭明欣 赵宏宇 蔡禄 |
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| 作者单位： | 内蒙古科技大学生命科学与技术学院,包头,014010;内蒙古科技大学生命科学与技术学院,包头,014010;内蒙古科技大学生命科学与技术学院,包头,014010;内蒙古科技大学生命科学与技术学院,包头,014010 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金;内蒙古自治区自然科学基金 |
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| 摘 要： | 为探索组蛋白浓度对核小体体外装配的影响,本研究表达纯化了4种组蛋白,通过控制实验反应体系中组蛋白的浓度,利用盐透析法在体外装配了核小体,检测分析了组蛋白浓度与核小体组装效率的关系。以此实验数据为基础,提出了核小体组装过程组蛋白浓度依赖性的动力学模型。实验结果发现,反应体系中组蛋白浓度与核小体生成量呈典型的线性关系。依据动力学理论模型,进行线性回归拟合,回归系数达到0.963;经计算601 DNA序列组装核小体的反应速率常数k为1.49×10^-5mL·h·μg^-1。CS1序列验证动力学模型的线性回归相关系数为0.989,反应速率常数为1.52×10^-5mL·h·μg^-1。该实验方法及动力学模型中反应速率常数k可用于评价相同长度的DNA序列组装核小体的能力、组蛋白与其突变体以及组蛋白变体之间形成核小体结构能力的差异。该动力学模型的建立为理解核小体装配、核小体定位、染色质结构等相关问题提供了理论指导。
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| 关 键 词： | 组蛋白 核小体装配 染色质结构 |
Dynamic Model of Histone-dependent Nucleosome Assembly in vitro |
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| Zhang Fenghui,Guo Mingxin,Zhao Hongyu,Cai Lu.Dynamic Model of Histone-dependent Nucleosome Assembly in vitro[J].Genomics and Applied Biology,2019,38(7):2996-3001. |
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| Authors: | Zhang Fenghui Guo Mingxin Zhao Hongyu Cai Lu |
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| Institution: | (School of Life Science and Technology,Inner Mongolia University of Science and Technology,Baotou,014010) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Histone Nucleosome assembly Chromatin structure |
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