| 普通菜豆镰孢菌枯萎病抗性种质资源筛选及全基因组关联分析 |
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| 引用本文： | 李园,常玉洁,王兰芬,王述民,武晶.普通菜豆镰孢菌枯萎病抗性种质资源筛选及全基因组关联分析[J].植物学报,2023,58(1):51-61. |
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| 作者姓名： | 李园 常玉洁 王兰芬 王述民 武晶 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院作物科学研究所, 北京 100081 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划(2020YFD1000800);国家重点研发计划(2020YFD1000802-01);国家食用豆产业技术体系(CARS-08) |
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| 摘 要： | 普通菜豆镰孢菌枯萎病是严重制约菜豆(Phaseolus vulgaris)产量的主要病害之一。采用下胚轴双孔注射法对601份普通菜豆种质资源进行枯萎病抗性鉴定, 共筛选出4份高抗材料。在此基础上, 基于分布在全基因组上的3 765 456个单核苷酸多态性(SNP)标记, 进行全基因组关联分析, 以P<1×10-5为阈值。结果检测到57个显著关联的SNP位点, 分布于1、2、6、8和11号染色体上; 共获得8个显著关联区域, 其中位于1号染色体上的区域1包含SNP最多(48个), 最显著SNP P值为2.18E-07。在8个显著关联区域中, 共检测到186个基因, 其中157个基因有注释信息, 编码过氧化物酶、抗病蛋白、转录因子和蛋白激酶等。结合KEGG富集分析和序列同源性比对, 鉴定出9个候选基因可能与抗性相关。
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| 关 键 词： | 普通菜豆 镰孢菌枯萎病 全基因组关联分析 抗性基因/种质资源 |
| 收稿时间： | 2022-07-12 |
Screening of Resistance Germplasm Resources and Genome-wide Association Study of Fusarium Wilt in Common Bean |
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| Yuan Li,Yujie Chang,Lanfen Wang,Shumin Wang,Jing Wu.Screening of Resistance Germplasm Resources and Genome-wide Association Study of Fusarium Wilt in Common Bean[J].Bulletin of Botany,2023,58(1):51-61. |
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| Authors: | Yuan Li Yujie Chang Lanfen Wang Shumin Wang Jing Wu |
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| Institution: | Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | common bean fusarium wilt genome-wide association study resistance gene/germplasm resources |
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